苏满秀
- 作品数:4 被引量:5H指数:1
- 供职机构:湖南农业大学更多>>
- 发文基金:湖南省自然科学杰出青年基金公益性行业(农业)科研专项湖南省教育厅优秀青年基金更多>>
- 相关领域:生物学理学更多>>
- 一种新的氨基酸描述子及其在抗菌肽QSAR中的应用
- 基于氨基酸的531个理化性质(AA531)和地统计学半变异函数,提出了一种新的氨基酸描述子—氨基酸理化性质的地统计学关联特征描述子(GS-AA531)。并以其表征101个CAMEL-s抗菌肽,运用基于支持向量回归(SVR...
- 丰峰苏满秀袁哲明
- 关键词:氨基酸抗菌肽定量构效关系地统计学
- 文献传递
- 多肽一级结构表征与抗菌肽QSAM建模被引量:5
- 2012年
- 从整体上考虑多肽一级结构,提出了3种仅基于多肽氨基酸序列、计算简便、适于不等长肽和可捕获多肽上下文关联特征的多肽新描述子,即地统计学关联(GS-AA531)描述子、多尺度组分与关联(MSCC)描述子和地统计学关联与多尺度组分(GS-AA531-MSC)描述子.将其应用于2个抗菌肽体系(等长肽与不等长肽)的结构表征,并以支持向量回归建立QSAM模型.模型的拟合、留一法及独立测试结果表明,结合特征筛选的新描述子GS-AA531与GS-AA531-MSC的预测精度明显稳定且优于其它参比描述子,在多肽QSAM研究中具有广泛应用前景.
- 苏满秀王立峰代志军袁哲明柏连阳
- 关键词:抗菌肽支持向量回归
- 多肽/蛋白质序列特征提取及其应用
- 实验确定抗菌肽类似物生物活性和蛋白质磷酸化位点费时费力费钱,因此根据现有数据采用定量序效模型(Quantitative Sequence-Activity Model, QSAM)研究抗菌肽序列与生物活性间关系、建立自动...
- 苏满秀
- 关键词:支持向量机蛋白质磷酸化
- 文献传递
- 一种新的氨基酸描述子及其在抗菌肽QSAR中的应用
- 基于氨基酸的531个理化性质(AA531)和地统计学半变异函数,提出了一种新的氨基酸描述子—氨基酸理化性质的地统计学关联特征描述子(GS-AA531).并以其表征101个CAMEL-s抗菌肽,运用基于支持向量回归(SVR...
- 丰峰苏满秀袁哲明
- 关键词:抗菌肽氨基酸定量构效关系地统计学
- 文献传递