陈璟 作品数:18 被引量:64 H指数:4 供职机构: 江南大学物联网工程学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 中央高校基本科研业务费专项资金 江苏省科技攻关计划 更多>> 相关领域: 自动化与计算机技术 生物学 文化科学 化学工程 更多>>
产甲烷菌高度紧密子网络分析 2015年 为了从系统水平上阐明嗜热菌的耐热机制,并指导嗜热菌在工业生产上的进一步应用,以产甲烷菌的代谢网络作为研究对象,从研究代谢网络的拓扑结构以及高度紧密子网络出发,探索常温产甲烷菌Methanosarcina acetivorans(M.acetivorans)和嗜热产甲烷菌Methanopyrus kandleri(M.kandleri)之间的代谢网络的耐热性的差异。实验结果发现常温产甲烷菌M.acetivorans最紧密的9-核和嗜热产甲烷菌M.kandleri最紧密的7-核分别包含27和19个酶。其中嗜热产甲烷菌M.kandleri网络中最紧密的7-核被分成2个子网,一个子网中的酶节点刚好是2个产甲烷菌所共同的酶,而另一个子网络中的酶是嗜热产甲烷菌M.kandleri 7-核所特有的酶,这些特有的酶全部与酪氨酸的合成有关。 陈璟 须文波关键词:代谢网络 产甲烷菌 网络拓扑 耐热性 基于PCA-SVM混合算法的嗜热菌和常温菌网络特征的研究 2012年 通过比较嗜热菌和常温菌代谢网络的特征参数,可以从系统角度确定微生物嗜热性的主要因素。本文首先利用主成分分析法对22个网络特征进行相关性分析,根据特征值、载荷值的大小最终选择了11个主要网络特征:用选出的这11个网络特征组成特征向量,利用支持向量机构建分类器,对嗜热菌和常温菌进行分类,其全局平均预测率为82.93%,对常温菌和嗜热菌的平均预测率分别为87.86%和72.40%。结果表明利用主成分分析法选择的网络特征可以很好的表征嗜热菌和常温菌的耐热性,因此簇大小分布的平均信息等11个网络特征是影响微生物耐热性的关键的代谢网络特征因素。 王文超 丁彦蕊 陈璟关键词:SVM算法 网格搜索 网络特征 采用EKF与PF的室内融合定位技术 被引量:4 2020年 在室内定位的复杂环境中,WiFi指纹法的定位性能易受信号波动的影响,行人航位推算方法(Pedestrian Dead Reckoning,PDR)的定位误差会随时间逐渐累积,为了解决这两个方面的问题,提出了一种采用扩展卡尔曼滤波(Extended Kalman Filter,EKF)与粒子滤波(Particle Filter,PF)的融合定位技术,该技术通过融合WiFi指纹法和优化后的行人航位推算方法来提高定位精度。在WiFi指纹法模块,该技术采用传统的加权k近邻法进行定位。在行人航位推算模块,该技术融合多种传感器进行航向估计,改进传统的非线性模型进行步长估计,使优化后的行人航位推算方法更适用于复杂环境中的实际应用。最后,结合粒子滤波和室内地图信息,该技术能够校正估计位置并进一步提高定位精度。通过实验表明,本文提出的融合校正方法能够有效提高定位精度。 张雨婷 陈璟关键词:扩展卡尔曼滤波 粒子滤波 一种量子行为粒子群优化动态聚类算法 被引量:4 2011年 为了改善量子行为粒子群优化算法的收敛性能,避免粒子早熟问题,提出了一种基于完全学习策略的量子行为粒子群优化算法。由此设计了一种新的数据聚类算法,新的聚类算法通过特殊的粒子编码方式在聚类过程中能够自动确定最佳的聚类数目。在五个测试数据集上与其他两种动态聚类算法进行聚类实验比较,实验结果表明,基于完全学习策略的量子行为粒子群优化动态聚类算法能够获得较好的聚类结果,有着良好的应用前景。 陈伟 陈璟 孙俊 须文波关键词:粒子群优化 量子行为 动态聚类 加速度差分有限状态机计步算法 被引量:16 2016年 在用户行为无法预知的实际计步应用中,如何保持计步算法的准确性和稳定性是一个极具挑战的问题。传统的计步算法利用阈值设定和峰值检测,并不能解决计步算法的普适性和稳定性。针对上述问题,提出了基于加速度差分作为特征的有限状态机(acceleration differential based on finite state machine,AD-FSM)计步算法。该算法将原始加速度取平方和,并通过卡尔曼滤波去除噪声干扰,最后使用加速度差分有限状态机实现计步检测。实验结果表明,该算法在正常和干扰情况下能够提供精确的计步结果,误差分别为1.12%、4.00%,验证了该计步算法在降低状态机复杂度的同时具有较强的稳定性和鲁棒性,更能适应复杂的应用场景。 王革超 梁久祯 陈璟 朱向军关键词:抗干扰 有限状态机 基于手机加速度传感器的高精低采样计步算法设计 被引量:10 2015年 针对传统的计步算法在计步准确度和算法复杂度上难以达到良好平衡的问题,提出了一种双算法计步模型:辅助计步算法采用信号幅值分析的方法,避免了传统的幅值检测或过零检测过程带来的误差问题;主体计步算法借助于阈值校正因子,在保证较高计步精度的同时,降低了算法的复杂度。计步模型的运算过程与手机摆放位置无关,并且能够很好地适应不同用户的步态习惯。实验结果表明,即使在低频率(10Hz)采样时,其平均计步准确度也可以达到90%以上。 梁久祯 朱向军 陈璟关键词:加速度传感器 产甲烷常温菌和嗜热菌代谢网络特征的比较研究 被引量:1 2011年 以产甲烷的常温古细菌Methanosarcina acetivorans(MAC)和嗜热古细菌Methanopyrus kandleri(MKA)的代谢网络为研究对象,分析了网络的拓扑结构与功能之间的关联性。本文利用Networkx计算了代谢网络的度、度的中心性、紧密度中心性以及介数中心性等参数值,通过比较分析发现常温古细菌MAC和嗜热古细菌MKA存在氨基酸代谢以及碳水化合物代谢保守途径,且都具有明显更高的度。结果同时表明子途径00010(糖酵解/糖异生)、00020(柠檬酸循环)、00250(丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢)是常温古细菌MAC与嗜热古细菌MKA2个生物体的重要途径。 陈璟 丁彦蕊 须文波关键词:代谢网络 古细菌 产甲烷菌 基于Gate-ResNet-D模型的远程监督关系提取方法 被引量:2 2019年 在实体关系抽取任务中,通常采用远程监督(distant supervision,DS)数据集,远程监督方法能通过大规模语料库自动标注数据来扩张数据集,但这无疑会使数据集充满大量的噪声。为此,该文将深度残差网络(deep residual network,ResNet)应用到关系提取的远程监督数据集上,通过加深网络层数来提高模型降噪能力。同时,提出了Gate模块,有效提高了深度残差网络的性能。该模块可以学习到每个特征通道的重要性,通过权重增强或抑制各个特征通道的比重,从而防止过拟合。另外,为了进一步解决数据集降噪问题,还提出了一种双池化层的池化层新方案。实验结果表明所提方法相比于目前效果较好的PCNN+ATT模型,在准确率和召回率上都有3%左右的提升。 袁祯祺 宋威 陈璟产甲烷常温古细菌和嗜热古细菌代谢网络拓扑结构与功能间的关联性研究 2011年 根据从KEGG数据库获得的产甲烷的常温古细菌Methanosarcina acetivorans(MAC)和嗜热古细菌Methanopyrus kandleri(MKA)的代谢网络,通过不同的网络属性特征的比较,发现常温古细菌MAC的代谢网络比嗜热古细菌MKA有更长的平均路径长度,更大的直径,这表明常温古细菌MAC的总体结构是相对低密度、松散的网络结构.同时为了从系统水平上分析这些特征蕴含的功能意义,采用了Grivan和Newman提出的模块算法(简称GN算法)分析这两个生物体的功能模块,并将所得的结果与KEGG数据库中的途径信息进行比较研究,发现大部分模块对应2~4个KEGG途径,表明这些网络模块均具有一定功能意义. 陈璟 丁彦蕊 须文波关键词:代谢网络 古细菌 产甲烷菌 社团结构 模块性 产甲烷的常温古细菌和嗜热古细菌的代谢网络比对研究 被引量:4 2015年 生物网络比对是生物体的结构、功能和进化分析的重要研究手段.以从KEGG数据库获得的产甲烷的常温古细菌Methanosarcina acetivorans(M.acetivorans)和嗜热古细菌M ethanopyrus kandleri(M.kandleri)的代谢网络为对象,采用了网络比对算法M atching-based Integrative GRAph Aligner(M I-GRAAL)对它们的全局代谢网络以及hub模块网络进行了比对.比对结果表明采用度、聚集系数以及离心率三个度量参数相结合的网络比对结果明显优于其它度量参数的计算结果,且结果更稳定.同时发现常温产甲烷菌M.acetivorans的hub模块与嗜热产甲烷菌M.kandleri的hub模块相似代谢途径的拓扑基本一致,不相似的代谢网络中有81.8%以上的节点都在嗜热产甲烷菌M.kandleri的最紧密的7-核中,推测嗜热菌的耐热性可能与受到胞内酪氨酸的影响. 陈璟 须文波关键词:代谢网络 古细菌 产甲烷菌 耐热性