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谭翰清

作品数：46 被引量：195H指数：8
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  • 9篇流感
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  • 4篇球菌
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作者

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2014—2016年广东省肇庆市人感染H7N9禽流感病毒基因组特征分析被引量：5
2017年
目的了解广东省肇庆市2014-2016年人感染H7N9禽流感病毒基因进化特征。方法对肇庆市17例H7N9患者咽拭核酸直接进行8节段基因序列扩增与测定,用BioEdit5.0、MEGA6.0进行同源性和重要氨基酸位点分析,采用Neighbor-Joining法构建进化树,参比序列从GenBank下载。结果 7份H7N9病例标本获得8节段全基因序列,HA与A/chicken/Dongguan/695/2014(H7N9)相似度最高,NA与A/chicken/Dongguan/1075/2014(H7N9)相似度最高;内部基因与2013—2014年广东东莞、深圳禽源H7N9及H9N2相似度较高。HA和NA基因与广东省东莞、广州、深圳等地市的H7N9序列同处于珠三角进化分支,与安徽、浙江、江苏等长三角分支的序列相似性低。HA蛋白受体结合位点发生G186V、Q226L变异,裂解位点序列均为PEIPKGR↓GLF,含有2个碱性氨基酸;M2蛋白上发现耐药位点S31N,PB2蛋白上发现E627K突变,NA蛋白上未发现耐神经氨酸酶的位点变异。结论肇庆市人感染H7N9病毒株可能来源于2013—2014年广东省珠三角地区禽源H7N9和H9N2,G186V、Q226L和E627K位点变异增强了对人的易感性。
谭翰清程洁萍谭海芳朱颖梅林凤梁晓晴陈捷麦炜
关键词：血凝素基因神经氨酸酶基因
诺如病毒遗传组Ⅱ型TaqMan-MGB探针实时荧光PCR的检测研究被引量：2
2008年
目的建立特异、灵敏的诺如病毒遗传组Ⅱ型TaqMan-MGB探针实时荧光PCR快速检测方法。方法根据GenBank诺如病毒遗传组Ⅱ型代表株保守序列设计特异引物对和TaqMan-MGB探针,调整引物、探针浓度,优化最佳反应条件,建立一步法实时荧光PCR快速检测反应体系,进行灵敏度、特异性、稳定性试验,以评价反应体系,并与引物P289/P290常规RT-PCR进行灵敏度比较。结果诺如病毒遗传组Ⅱ型TaqMan-MGB探针实时荧光PCR检测时限短,仅1h就出结果;最低检出下限为100拷贝/mL,比引物P289/P290常规RT-PCR灵敏度高100倍;与轮状病毒、腺病毒、星状病毒、甲肝病毒无交叉反应;4份核酸含量不同的标本重复检测5次,平均Ct值变异系数范围0.96%～2.27%。结论诺如病毒遗传组Ⅱ型TaqMan-MGB探针实时荧光PCR快速、特异、灵敏、稳定性好,可应用于突发公共卫生应急检测,提高快速检测能力。
陈华谭翰清郭赐贶谭海芳程洁萍林凤孔秀珍丁丽娜
关键词：人类杯状病毒诺如病毒实时荧光PCRTAQMAN
医院不同来源金黄色葡萄球菌耐药性比较
2010年
目的了解医院不同来源的金黄色葡萄球菌耐药性,为有效控制医院感染和临床用药提供依据。方法采用纸片扩散法,对本医院临床分离与医院环境中分离的金黄色葡萄球菌的耐药性进行了检测和比较。结果医院环境中分离与临床分离的金黄色葡萄球菌对万古霉素均100%敏感。医院环境中分离的25株金黄色葡萄球菌对头孢西丁、氯霉素、环氧沙星、克林霉素、红霉素、庆大霉素、青霉素、四环素、甲氧苄啶、利福平等10抗生素耐药率均低于临床病人标本分离的30株金黄色葡萄球菌。结论医院环境中和病人标本分离的金黄色葡萄球菌对临床常用抗生素的耐药性存在差别,病人标本分离菌株耐药性更强。
林凤谭翰清
关键词：金黄色葡萄球菌临床分离株耐药性
柯萨奇A组6型病毒TaqMan探针实时荧光RT-PCR的建立
2017年
目的建立柯萨奇A组6型病毒TaqMan探针实时荧光RT-PCR,用于手足口病例快速诊断及监测。方法根据GenBank中柯萨奇A组6型病毒VP1高保守序列设计引物和探针,建立和优化实时荧光RT-PCR反应体系,评估其特异性、灵敏度、稳定性,在手足口病监测中应用,并与商品化试剂比较,抽取部分阳性标本测序验证。结果本研究建立的柯萨奇A组6型病毒实时荧光RT-PCR可在60 min内完成检测,与其它型别的肠道病毒和病原体无交叉反应,灵敏度可达10~0 copies/μL梯度,对两个不同核酸浓度样本Ct值的变异系数分别为0.29%、0.38%。280份非EV71、CA16的标本中检出142份CA6阳性标本,与商品化试剂检测结果一致。随机抽取15份阳性标本产物测序,与CA6靶基因序列同源性99.8%以上。结论建立的柯萨奇A组6型病毒实时荧光RT-PCR方法特异、灵敏、稳定,可用于非EV71、非CA16的其它肠道病毒标本分型。
程洁萍谭翰清
关键词：手足口病实时荧光RT-PCR
广东省肇庆市怀集县人感染H7N9禽流感流行特征分析被引量：8
2014年
目的分析人感染H7N9禽流感病例的流行病学特征,评估活禽交易市场休市措施对疫情的影响。方法对广东省肇庆市怀集县人感染H7N9禽流感确诊病例临床表现和流行病学特征进行描述性分析,同时采用实时荧光定量反转录-聚合酶链反应（real time RT-PCR）对病例家庭禽类养殖环境、全县活禽交易市场休市前、休市后市场环境标本进行检测。结果怀集县共确诊人感染H7N9禽流感病例9例,无死亡病例。重症病例主要表现为重症肺炎,轻症病例以咳嗽、咽痛为主;分布在全县5个镇,年龄中位数为11岁（4～62岁）。全部病例均有明确的禽类接触史,4/9的病例有慢性基础性疾病;病例的164名密切接触者共有6人出现流感样症状,其中1人经确诊为人感染H7N9禽流感病例,考虑为同源暴露。休市前主城区H镇市场环境标本H7型阳性率为65.00%（52/80）,休市后为3.49%（3/86）;乡镇市场休市前为14.81%（12/81）,休市后为0（0/111）。休市后全县人感染H7N9禽流感新发病例大幅度下降。结论 9例人感染H7N9禽流感病例以轻症病例为主,4～11岁年龄组人群多发,病例均有明确的禽类接触史。采取暂停市场活禽交易等综合防控措施能有效控制疫情。
朱碧柳麦炜邓鸿申文豪谭翰清陈惠欢陈志鹏周跃华
关键词：流行病学
广东省肇庆市2014年-2016年活禽市场外环境禽流感病毒污染状况分析被引量：7
2017年
目的分析广东省肇庆市活禽市场外环境禽流感污染状况,为人禽流感科学防治提供依据。方法 2014年-2016年随机选取肇庆市9个县市区活禽市场进行外环境采样,开展甲型流感和H5、H7、H9亚型实时荧光RT-PCR监测,对结果进行统计分析。结果 2014年-2016年共采集4 269份外环境样本,甲型流感和H5、H7、H9亚型核酸总阳性率分别为28.77%、5.43%、5.39%、15.44%;甲型流感在每年1月出现一个高峰;封开县未检出H7亚型,怀集县、四会市、鼎湖区H7亚型检出数较高;在不同类型的标本中,宰杀或摆放禽肉案板表面的甲型流感、H5及H7核酸阳性率最高(37.60%、12.22%、7.40%);外环境H7亚型检出较多的地区与H7N9病例分布呈正相关(r=0.701,P<0.05)。结论广东省肇庆市2014年-2016年活禽市场外环境禽流感病毒污染程度呈现季节性分布,不同样本类型分布状况不同,H7亚型的污染严重程度与H7N9病例感染分布呈正相关。
程洁萍谭翰清朱颖梅谭海芳林凤黄强
关键词：禽流感病毒活禽市场污染状况分析
不同核酸提取试剂在肠道病毒核酸检测中的比较被引量：6
2015年
目的比较国产试剂与进口试剂提取手足口病病例标本肠道病毒核酸的重复性、灵敏度及对核酸的回收率。方法用国产磁珠法试剂盒与进口离心柱法试剂盒同时提取手足口病病例标本、用于检测和作为阳性质控品的细胞培养物,通过荧光PCR方法检测病毒核酸,比较2种核酸提取试剂所提取的病毒核酸的重复性、灵敏度及对核酸的回收率。结果国产磁珠法与进口离心柱法重复性、灵敏度无明显差异;国产磁珠法回收率为80.02%,进口离心柱法回收率为75.63%。结论国产试剂与进口试剂性能无明显差异;国产磁珠法较离心柱法方便快捷,国产试剂可替代进口试剂用于手足口病病原学检测。
谭国浩谭翰清姬宏超
关键词：手足口病荧光PCR法
2014年肇庆市登革Ⅰ型病毒流行株E基因序列分析
2017年
目的了解肇庆市2014年登革热病Ⅰ型病毒流行毒株E基因序列。方法收集肇庆市2014年登革热患者病例资料及急性期血清,用C6/36细胞培养分离登革热病毒,阳性分离株采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增E基因,绘制系统发生树,进行生物信息学分析。结果 36份标本中20份病毒分离培养阳性,获得肇庆市2014年Ⅰ型登革热病毒流行20株毒株的E基因序列,其同源性与中山市的2株流行毒株接近,但与广州市Ⅰ型登革病毒流行株相差较远。结论肇庆市登革热疫情同中山市登革热流行程度相关联且流行特点为输入性流行。
朱颖梅谭海芳苏乐斌管大伟谭翰清程洁萍
关键词：登革病毒E基因系统进化树
2014年肇庆市登革热病毒实验室检测分析
2017年
目的了解肇庆市2014年流行的登革热病毒I型毒株E基因序列进化情况,寻找爆发来源,为本地登革热的防控提供科学依据。方法收集肇庆市2014年登革热病例急性期血清进行病毒分离培养和基因扩增测序,构建系统发生树,进行生物信息学分析。结果从36份登革病例急性期血清标本中分离到20株登革I型病毒,在进化树上可分为3个主要的分支,与当年广州、中山和佛山分离到的登革病毒I型毒株最为接近。结论肇庆市2014登革热疫情在生物学上存在多个来源,可能是周边临近地区病例输入引起的本地爆发。
朱颖梅谭海芳苏乐斌谭翰清程洁萍
关键词：基因型
肇庆市2014-2015年登革病毒分子分型及初步溯源研究
目的了解广东省肇庆市2014-2015年登革病毒(dengue virus,DENV)的基因型别和可能的输入来源。方法收集登革热临床诊断病例急性期血清,对实时荧光反转录-聚合酶链反应(reverse transcript...
谭翰清谭海芳朱颖梅
关键词：登革病毒E基因实时荧光RT-PCR
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