廖之君 作品数:34 被引量:53 H指数:5 供职机构: 福建医科大学基础医学院 更多>> 发文基金: 福建省科技厅青年人才基金 广东省生物芯片重点实验室基金 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 文化科学 自动化与计算机技术 更多>>
DEPDC7基因在肝细胞及肿瘤细胞中的差异性表达 被引量:3 2012年 目的研究DEPDC7基因在正常肝细胞、肝癌细胞及其他肿瘤细胞中的表达情况。方法常规培养正常肝细胞HL-7702,肝癌细胞SMMC7721、HepG2、Huh-7,其他肿瘤细胞ZR-7530、MDA-MB-231、SGC7901、SW480。用MTT检测肝癌细胞转染前后的增殖情况,用RT-PCR方法在转录水平检测DEPDC7基因的表达,用Western blot方法从蛋白质水平检测DEPDC7蛋白的表达。结果 3株肝癌细胞生长增殖速度差异有统计学意义(P<0.05)。肝癌细胞DEPDC7基因在mRNA和蛋白质表达水平比正常肝细胞降低(P<0.05),而其他肿瘤细胞DEPDC7基因表达差异无统计学意义(P>0.05)。结论 DEPDC7基因在正常肝细胞中选择性高表达,而在肝癌细胞株中呈低表达。 廖之君 王晓江 王心睿 林德馨关键词:基因表达 肝细胞癌 肝选择性未知基因loc91614的功能预测及表达研究 被引量:3 2013年 目的:预测肝脏组织选择性未知基因loc91614的功能,实验验证其基因表达。方法:构建含未知基因的肝组织选择性细胞通讯(LSCC)基因网络,再进行聚类、文献挖掘、基因本体、KEGG通路、Transfac转录因子结合位点等分析,用以预测loc91614的功能特征,最后,从mRNA和蛋白质水平验证其基因表达。结果:获得21个节点的LSCC基因网络,聚类显示loc91614与apob密切关联;文献挖掘显示基因与肝组织、胞质、脂等关键词显著相关;GO功能富集分析揭示loc91614具有细胞通讯、信号转导、细胞内信号级联的功能,有7个TFBS可对含loc91614的靶基因集进行调控,loc91614基因在肝细胞表达明显高于肝癌细胞。结论:loc91614可能分布于肝细胞的胞质中,很可能在肝组织中发挥细胞通讯等功能,也可能参与肝脏的糖、脂代谢过程,在肝细胞选择性高表达。 廖之君 马文丽 梁爽 林德馨 王晓江 郑文岭关键词:基因表达 细胞通讯 人DEPDC7基因启动子的转录活性分析 2015年 目的对人DEPDC7基因近端启动子进行生物信息学分析并构建该启动子的荧光素酶报告系统,初步探讨该启动子的活性。方法采用生物信息学方法对人DEPDC7基因的启动子和转录因子进行分析和预测,通过PCR法扩增DEPDC7基因近端启动子序列,PCR产物经HindⅢ和XhoⅠ双酶切后定向克隆到p GL2-Basic载体,构建一系列的启动子区域荧光素酶报告基因载体,随后经脂质体转染入293T细胞并检测各缺失片段萤光素酶活性。结果人DEPDC7基因位于11p13,翻译起始位点上游1 300 bp左右可能为启动子区域。经双荧光素酶报告基因检测后发现,所有的重组质粒均表现出荧光素酶活性,其中p GL2-DEPDC7P3活性最强。结论初步证明人DEPDC7基因启动子在-879 bp^+100 bp区域具有较强转录活性,为进一步揭示该基因生物学功能和其分子调控机制奠定基础。 王心睿 杨红 曾也婷 廖之君关键词:启动子 转录因子 生物信息学 活性分析 Etoposide诱导人白血病HL-60细胞凋亡及其机制的研究 目的:以人白血病HL-60细胞为实验,研究Etoposide/(依托泊苷/)诱导HL-60细胞凋亡, Caspase-3/(Cysteinyl aspartate-specific proteinase-3,半胱天冬酶-... 廖之君关键词:依托泊苷 细胞凋亡 C-JUN氨基端激酶 半胱天冬酶-3 HL-60细胞 文献传递 印记基因DLK1的研究进展 被引量:2 2014年 在哺乳动物中,有一部分特别的基因,它们由于受到印迹而只表达单一亲本的基因,这种表观遗传的修饰现象就是基因组印记,这有别于经典的孟德尔遗传学定律。DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰,主要的修饰部位发生在DNA的CpG岛,它参与了细胞分化,基因组稳定性、基因印记等多种细胞生物学过程,基因印迹的建立和维持是胚胎正常发育的基础,这一过程的实现有赖于各种DNA甲基化转移酶的精确表达和密切的配合。已发现在哺乳动物的基因组中存在着许多的印记基因,DLK1基因为父系表达母源沉默的印记基因,它的表达同样受到DNA甲基化的调节,它首先在神经母细胞瘤发现并克隆,定位于人类染色体14q32,属于表皮生长因子样超家族的成员之一,约有6个外显子。研究表明,DLK1基因在胚胎肝、早期肌肉组织以及造血干细胞等组织中均有表达,人DLK1基因全长1557bp,编码序列含有1152核苷酸,编码383个氨基酸残基,在人、小鼠、绵羊都存在保守序列,它参与多种细胞的增殖、分化并且与相关肿瘤的发生发展有着密切的关系,印迹基因的印迹异常与肿瘤的易感性及发生发展有重要的关系,本文就国内外DLK1基因的研究进展做一综述。 李雅琼 王伟 黄燕芳 廖之君 杨晓煜关键词:DLK1 印记基因 基因表达 秩和比法对A型选择题的质量分析和筛选 被引量:2 2000年 试题质量分析是题库建设和考试分析中的一个关键环节.本文采用难度、区别度和错选答案分布指数三个指标,用秩和比法对64道A型选择题的质量进行综合分析,并结合聚类分析方法将试题按质量等级分为三类,为试题的筛选提供了客观的依据. 林德馨 郑大利 廖之君关键词:选择题 试题质量 题库建设 文采 考试分析 全文增补中 生物化学课程深度学习教学模式的构建与探讨 2021年 深度学习教学模式的构建能有效促进本科课程教学水平的提升。本文以医学院校本科生生物化学与分子生物学课程为例,通过分析当前该本科课程教与学过程中存在问题的根源、探讨深度学习教学模式的特征及构建方案,从课程教学平台完善、资源库建设、教学手段及方法改进、效果评价等方面入手构建此模式,并在本科生课堂中进行了实践。结果表明,实验班更能把握课程核心、创建知识关联和迁移、有效进行反思性学习,且期末成绩优于对照班。 廖之君 余文明 黄山 李静 李萌 陈录赐关键词:医学本科 60mer寡核苷酸芯片制备及杂交系统的优化 2008年 [目的]寡核苷酸芯片制备及杂交过程中的影响因素很多,本实验针对其中主要影响因素进行优化,以筛选出最佳的条件,对芯片制备及杂交系统进行优化。[方法]通过改变芯片打印加样量、斑点数和不同探针浓度,挑选出芯片制备的实验条件;采用正交试验法,以信噪比(SNR值)为评估指标,分析芯片杂交的最佳条件。[结果]最佳实验条件为:增加预打印斑点数,探针浓度为1μg/μl,与纯化后的荧光标记样品在50%甲酰胺,10×SSC,0.2%SDS杂交液中42℃杂交4h,洗脱液每次洗脱时间为1min。[结论]此方法适用于60mer寡核苷酸芯片的制备及杂交效率的提高。 张海燕 马文丽 黄吉城 商涛 廖之君 郭波旋 郑文岭关键词:寡核苷酸芯片 正交试验 电离辐射影响人成纤维细胞基因表达谱的数据挖掘 被引量:3 2008年 目的从基因表达谱水平探讨2株人成纤维细胞和低剂量电离辐射3个时间点的可能交互效应,掘其差异表达基因。方法应用GeneSifter在线软件和Panther生物学信息数据库,对下载于NCBI的GEO(Gene Expression Omnibus)数据库的12个样品GSM(数据包含2株成纤维细胞和每株细胞3个辐照时间点),运用混合设计二因子的Two-Way ANOVA方法进行数据挖掘,并对差异表达基因进行聚类、主成分分析、模式分类、功能归类分析,最后用GenCLiP软件进行文献挖掘。结果获得41条交互效应的差异表达基因,主成分分析示每株细胞24h时间点的特征向量明显远离其他向量,差异基因表达可分为3种模式。基因功能归类分析提示,多个生物通路如有丝分裂、细胞周期、细胞结构、细胞凋亡等被显著激活,其中参与有丝分裂和细胞周期的差异表达基因由细胞骨架基因、微管运动基因、蛋白激酶基因等构成,细胞凋亡等效应获得文献支持。结论2株人成纤维细胞和低剂量电离辐射3个时间点有交互效应,存在基因差异表达,这些基因有可能成为鉴定成纤维细胞和辐照时间交互效应的生物标记。 廖之君 马文丽 梁爽 陈霞 左长清 郑文岭关键词:电离辐射 人成纤维细胞 基因表达谱 数据挖掘 利用癌旁组织中基因表达的秩序关系识别肝癌的早期诊断特征 被引量:1 2013年 目前,对于肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)早期检测中放射成像技术无法确定的结节,通常需要通过活检取样来进行组织病理学鉴定。然而,一些早期肝癌组织中所呈现的病理改变微小难辨,活检取样时也经常会出现未取到癌组织而漏检的情况。针对这些临床上肝癌早期诊断的困难,同时为了应对基因表达谱检测批次效应等对分类结果的影响,作者提出了利用癌旁组织中基因表达的秩序关系来鉴别早期肝癌及癌前病变的方法。首先找出在肝癌患者的肝硬化组织(cirrhosis tissue in patients with HCC,wHCC)和非肝癌患者的肝硬化组织(cirrhosis tissue in patients without HCC,woHCC)间基因表达值的相对秩序发生逆转的基因对,然后,借用大样本的肝癌组织表达谱数据筛选出HCC及wHCC中表达相对秩序一致的基因对,再基于这些基因对发展能将HCC、wHCC与woHCC进行鉴别的分类器。结果显示,该分类器对来自不同平台、不同实验室的验证集都有稳健的分类能力,可以用于早期肝癌的辅助鉴别诊断。 章琳 郝春香 陈蓓蓓 廖之君 郭政关键词:肝癌 癌旁组织 肝硬化 基因表达