钟浩
- 作品数:2 被引量:3H指数:1
- 供职机构:浙江林学院林业与生物技术学院浙江省现代森林培育技术重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 毛竹基因文库的构建及Mariner-like和PIF-like转座元件的筛选
- mariner转座子最早是在研究毛里塔尼亚果蝇(Drosophilam auristiana)白眼基因的一个不稳定突变时发现的。在其他动物和植物基因组也发现了大量类似mariner转座子元件的存在,并且部分具有转座活性,...
- 周明兵梁银燕胡娇丽钟浩汤定钦
- 文献传递
- 毛竹Stowaway-like MITEs转座子的分离与分析被引量:3
- 2010年
- 微型颠倒重复序列(miniature inverted repeat transposable elements,MITEs)是一类对基因组进化和基因表达有重要调节作用的转座子。为分析MITEs在毛竹基因组中的分布特性,借鉴Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing repeats(FIASCO)方法,首次构建Stowaway-like MITEs富集文库。随机挑取21个克隆,测序发现2个含有Stowaway-like MITEs序列(Stow-Ph1和Stow-Ph2),阳性率为9.52%。Stow-Ph1和Stow-Ph2的长度分别为260和258bp,具有Stowaway-like MITEs典型的末端颠倒重复序列(terminal inverted repeats,TIRs)和靶位点重复序列(target site duplication,TSD)。Stow-Ph1和Stow-Ph2与水稻的Stow-Os8(FJ266024)的同源性分别为46.4%和52.6%。Stow-Ph1和Stow-Ph2与水稻16类Stowaway-like MITEs的TIRs前20bp的相似性均高于50%,表明毛竹的Stowaway-like MITEs在TIRs上是高度保守的。
- 钟浩周明兵白有煌汤定钦
- 关键词:毛竹磁珠富集转座子MITES