启动子区重新甲基化对c-myc和H-ras基因表达和肿瘤细胞生长的影响 目的:
利用甲基供体S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosyl-L-methionin,SAM)使恶性肿瘤细胞系MGC803、HT29中癌基因c-myc和H-ras启动子区域的CpG岛重新甲基化,研究甲基化对癌基因... 李燕妮关键词:肿瘤细胞系 癌基因 甲基化特异性 实时荧光定量 文献传递 宫颈癌易感基因HLA-DQA1编码区SNPs的筛选和分析 被引量:1 2006年 背景与目的:人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)基因多态性的差异在宫颈癌发病过程中发挥重要作用,本研究用生物信息学的方法筛选宫颈癌易感基因HLA-DQA1编码区的单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs),并对其多态性的变异所引发的氨基酸变化是否会导致基因的功能异常进行筛选和分析。方法:使用SNPper软件从公共数据库dbSNP获得HLA-DQA1编码区的SNPs数据,在dbSNP数据库获取相应的FASTA序列,使用PARSESNP软件进行筛选和分析。结果:在HLA-DQA1基因的编码区发现2个SNPs(rs9272693和rs9272703),其单核苷酸的变化会引发错义突变,PSSMDifference大于10,预测该突变为有害突变。结论:建立的生物信息学方法可以对基因编码区的SNPs进行分析,在众多的SNPs中搜寻出序列保守区的变异,并给出评价标准,但是所得结果需要在宫颈癌患者与对照人群中进行实验验证。 李艳芸 邢军 赵林胜 李燕妮 王玉川 张维铭关键词:宫颈肿瘤 人类白细胞抗原 子宫颈癌HLA—DRB1基因型的初步研究 被引量:4 2009年 宫颈癌是严重危害妇女健康的一种疾病,世界上每年大约有50万例新增病例。现已明确,宫颈癌是一种与人乳头状瘤病毒(HPV)感染明确相关的肿瘤,90%以上的宫颈癌组织HPV呈阳性。近年来,众多宫颈癌易感基因的研究表明,除环境与生活方式等外界因素外,宿主的免疫学和遗传背景与宫颈癌的发生密切相关。多种证据表明, 杨桂芳 李艳芸 贾艳菊 邢军 李燕妮 王玉川 张维铭关键词:DRB1 基因型 人乳头状瘤病毒 宫颈癌组织 妇女健康 易感基因 上颌前突畸形两种截骨术式对鼻唇软组织的影响 目的: 1.治疗上颌前突畸形采用传统的上颌前份截骨术及改良术式的手术要点及术后疗效观察。 2.利用CMF软件以患者的CBCT数据重建上颌前突患者的骨组织及软组织三维形态,选择测量项目来评估两种上颌前份截骨术对上颌前突... 李燕妮关键词:上颌前突畸形 截骨手术 术式选择 运用生物信息学策略对宫颈癌易感基因HLA-DRB1编码区SNPs的筛选和验证 2010年 目的:用生物信息学的方法筛选宫颈癌易感基因HLA-DRB1编码区的单核苷酸多态性(coding single nucleo-tide polymorphisms,cSNPs)位点,并对其多态性的变异是否会导致基因的功能异常进行分析和验证。方法:以dbSNP数据库的SNPs为来源,使用专业软件对HLA-DRB1基因编码区的SNPs进行评价和分析,然后对候选SNPs位点在病例对照组中验证。结果:在HLA-DRB1基因的编码区发现3个SNPs(rs1059582、rs1059576、rs1059586)的变化会引发错义突变,PSSM Differ-ence值(接近或大于10)较高,预测该SNPs为有害突变。其中rs1059586在宫颈癌组中的基因型分布与对照组不同,差异有统计学意义(P=0.029)。结论:生物信息学与病例对照研究相结合研究复杂疾病相关SNPs位点简便、经济、高效,对研究遗传标记与复杂性疾病的关系有重要意义。 李艳芸 杨桂芳 贾艳菊 邢军 李燕妮 王玉川 张维铭关键词:生物信息学 宫颈癌 人类白细胞相关抗原 宫颈癌相关基因HLA-DRB1编码区SNPs的生物信息学分析 2006年 目的用生物信息学的方法建立筛选宫颈癌相关基因HLA-DRB1编码区SNPs的技术平台,筛选出与宫颈癌发病相关联的SNPs。方法使用SNPper软件从公共数据库dbSNP获得HLA-DRB1编码区的SNPs数据,在dbSNP数据库获取相应的FASTA序列,使用PARSESNP软件进行分析。结果在HLA-DRB1基因的编码区发现2个SNPs(rs1059576和rs1059582),其单核苷酸的变化会引发错义突变,PSSMDifference大于10,该突变为有害突变。另外rs9269958变异则引发终止密码子的产生。结论建立的生物信息学的方法可以对基因编码区的SNPs进行分析,在众多的SNPs中搜寻出序列保守区的变异,并给出评价标准,但是所得结果需要在宫颈癌与对照人群中进行试验验证。 李艳芸 邢军 徐垚 赵林胜 李燕妮 王玉川 张维铭关键词:生物信息学 宫颈癌 人类白细胞抗原 双向凝胶电泳检测重度缺氧缺血性脑病新生儿血清差异表达蛋白的研究 2010年 新生儿缺氧缺血性脑病(hypoxic—ischemic encephalopathy,HIE)大多源于新生儿窒息,特点是发病快、病情重、病死率高,由此继发的智力低下、脑性瘫痪、癫痢、共济失调等后遗症,严重影响生命质量及人口素质的提高。HIE的诊断和治疗一直是新生儿科的重点和难点,目前HIE的诊断主要依靠病史、临床表现和影像学检查。 李艳芸 毕道濯 李士学 耿鑫 邢军 李燕妮 李悦国 初桂兰关键词:重度缺氧缺血性脑病 差异表达蛋白 凝胶电泳检测 新生儿血清 新生儿缺氧缺血性脑病 智力低下 S-腺苷甲硫氨酸抑制大肠癌细胞生长的实验研究 被引量:4 2011年 目的探讨S-腺苷甲硫氨酸(SAM)对人大肠癌细胞生长的抑制作用及抑癌机制。方法用SAM对大肠癌细胞系HT-29进行处理,使其癌基因c-myc和H-ras启动子区域甲基化。用噻唑蓝(MTT)法检测肿瘤细胞生长状态;甲基化特异性聚合酶链反应(PCR)(MSP)法检测c-myc和H-ras启动子区域甲基化状态;细胞免疫荧光染色检测C-MYC和H-RAS蛋白的表达情况。结果大肠癌细胞系HT-29经SAM处理后,癌基因c-myc和H-ras启动子区域重新出现甲基化。经SAM处理的大肠癌细胞组与对照组相比,细胞生长受到明显抑制,差异有统计学意义(P<0.05);C-MYC和H-RAS蛋白表达明显降低,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 SAM能使HT-29中癌基因c-myc和H-ras启动子区域重新甲基化,降低C-MYC和H-RAS蛋白的表达水平,且有效抑制了肿瘤细胞的生长,从而为肿瘤治疗提供了新的靶点。 罗瑾 李燕妮 耿鑫 张维铭关键词:S-腺苷甲硫氨酸 大肠癌细胞 肿瘤细胞中的c-myc与p16启动子重新甲基化 被引量:3 2009年 目的探讨基因启动子区重新甲基化对肿瘤细胞生长的影响,寻找肿瘤防治新靶点。方法用S-腺苷甲硫氨酸使c-myc和p16启动子甲基化,MTT法测定肿瘤细胞生长状态;免疫荧光染色检测基因表达的变化。结果药物处理后,c-myc表达显著降低(P<0.05),而p16表达无明显变化(P>0.05);肿瘤细胞的生长受到抑制。结论SAM能够通过下调癌基因的表达来抑制肿瘤细胞的生长,提示其在肿瘤治疗方面的应用前景。 李燕妮 王玉川 张维铭关键词:胃癌细胞系 癌基因 抑癌基因 促甲基化反应的研究进展 被引量:2 2006年 近年来,表遗传学异军突起,已成为许多学科的研究前沿。DNA甲基化是目前肿瘤研究的一大热点。促甲基化即人为地促使DNA发生重新甲基化反应,从而控制某些基因的表达与失表达。该文仅就目前已知的促甲基化的研究进展作一综述。 李燕妮 张维铭关键词:DNA甲基化 肿瘤 原癌基因