程莹寅
- 作品数:24 被引量:51H指数:3
- 供职机构:中国科学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学自动化与计算机技术经济管理更多>>
- 一种筛选用于二倍体群体亲子鉴定的分子标记组合的方法
- 本发明公开了一种从给定二倍体物种亲本群体的分子标记中筛选用于亲子鉴定的标记组合的方法,包括以下步骤:将所有亲本对作为树状结构的根节点,依据各亲本对所有可能产生的子代的分型,将亲本对进行分类构建子节点,所获得的子节点中亲本...
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- 文献传递
- 寄生于鲫的锚首虫一新种被引量:1
- 2018年
- 文章报道了寄生于鲫(Carassius auratus)鳃部的锚首虫一新种,鲫锚首虫(Ancyrocephalus carassii sp.nov.)。该虫几丁质结构与寄生于鳜(Siniperca chuatsi)的河鲈锚首虫(A.mogurndae)在整体上很相似,尺寸略大,但鲫锚首虫的背联结棒上有两个突起,背中央大钩基部较后者更粗壮,且在近钩顶处有一明显的小凹。这是首次在鲫上发现锚首虫科(Ancyrocephalidae)单殖吸虫的寄生。
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- 关键词:单殖吸虫
- 一种基于人工智能实现的鱼类体表多尺寸测量方法
- 本发明公开了一种基于人工智能实现的鱼类体表多尺寸测量方法,采集鱼类图片,鱼类图片背景中包括比例尺;对于鱼类图片进行标注,将鱼类图片和对应的标签作为一个样本,生成训练数据集和验证数据集;将训练数据集输入到深度学习模型,对深...
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- 沙棘在防治豆粕饲料引起的鱼类肠肝炎症中的应用
- 本发明公开了沙棘在防治豆粕诱导的鱼类肠炎和肝脏炎症中的应用,结合草鱼疾病建模的肠组织转录组结果与整合生物信息学分析,推测沙棘是潜在的防治豆粕诱导肠肝炎症的药物;经斑马鱼动物试验证明,沙棘果粉或果油通过饲料添加,抑制肠道炎...
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- 文献传递
- 基于斑马鱼幼鱼成像模型评价缓解食源性肠炎成分的方法
- 本发明公开了一种基于斑马鱼幼鱼成像模型评价缓解食源性肠炎成分的方法。该方法基于先天免疫细胞双标记品系及后天免疫细胞单标记品系Tg转基因荧光标记斑马鱼构建食源性肠炎模型,通过投喂饲料的方式分别在先天/后天免疫细胞起作用的时...
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- 文献传递
- 基于微单体型分子标记的草鱼亲子鉴定方法被引量:3
- 2020年
- 研究选择一种新型分子标记--微单体型用于亲子鉴定,构建了高效的标记筛选和亲子鉴定流程,并以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)为例评估了该亲子鉴定方法的效果。结果表明,利用基因组重测序数据能够准确完成微单体型标记的分型,效果和适应性明显优于传统的基于群体遗传学推断的分型;通过信息熵的大小能够高效筛选微单体型标记组合, 3个和5个微单体型标记的亲子鉴定结果与微卫星序列(SSR)鉴定结果的一致性分别达到97.08%和99.42%。研究表明使用微单体型分子标记可以快速而准确地完成鱼类的亲子鉴定工作。
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- 关键词:亲子鉴定草鱼高通量测序
- 主养草鱼池塘底泥微生物群落多样性研究被引量:24
- 2011年
- 为研究主养草鱼池塘底泥微生物多样性,采用细菌通用引物27F和1492R扩增了湖北石首一草鱼(Cteno-pharyngodon idellus)养殖池塘底泥细菌16S rDNA片段,构建了底泥细菌16S rDNA克隆文库,并对该文库中的微生物群落进行了分析。结果显示,该文库的Shannon多样性指数(H')为3.85,Schao1丰富度指数为185,Evenness均匀度指数(E)为0.96。池塘底泥中主要的细菌类群为:变形菌门(Proteobacteria)(53.66%)、厚壁菌门(Firmi-cutes)(14.63%)、酸杆菌门(Acidobacteria)(7.32%)、拟杆菌门(Bacteroidetes)(7.32%)、绿弯菌门(Chloroflexi)(3.66%)、放线菌门(Actinobacteria)(3.66%)、浮霉菌门(Planctomycetes)(2.44%)和分类地位未知(Unclassifiedbacteria)(7.32%)的种类。其中,变形菌门中的γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria)是明显的优势类群(21.95%)。草鱼养殖池塘底泥中微生物种类丰富,而磷代谢功能菌Enterobacter cloacae和鱼类病原菌Acinetobacter lwoffii的出现表明池塘底泥既是生态修复功能菌的资源库,也是鱼类细菌性疾病的病原库。
- 程莹寅吴山功郑英珍王微微邹红李文祥王桂堂
- 关键词:微生物多样性
- 一种基于人工智能实现的鱼类体表多尺寸测量方法
- 本发明公开了一种基于人工智能实现的鱼类体表多尺寸测量方法,采集鱼类图片,鱼类图片背景中包括比例尺;对于鱼类图片进行标注,将鱼类图片和对应的标签作为一个样本,生成训练数据集和验证数据集;将训练数据集输入到深度学习模型,对深...
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- 一种直接从全基因组重测序数据中得到微单体型及其分型的方法
- 本发明公开了一种直接从全基因组重测序数据中获取微单体型及其分型的方法,包括以下步骤:获取待测个体的全部SNP位点信息,根据测序深度筛选SNP位点,获得全基因组范围的微单体型及其信息,针对待测个体上有两种及以上分型情况的二...
- 夏晓勤夏雷石米娟段攸张婉婷程莹寅吴南
- 主养草鱼池塘底泥微生物群落生态学研究
- 底泥微生物是池塘生态系统的重要组成部分,在促进底泥有机质分解、加速底泥营养盐释放和保持良好养殖环境等方面具有重要意义.为全面了解池塘底泥微生物群落的结构和功能,作者采用16S rDNA克隆文库和末端限制性片段长度多态性(...
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- 关键词:草鱼T-RFLP