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肖岚

作品数:1 被引量:4H指数:1
供职机构:北京大学化学与分子工程学院物理化学研究所更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家杰出青年科学基金更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学

主题

  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白质工程
  • 1篇嫁接
  • 1篇功能区
  • 1篇骨架蛋白
  • 1篇打分函数

机构

  • 1篇北京大学

作者

  • 1篇韩玉真
  • 1篇肖岚
  • 1篇梁世德
  • 1篇来鲁华

传媒

  • 1篇科学通报

年份

  • 1篇2000
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
蛋白质表面功能区的嫁接被引量:4
2000年
报道了一种蛋白-蛋白相互作用表面位点的嫁接方法.首先确定被嫁接的配体表面结合区的重要残基,在骨架蛋白中搜索适合于嫁接这些残基的位点.基于对映残基的C_α,C_β原子坐标,将骨架蛋白叠加到配体蛋白上,评估骨架蛋白与受体蛋白的互补性并留下互补性较好的骨架蛋白.细调骨架蛋白与受体蛋白的相对位置,使之具有合理的界面堆积密度.然后在骨架蛋白选出的位置上移植配体蛋白相应的残基.另外,对于与受体有严重碰撞的残基,或不能形成盐桥的包埋带电侧链,也予以突变.突变后的骨架蛋白与受体一起用Charmm进行能量优化.用刚性蛋白-蛋白复合物结构回归出一个适合于嫁接研究的打分函数.利用打分函数对骨架蛋白的结合自由能进行评估。
梁世德肖岚毛凤楼江林韩玉真来鲁华
关键词:嫁接骨架蛋白打分函数蛋白质工程功能区
共1页<1>
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