陈驰
- 作品数：15 被引量：22H指数：3
- 供职机构：中国食品药品检定研究院更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家科技基础条件平台建设计划艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学轻工技术与工程更多>>
- 金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用国家参考品的研制被引量：2
- 2021年
- 目的研制金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用国家参考品。方法将10株金黄色葡萄球菌和10株阴性对照代表性菌株分别在适宜条件下复苏培养,制备合适浓度的菌悬液,并加热灭活和分装。随机抽样不同候选参考品样品10支进行均匀性分析,并将样品分别置于2~8、25、37℃条件下保藏以及反复冻融,评价标准物质的稳定性。同时对候选参考品的准确性、特异性、重复性、最低检出限进行分析,并组织8家实验室进行协作标定。结果制备了由阳性、阴性、重复性和最低检出限样品组成的金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用候选参考品。不同候选参考品不同样品间的Ct值的变异系数在1.23%~3.86%之间,表明制备候选参考品均匀性良好。同时证实P1~10阳性和最低检出限候选参考品样品在反复冻融及加速破坏条件下稳定性良好。应用3个不同厂家生产试剂盒进行重复性验证实验显示,样本的Ct值均小于5.0%,表明候选参考品的重复性良好。除P6阳性候选参考品样品不能被部分试剂盒检出,其余阳性参考品样品均能成功检测、最低检出限为1.0×10^(3)个/m L。协作标定结果进一步表明阳性、阴性、重复性和最低检出限候选参考品均符合国家参考品的各项要求。结论研制的金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用国家参考品已获得批准,可用于金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒的质量控制和评价。
- 陈驰梁丽王春娥石继春龙新星刘茹凤黄洋李康徐潇李江姣徐颖华叶强
- 关键词：金黄色葡萄球菌核酸国家参考品均匀性稳定性
- 不同来源金黄色葡萄球菌的全基因组序列分析被引量：1
- 2022年
- 目的了解不同来源金黄色葡萄球菌(简称金葡菌)的全基因组序列基本特征,探究菌株的分子分型、耐药基因型、毒力及其遗传进化关系。方法应用solexa高通量测序技术对10株医源性和食源性代表株金葡菌进行全基因组测序,以此进行多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、金葡菌a蛋白(Staphylococcus aureus protein A,spa)基因分型分析,并比较分析不同菌株基因组中携带耐药基因和毒力因子,筛选核心基因,构建系统进化树。结果10株金葡菌染色体基因组大小相似,均为2.7Mbp,包含有2486~2648个基因不等,平均长度约为887bp。耐药基因注释分析显示9株甲氧西林敏感金葡菌(MSSA)携带的耐药基因少于另一株耐甲氧西林金葡菌(MRSA)。尽管在不同菌株基因组之间的毒力因子数量无显著区别,但不同菌株存在的毒力因子却不同,食品来源金葡菌基因组携带1~4种数量不等的肠毒素基因。进化树分析显示不同来源金葡菌位于不同进化分支,2株为ST8型的MSSA和MRSA进化亲缘性较高,属于同一进化分支内。结论获得10株不同来源金葡菌的全基因组序列数据,并证实食源性或医院来源金葡菌为了适应不同生存环境,通过不同分子进化机制,获得不同耐药基因和毒力因子,形成菌株特定的分子遗传特征,可为金葡菌的分子流行病学和致病性机制研究提供参考依据。
- 陈驰石继春王春娥梁丽龙新星叶强徐颖华
- 关键词：金黄色葡萄球菌全基因组测序毒力因子耐药基因
- 不同来源屎肠球菌的全基因组序列分析
- 2022年
- 目的 了解不同分离来源的屎肠球菌(Enterococcus faecium)标准菌株的全基因组特征。方法 采用高通量测序技术对中国医学细菌保藏管理中心保藏的分离于食品和临床患者的6株屎肠球菌标准菌株进行全基因组测序,采用velvet 1.2.03和glimmer 3.02等生物信息学软件对测序数据进行基因组装、基因预测及功能注释,分析基因组中所含耐药基因和毒力基因;并与已发表的6株临床分离的代表性屎肠球菌进行核心基因组和泛基因组比较分析,构建系统发育分子进化树。结果 6株屎肠球菌标准菌株的基因组序列大小约为2.9Mbp,不同菌株基因组中共鉴定出2669~3085个基因,平均G+C含量为38.0%;基因组耐药基因注释分析发现,每株屎肠球菌含有21~37种数量不等的耐药基因,食品来源菌株所携带耐药基因明显少于临床分离株(P=0.009)。而不同来源菌株之间所含毒力基因数量无显著性差异,含有5~8种数量不等的毒力基因,其中参与生物膜形成的基因BopD和胆盐水解酶基因bsh存在于所有菌株中。比较基因组学分析结果显示,随着屎肠球菌基因组测序数量的增加,泛基因组所含基因数量随之增加,而核心基因组则趋于稳定。全基因组的系统发育树进化分析结果显示, 12株屎肠球菌被分成3个进化分支,其中5株食品来源的菌株均分布在同一个进化分支。结论 本研究获得6株屎肠球菌标准菌株的全基因组序列,证实食品来源菌株均携带一定数量的耐药基因和毒力基因,提示应加强食源性菌株的安全监测。本研究结果可为后续屎肠球菌耐药机制、致病性等研究提供数据支持。
- 王春娥石继春徐潇李康梁丽陈驰龙新星叶强徐颖华
- 关键词：屎肠球菌全基因组序列分析
- A族链球菌核酸检测试剂国家参考品的研制被引量：2
- 2021年
- 目的研制A族链球菌核酸检测试剂国家参考品。方法将10株A族链球菌株和10株非A族链球菌参考菌株分别在各自适宜的培养基和温度下培养,收获新鲜培养物进行计数、灭活、稀释和分装,并对参考品进行均匀性和稳定性评估。采用A族链球菌核酸检测试剂对阳性参考品符合率、阴性参考品符合率、重复性和最低检出限进行了适用性验证,并组织4家实验室开展了协作标定。结果建立了由10个阳性参考品、10个阴性参考品、最低检出限参考品和重复性参考品组成的A族链球菌核酸检测试剂评价用国家参考品。经评估该参考品具有良好的均匀性及稳定性,协作标定结果显示阳性参考品符合率、阴性参考品符合率、重复性参考品均符合要求,最低检出限参考品菌液浓度两家实验室标定为1×10^(4)个/mL,两家实验室标定为1×10^(3)个/mL。结论研制的参考品可以用于A族链球菌核酸检测试剂的质量评价。
- 石继春刘茹凤徐潇李康黄洋李江姣梁丽陈驰龙新星王春娥叶强
- 关键词：A族链球菌核酸国家参考品均匀性稳定性
- 不同时期分离的鼠伤寒沙门氏菌全基因组学分析研究被引量：4
- 2022年
- 目的:了解不同时期分离鼠伤寒沙门氏菌的基因组多态性。方法:采用solexa高通量测序技术对12株分离于1954-1980年与2018-2020年的鼠伤寒沙门氏菌标准菌株进行全基因组测序,以此进行菌株的多位点序列分型(MLST)分析;应用生物信息分析软件对测序菌株基因组的基因功能注释,并对预测的毒力基因、耐药基因、插入元件(IS)、前噬菌体和CRISPR序列进行比较分析。通过比较基因学分析拟合泛基因组和核心基因组积累曲线,与来源于其他国家已发表的代表性菌株构建系统发育分子进化树。结果:不同时期分离的12株鼠伤寒沙门氏菌的染色体全基因组序列大小无明显差异,约为4.8 Mbp。共发现5种不同MLST型别,以ST19为主(66.6%)。注释结果显示每株鼠伤寒沙门氏菌基因组含有大量(>20个)耐药基因;同时也发现不同菌株基因组之间毒力基因、IS、前噬菌体和CRISPR序列数量不尽相同;比较基因学分析证实鼠伤寒沙门氏菌核心基因组相对稳定,而泛基因组所含基因持续增加、高度可变。系统发育进化树显示,来源不同时期和国家的15株分离菌株形成3个不同进化分支,分子进化聚类与菌株的分离年代和地域无明显相关性。结论:解析了12株不同时期分离的鼠伤寒沙门氏菌标准菌株的全基因组序列,发现不同时期分离的菌株基因组数据和分子进化无明显相关性,这些结果不仅为后续探究鼠伤寒沙门氏菌耐药机制与遗传进化规律等研究奠定基础,同时也对标准菌株监管提供科学数据支持。
- 梁丽石继春陈驰陈驰叶强叶强
- 关键词：鼠伤寒沙门氏菌全基因组测序毒力基因耐药基因
- 铜绿假单胞菌核酸检测用试剂盒国家参考品的研究被引量：1
- 2022年
- 铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)为假单胞菌属的一种革兰氏阴性菌,也被称为绿脓杆菌。在自然界水、土壤与空气中均广泛存在[1]。铜绿假单胞菌污染常见于凉拌菜、熟肉制品、饮用水等食品领域。例如在水源水或成品水中检出铜绿假单胞菌,甚至多批次样品的检出率大于10%,为一种重要的水源和食源性致病菌[2-4]。因此在我国饮用天然矿泉水(GB 8537-2016)[5]和包装饮用水(GB 19298-2014)[6]的国家标准中均明确规定不得检出铜绿假单胞菌。此外,在2015年我国颁布的《化妆品安全技术规范》也要求化妆品中不得有铜绿假单胞菌检出[7]。铜绿假单胞菌作为医院内感染的主要病原菌之一,在机体免疫力低下时,例如术后和恶性肿瘤的患者容易感染本菌,且铜绿假单胞菌的耐药性强,在治疗时往往需要使用多种抗生素进行联合用药[8-9]。因此,快速而准确地鉴定出铜绿假单胞菌对保障食品安全和人民健康具有重要的意义。
- 梁丽陈驰石继春王春娥龙新星刘茹凤黄洋李康徐潇李江姣徐颖华叶强
- 关键词：铜绿假单胞菌国家参考品核酸检测饮用天然矿泉水凉拌菜熟肉制品
- 277株肺炎链球菌生物学鉴定及血清学分型结果分析被引量：3
- 2011年
- 目的:对277株肺炎链球菌进行生物学鉴定和血清学分型。方法:本文采用常规细菌鉴定及经改良的针对肺炎链球菌的特殊形态学、生化学鉴定方法,包括菌落特征、革兰染色镜检、生化反应、胆汁溶菌试验、Optochin试验、荚膜肿胀试验、荚膜染色试验等方法,对277株肺炎链球菌菌株进行了生物学鉴定和血清学分型。结果:277株经鉴定为典型的肺炎链球菌菌株中,1型和5型最多见,分别占11.6%和10.1%;其次为6B、3型、14型、19F、23F及2型,约占4.3%～6.5%。结论:实验结果对我国肺炎球菌疫苗生产菌种的质量控制具有指导意义。
- 陈驰肖磊石继春王珊珊郭素英叶强
- 关键词：肺炎链球菌细菌学鉴定血清学分型
- 肺炎球菌结合疫苗两种免疫效果评价方法的比较分析被引量：6
- 2014年
- 目的研究肺炎球菌结合疫苗诱导的功能抗体滴度与总抗体浓度的相关性。方法采用调理吞噬实验(opsonophagocytic assay,OPA)和酶联免疫吸附实验(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)对13价肺炎球菌结合疫苗免疫后血清样本进行OPA滴度和抗体浓度检测,并就两种检测结果进行比较,分析二者相关性。结果血清型1,3,5,6A,6B,9V,14,18C,19A和23F两种检测结果的相关系数较高,为0.71~0.88。19F和4型的相关系数相对略低,分别为0.66和0.52。结论 OPA法与ELISA法测定的血清抗体效价的相关性较高,二者结果具有良好的一致性。
- 李江姣杜慧竟陈驰石继春徐苗叶强
- 关键词：肺炎球菌结合疫苗ELISA
- 鲍氏不动杆菌核酸检测试剂盒国家参考品的研制被引量：3
- 2021年
- 目的研制鲍氏不动杆菌核酸检测试剂盒国家参考品,用于该试剂盒的质量评价。方法收集10株鲍氏不动杆菌和10株阴性参考菌株(同属不同种的不动杆菌及与鲍氏不动杆菌感染部位相同或感染症状相似的病原菌)新鲜培养物,进行灭活、分装。并对参考品进行均匀性及稳定性评估,同时验证其准确性、特异性、重复性、最低检出限。组织7家实验室对制备的参考品开展协作标定。结果成功制备了鲍氏不动杆菌核酸检测试剂盒国家参考品,包括10个阳性参考品、10个阴性参考品、最低检出限参考品和重复性参考品。阳性参考品、最低检出限参考品和重复性参考品Ct值的CV均<2.5%;与-20℃保存的参考品比较,于2~8、25、37℃分别放置3、7、14 d及冻融3、5次后参考品Ct值的差异均无统计学意义(P> 0.05)。制备的参考品具有良好的准确性、特异性、重复性,最低检出限为1.0×10^(3)个/mL。参加协作标定的7家实验室中,除1家出现假阳性结果,其他实验室的准确性、特异性和重复性验证均符合规定;有1家实验室的最低检出限高于1.0×10^(3)个/mL。结论本实验研制的参考品可用于鲍氏不动杆菌核酸检测试剂盒的质量评价。
- 徐潇石继春王春娥李康黄洋李江姣梁丽陈驰叶强
- 关键词：鲍氏不动杆菌核酸参考品试剂盒
- 10株铜绿假单胞菌的全基因组序列分析被引量：1
- 2022年
- 目的了解不同分离来源铜绿假单胞菌的全基因组基本特征,以此分析基因组多态性及其遗传进化关系。方法选择10株医源性和食源性来源的铜绿假单胞菌代表性菌株,应用Solexa高通量测序技术对其进行全基因组测序,以此进行多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST),比较各菌株基因组中携带的耐药基因、毒力基因及插入序列(insertion sequence,IS)元件,并通过比较基因组学分析方法拟合泛基因组和核心基因组积累曲线,筛选核心基因SNP构建系统发育分子进化树。结果10株菌的基因组从6.3~7.0 Mbp大小不一,包含5868~6598个基因,平均G+C含量为67.1%;发现10个菌株各具不同的ST型。在这10个菌株的基因组中,共检测到75种耐药基因,包括抗β-内酰胺酶类、抗氨基糖苷类、抗氟喹诺酮类等;共发现188种毒力基因,不同来源菌株间无明显差异;各菌株之间IS元件种类和数量差异较大。分析发现,铜绿假单胞菌具有开放型泛基因组和稳定型核心基因组;10株菌可分为3个进化分支,且不同分离时间和来源无明显相关性。结论本研究获得10株不同分离来源的铜绿假单胞菌的全基因组序列,初步证实食品及患者分离来源菌株基因组数据无明显相关性,为后续铜绿假单胞菌的分子流行病学和致病性机制研究提供数据参考。
- 王春娥石继春徐潇梁丽刘茹凤李康陈驰龙新星叶强徐颖华
- 关键词：铜绿假单胞菌全基因组测序耐药基因毒力基因
