刘文广
- 作品数：44 被引量：101H指数：6
- 供职机构：中国科学院南海海洋研究所更多>>
- 发文基金：广东省科技计划工业攻关项目中国科学院知识创新工程重要方向项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学天文地球医药卫生更多>>
- 一种改良金黄壳色马氏珠母贝生长的制种方法
- 本发明公开了一种改良金黄壳色马氏珠母贝生长的制种方法。(1)从具有快速生长特性的马氏珠母贝群体挑选雌性个体作为母本，以长耳珠母贝雄性个体作为父本进行人工杂交，然后通过群体内自繁，扩大群体数量；(2)从步骤(1)中获得的扩...
- 何毛贤张华刘文广
- 基于RNA-Seq高通量测序技术的法螺差异表达基因分析
- 2023年
- 法螺是珊瑚礁“杀手”长棘海星为数不多的自然捕食者之一,是珊瑚礁生态系统的重要保卫者。但是,由于海洋环境变化、人类的过度捕捞、珊瑚礁栖息地被破坏等因素,法螺的自然资源遭受严重破坏,已长期处于濒临灭绝的状态。尽快开展法螺基础研究迫在眉睫,但是该物种的基因组资源有限,阻碍了如生物矿化等分子机制的深入研究。本研究借助于Illumina HiSeq^(TM)2000测序平台完成了法螺两种组织(肌肉与外套膜)的高通量测序工作。测序所得原始序列经筛选、组装之后比对到NR、NT、Swissprot、KEGG、GO和InterPro数据库中获得注释结果,并进行差异基因聚类分析。结果表明,测序共获得109722个Unigene,其中有46239个Unigene得到功能注释,共获得7994个差异表达基因,其中在法螺外套膜组织中有3196个上调,4798个下调。对差异表达基因(differentially expressed genes,DEG)的GO注释和KEGG富集分析显示,高表达的DEG显著富集在典型的生物矿化相关通路中,如糖胺聚糖生物合成硫酸软骨素通路(glycosaminoglycan biosynthesis chondroitin sulfase dermatan sulfate)、磺基转移酶活性(sulfotransferase activity)、钙离子结合(calcium ion binding)等。通过实时定量荧光聚合酶链反应(RT-qPCR)对8个与矿化相关的DEG基因的表达情况进行验证表明,其表达趋势与转录组测序结果一致。本研究中所获得丰富的转录本和全面的转录组信息,增加了法螺基因信息的同时,还为法螺矿化机制的解析提供了一定的数据支持。
- 刘文广张格格岑希彤何毛贤
- 关键词：转录组差异表达基因生物矿化
- 不同贝龄华贵栉孔扇贝数量性状的通径分析被引量：46
- 2012年
- 对华贵栉孔扇贝(Chlamys nobilis)3月龄、6月龄、7月龄、9月龄和15月龄的4个数量性状(壳高、壳长、壳宽和体质量)进行了测量,分析了性状间的表型相关性及形态性状对体质量的影响程度。结果表明,4个数量性状两两间呈正相关,其相关系数达到极显著水平(P<0.001)。形态性状与体质量间,壳长对体质量的相关系数较高,壳宽对体质量的相关系数较小。通径分析显示壳宽对体质量的通径系数最小,除7月龄外,壳高对体质量的通径系数大于壳长。相关指数分析的结果与通径分析结果相似,形态性状对体质量的相关指数为0.910～0.943。经多元回归分析,建立了4个月龄时期壳高、壳长和壳宽对体质量的线性回归方程。研究表明,在6月龄后以壳高为主要选择指标,可达到对体质量的选择,研究结果为华贵栉孔扇贝选择育种中选育指标的确立提供了理论指导。
- 刘文广林坚士何毛贤
- 关键词：数量性状通径分析华贵栉孔扇贝
- 一种马蹄螺的活体运输方法
- 本发明公开了一种马蹄螺的活体运输方法。其是将海绵用海水浸泡后，将海绵放入袋内，然后将马蹄螺成螺或螺苗放在海绵上，注入氧气到袋内，扎紧袋口，使氧气不泄露，放入的马蹄螺成螺或螺苗的体积不超过袋容积的1/3，然后将装有马蹄螺成...
- 何毛贤刘文广胡建兴欧泽奎
- 文献传递
- 限食对合浦珠母贝幼虫生长、成活及变态的影响被引量：3
- 2010年
- 自2009年4月27日至2009年5月25日,在不同投饵条件下研究了限食对合浦珠母贝(Pinctadafucata)幼虫生长、成活和变态的影响。结果显示,试验初期对照组幼虫的壳长、壳高日增长率逐渐升高,自第20天开始迅速下降;试验一组(隔天投喂)和二组(隔2d投喂)幼虫的壳长、壳高日增长率缓慢升高,且与对照组同期幼虫的日增长率差异显著,这表明饵料是否充足直接影响马氏珠母贝幼虫的生长。试验期间,对照组幼虫的成活率逐渐降低,畸形率无显著性变化,而试验一组和二组幼虫的成活率显著低于对照组,试验二组幼虫的畸形率高于同期对照组和试验一组幼虫的畸形率,表明在食物匮乏的情况下,幼虫的发育受到影响。对照组幼虫在第20天时开始变态,随后变态率逐渐升高,试验一组幼虫在第30天时开始变态,而试验二组幼虫在试验期间一直没有变态,表明该组幼虫的营养状况不足以支持其变态附着。
- 刘文广何毛贤
- 关键词：限食合浦珠母贝幼虫成活变态
- 基于SLAF测序分析3个塔形马蹄螺群体的遗传结构和多样性被引量：1
- 2020年
- 塔形马蹄螺(Tectus pyramis),海洋软体动物,广泛分布于中国深圳大鹏湾、海南岛、西沙和南沙群岛的珊瑚礁生态系统中。文章采用特异性位点扩增片段简化基因组测序技术(SLAF-seq)对来自深圳(SZ)、三亚(SY)和西沙(XS)的塔形马蹄螺群体的遗传多样性和结构进行分析。通过测序共获得115.74Mb读长数据,平均测序深度为337.87倍,测序质量值(Q30)平均为94.07%。研究获得118679个多态性SLAF标签,获得846502个高度一致的群体单核苷酸多态性位点(SNPs),其中有155个显著差异SNPs。3个群体的平均观察杂合度(Ho)和期望杂合度(He)值分别为0.1441~0.1611和0.2537~0.2695。平均多态性信息含量(PIC)为0.2048~0.2176。通过系统发育树分析、主成分分析和聚类分析,将45个个体大致分为3个类群,每个群体的所有个体都可以聚类成一个类群。SZ和SY群体的遗传结构相似,遗传距离最低(0.2510),遗传分化系数Fst值最低(0.0818)。但XS与其他两个群体间的遗传分化明显,尤其是XS和SZ群体(Fst=0.1868)。3个群体的遗传分化可能与海流和地理位置有关。
- 黄景欧泽奎刘文广何毛贤
- 关键词：种质资源
- 一种塔形马蹄螺的人工催产方法
- 本发明公开了一种塔形马蹄螺的人工催产方法，其包括如下步骤：(1)将塔形马蹄螺亲贝在培养有底栖硅藻的养殖池中促熟养殖，当养殖池中水温达到25℃或以上时，取贝加入常温海水，再经阳光暴晒、连续充气，使水温逐渐上升；(2)将经太...
- 何毛贤欧泽奎刘文广
- 文献传递
- 一种筛选具有优良生长性状的马氏珠母贝活体亲本的方法
- 本发明公开了一种筛选具有优良生长性状的马氏珠母贝活体亲本的方法。本发明通过马氏珠母贝性状关联分析与亲本基因型鉴定相结合的方法，筛选到具有优良性状的马氏珠母贝活体亲本，操作简便可行，存活率较高，降低了成本，可满足贝类遗传育...
- 何毛贤刘文广石禹
- 一种与马氏珠母贝壳色关联的分子标记及其应用
- 本发明公开了一种与马氏珠母贝壳色关联的分子标记及其应用。所述的分子标记位于SEQ ID NO.1所示核苷酸序列的第1065位所示，为A/T型。本发明通过重测序筛选基因组SNP，对壳色性状进行GWAS分析。依据获得top位...
- 何毛贤张华司梦茹刘文广
- 马氏珠母贝两个与生长性状相关QTL的验证被引量：5
- 2015年
- 利用2个马氏珠母贝群体对遗传连锁图谱已经定位的,与马氏珠母贝生长性状相关的数量性状位点(Quantitative trait locus,QTL)中的两个进行验证。结果显示:m59标记在2个群体中与壳高、壳长、壳宽和总重具有显著的相关性(P<0.05),其GT基因型的个体壳高、壳长、壳宽和总重均显著高于GG基因型的个体;154165标记在湛江群体中与壳高具有显著相关性(P<0.05),而在深圳群体中与壳宽具有显著相关性(P<0.05);表明QTL标记m59在2个群体中是共享QTL,而154165标记在群体中是特异QTL。基于这两个QTL在这2个群体中分别构建二倍型,发现在湛江群体中二倍型C_1(AAGT)和深圳群体中D_1(AGGT)型和D_2(AAGT)型对马氏珠母贝生长最为有利,可作为优先的基因型组合。
- 韦国建刘文广林坚士何毛贤
- 关键词：马氏珠母贝TRAIT生长性状
