孙凡越
- 作品数:5 被引量:5H指数:2
- 供职机构:辽宁师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:辽宁省海洋与渔业厅科研计划项目国际爱护动物基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 辽东湾斑海豹种群遗传特征的研究
- 斑海豹(phoca largha)又称西太平洋斑海豹,属食肉目(Carnivora)、犬形亚目(Caniformia)、海豹科(Phocidae)、斑海豹属(Pboca),是唯一能在我国海域繁殖的鳍脚动物。斑海豹已被列为...
- 孙凡越
- 关键词:斑海豹AFLP微卫星DNA线粒体DNA
- 文献传递
- 利用线粒体DNA序列进行斑海豹鉴定的研究
- 2008年
- 通过对待鉴定的血液样品中线粒体控制区扩增和序列测定,并与基因库中序列比对分析,成功地对斑海豹进行了种类鉴定。本研究所用方法在野生珍稀动物的种类鉴定中有很好的应用价值。
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- 关键词:斑海豹线粒体DNA控制区
- 辽东湾斑海豹(Phoca largha)线粒体D-loop区异质型研究初探被引量:2
- 2009年
- 采用PCR技术和DNA克隆测序技术,随机测定了3头斑海豹mtDNA控制区(D-loop区)CSB-3上、下游1000 bp左右的序列,每头斑海豹任选14个克隆菌斑进行测序,结果所得序列均无重复,得到42个单倍型。结合GenBank已发表的斑海豹mtDNA控制区序列(Phoca largha,AM181031),通过ClustalX1.83、MEGA3.1和FastPCRv3.6等生物信息学软件进行序列比对,发现我国珍稀保护动物斑海豹个体内线粒体DNA(mtDNA)的控制区CSB-3之后存在异质型现象,且存在数目不等的串联重复序列。从分子水平进行了不同类型重复序列变化规律的研究,初探了mtDNA控制区异质型在斑海豹中的存在情况。
- 高祥刚孙凡越李云峰鹿志创韩家波赫崇波
- 关键词:斑海豹MTDNA控制区串联重复序列异质型
- 辽东湾斑海豹遗传多样性的AFLP分析被引量:2
- 2008年
- 利用AFLP标记技术对辽东湾斑海豹的遗传多样性进行分析。采用7对AFLP引物对斑海豹3个群体(按不同采样年份分类)43个个体扩增共得到241个位点,3个群体内的多态位点比例为80.45%~95.85%,总多态位点比例为99.59%。群体的香农(Shannon)多样性指数为0.3817~0.4716,群体间的遗传距离在0.1742~0.4023之间。2007年群体的多态位点比例、Shannon多样性指数均高于2006年群体,2005年群体处于中等水平。用NTSYS软件进行个体聚类及UPGMA方法构建的群体系统树,发现3个群体的个体基本随机聚到一起,界限不十分明显,说明3年的群体差异不明显,甚至可以认为它们是混合群体。结果表明,斑海豹群体遗传多样性水平较低,遗传结构趋于简单化,且存在较强的基因交流。
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- 关键词:斑海豹AFLP分析