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肖岚
作品数:
1
被引量:4
H指数:1
供职机构:
北京大学化学与分子工程学院物理化学研究所
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发文基金:
国家自然科学基金
国家杰出青年科学基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
来鲁华
北京大学化学与分子工程学院物理...
梁世德
北京大学化学与分子工程学院物理...
韩玉真
北京大学化学与分子工程学院物理...
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肖岚
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来鲁华
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年份
1篇
2000
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蛋白质表面功能区的嫁接
被引量:4
2000年
报道了一种蛋白-蛋白相互作用表面位点的嫁接方法.首先确定被嫁接的配体表面结合区的重要残基,在骨架蛋白中搜索适合于嫁接这些残基的位点.基于对映残基的C_α,C_β原子坐标,将骨架蛋白叠加到配体蛋白上,评估骨架蛋白与受体蛋白的互补性并留下互补性较好的骨架蛋白.细调骨架蛋白与受体蛋白的相对位置,使之具有合理的界面堆积密度.然后在骨架蛋白选出的位置上移植配体蛋白相应的残基.另外,对于与受体有严重碰撞的残基,或不能形成盐桥的包埋带电侧链,也予以突变.突变后的骨架蛋白与受体一起用Charmm进行能量优化.用刚性蛋白-蛋白复合物结构回归出一个适合于嫁接研究的打分函数.利用打分函数对骨架蛋白的结合自由能进行评估。
梁世德
肖岚
毛凤楼
江林
韩玉真
来鲁华
关键词:
嫁接
骨架蛋白
打分函数
蛋白质工程
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