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MC4R基因沉默对牛成纤维细胞内基因表达的影响被引量：3: 2017年; 旨在研究黑素皮质激素4受体基因(Melanocortin-4receptor,MC4R)沉默对牛成纤维细胞内能量与脂肪代谢相关通路上基因表达的影响,进一步揭示MC4R基因与肉牛胴体品质以及能量平衡与脂肪代谢之间的关系。本试验使用MC4R被敲降的牛成纤维细胞系,借助深度测序技术寻找试验组(MC4R敲降)和阴性对照组(MC4R未敲降)中表达量差异显著的基因。利用GO注释聚类分析和KEGG通路富集分析对涉及能量代谢、脂肪运输及相关调控通路的差异基因进行了深入的富集分析。随机选取差异表达基因中的10个基因,利用实时定量PCR对深度测序结果进行验证。此外,本研究借助牛SNP芯片对上述目标基因的单核苷酸多态性(SNP)进行了检测,并对136头西门塔尔牛进行了基于目标基因各SNP的基因型检测。基于各SNP的分型数据,本研究进一步利用PLINK软件对SNP与牛各胴体性状的关联性进行分析。通过深度测序,在两组阳性MC4R被敲降的牛成纤维细胞系中共发现7 799个差异表达基因,其中上调基因1 703个,下调基因6 096个。显著性GO分类在两组不同干扰水平处理组间共选出与能量代谢调节、脂肪运输过程相关的差异表达基因265个,功能聚类分析进一步筛选出与能量代谢相关的基因29个。KEGG通路富集分析发现,与能量代谢、脂肪运输等过程相关的265个差异表达基因共涉及到40个不同的通路,其中与MC4R基因及能量代谢调控有密切关联的Leptin、AGRP、NPY和POMC等基因同属于脂联素信号通路。MC4R敲降引起该通路上22个基因的表达发生显著变化。实时定量PCR结果表明,所选择的10个基因(表达量上调基因:CFB、RSAD2、IFIT3、CHI3L1和BOLA-N;表达量下调基因:UPK1B、IER2、LASS3、TGFβ3和AXUD1)的mRNA表达水平与测序结果无显著差异,从而证实了深度测序数据的准确性和可重复性。此外,借助50K密度的牛SNP芯片,本研究共发现了16个SNPs�; 黄萌贤明史明艳陈燕张路培高会江李俊雅许尚忠高雪; 关键词：MC4R基因 MRNA表达量

牛MyoD1基因遗传变异及其对胴体性状的影响被引量：29: 2007年; 运用DNA池快速测序法寻找牛MyoD1基因SNPs,筛查到1个新的多态位点C1867T,该位点C-T突变引起甘氨酸/丝氨酸的转变。运用PCR-RFLP法验证并分析该位点在不同群体间的多态性,并与相应牛群体的胴体性状进行关联分析。结果显示,中国西门塔尔牛、鲁西牛群体的C1867T位点的突变达到了Hardy-Weinberg平衡状态,而秦川牛未达到平衡状态。不同基因型对肉牛的背膘厚、大腿肉厚的影响差异极显著或显著(P<0.01或P<0.05),对日增重、屠宰率、肌间脂肪、大理石花纹、嫩度的影响差异不显著。; 黄萌许尚忠昝林森高雪陈金宝; 关键词：多态性基因效应

家鸡早期胚胎性别鉴定体系的建立: 本试验以优化PCR条件，建立快速性别鉴定方法为目的，从家鸡血样、鸡胚羊水和尿囊液中获得DNA。通过对家鸡的两个性别鉴定候选基因CHD1和XhoI重复片段进行PCR扩增引物筛选和反应体系的优化。结果显示CHD1基因PCR法...; 魏泽辉王嘉力黄萌贾存灵苏利红; 关键词：家鸡胚胎性别鉴定尿囊液; 文献传递

特异性siRNA抑制牛MC4R基因在牛成纤维细胞表达效果的研究: 利用生物软件(Invitrogen公司的在线设计软件)，根据siRNA干扰序列设计原则，选取MC4R基因(参考序列NM_ 174110.1)的四个区段设计4个siRNA的靶序列;并利用慢病毒表达载体pFU-GW-shMC...; 黄萌高雪李俊雅许尚忠; 关键词：成纤维细胞基因表达真核表达载体; 文献传递

ctsd、ctsl基因的多态性与'雪龙'黑牛胴体性状相关性研究: 为了提高雪龙黑牛的胴体性状,进行新品种选育,以组织蛋白酶D、L(Cathepsin D,Cathepsin L)基因为候选基因,利用PCR-RFLP方法对114头雪龙黑牛F1代商品牛进行多态性检测,应用SAS 9.2软件...; 陈晓杰高雪许尚忠李俊雅高会江张路培李姣吴蒙张立敏陈翠刘喜冬周正奎张猛黄萌刘利; 关键词：胴体性状

中国西门塔尔牛GH基因SNPs与经济性状的关联分析被引量：7: 2011年; 本试验采用PCR-RFLP和DNA测序等技术检测牛生长激素基因P3位点(growth hormone,GH-P3)在中国西门塔尔牛群体中的多态性,并利用最小二乘法拟合线性模型对该位点与牛经济性状进行关联分析。结果表明,BB基因型个体胴体重和净肉重极显著高于AA和AB基因型个体(P<0.01),屠宰率和净肉率显著高于AA和AB基因型(P<0.05),AA基因型背膘厚极显著低于AB、BB基因型(P<0.01)。本研究结果显示,GH-P3位点对中国西门塔尔牛个体胴体重、屠宰率、净肉重、净肉率及背膘厚等经济性状有显著或极显著的影响,为中国西门塔尔牛重要经济性状的分子标记辅助选择(MAS)及品系培育提供理论依据。; 张超李姣田璐李俊雅黄萌许尚忠; 关键词：GH基因经济性状

牛RXRG基因遗传变异与双胎性状的关联分析被引量：19: 2008年; 以视黄素X受体基因γ(retinoid X receptor-gamma,RXRG)作为牛双胎性状的候选基因,运用测序法寻找牛RXRG基因SNPs,筛查到一个新的多态位点A1941G,该位点位于3′UTR。运用PCR-RFLP法验证并分析该位点在鲁西牛双胎群体和单胎群体及中国西门塔尔牛、安格斯牛和西蒙杂交牛单胎群体间的多态性,结果表明,在鲁西牛双胎和单胎群体中分布A、B两个等位基因,处于中度多态。经χ2适合性检验,鲁西双胎牛群体在该位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。将鲁西牛群体的A1941G位点的基因型效应与双胎性状进行关联分析,卡方独立性检测结果显示,基因型分布在鲁西单、双胎牛群体上差异达到极显著水平(P<0.01)。; 黄萌许尚忠昝林森张路培高雪陈金宝; 关键词：PCR-RFLP

鲁西黄牛成年母牛体重与体尺指标的相关回归分析: 以山东省鲁西黄牛产区2006年测量的110条相关数据为基础,分析了体重与体高、体长、胸围、管围的相关系数,构建了估测鲁西黄牛成年母牛体重的回归模型。结果表明:体重与体高、体长、胸围、管围的相关系数分别为:0.751、0....; 周正奎李姣姬爱国黄萌许尚忠陈金宝高雪任红艳; 关键词：鲁西黄牛体重相关系数计算程序; 文献传递

肉牛RXRG和MyoD1基因的克隆、SNPs筛查及其与肉质和双胎性状的关联分析: 本研究分别以秦川牛、鲁西牛、西门塔尔牛和安格斯牛4个品种牛的514份血样和西门塔尔牛的组织样为材料,分别提取基因组DNA和RNA。运用生物信息学方法和同源序列克隆技术结合电子PCR /(ePCR/)、反转录PCR /(R...; 黄萌; 关键词：SNPS; 文献传递

牛CTSB基因SNP与胴体和生长性状的关联分析: 2011年; 西门塔尔X鲁西黄牛的杂交群体属于优良的乳肉兼用品种,为探讨其部分经济性状的标记进行早期育种,提高产业利润,此研究以组织蛋白酶B(Cathepsin B,CTSB)基因为胴体和生长性状的候选基因,利用PCR-RFLP方法对174头西门塔尔X鲁西黄牛CTSB内含子6进行多态性检测,分析了不同基因型的群体遗传结构,应用SAS9.2软件采用最小二乘法拟合线性模型,对不同基因型与牛4个胴体和生长性状进行关联分析。结果表明,CTSB基因第6内含子的T5357C突变在群体中处于哈代温伯格平衡状态;且基因型值与日增重和净肉重两个性状呈显著相关(P<0.05),其中AA型的日增重和净肉重显著高于AB,BB型。上述结果为T5357C突变作为潜在的肉牛胴体和生长性状的分子标记提供了一定的参考。; 邓桂馨许尚忠高雪李俊雅高会江袁峥嵘周正奎黄萌李姣; 关键词：胴体性状生长性状

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