张群业
- 作品数：11 被引量：23H指数：3
- 供职机构：上海交通大学医学院附属瑞金医院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划上海市教育委员会重点学科基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 在转录组和蛋白组水平系统研究维甲酸诱导APL细胞分化的分子机制
- ＜正＞急性早幼粒细胞性白血病（acute promyeloeytic leukemia, APL）是M3型急性髓性白血病（acute myeloid leukemia,AML）,占全部AML的10％-15％。在大多数的A...
- 郑培烝王侃侃张群业黄秋花张庆华陈赛娟陈竺张济
- 文献传递
- 人肾小管上皮细胞蛋白质组的双向电泳及计算机图像分析被引量：3
- 2003年
- 目的 双向电泳(two-dimensional gel electrophoresis,2DGE)技术是蛋白质组研究中最为重要的蛋白质分离方法。建立并优化人肾小管上皮细胞蛋白质组分析所需的固相pH梯度等电聚焦双向电泳及相关技术。方法 由于不同的细胞系特殊性,样品处理亦不同,因此以人肾小管上皮细胞HK-2为研究对象,对样品液组成、样品处理、上样方式、上样量、IPG胶条和SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳染色方法等相关技术进行了研究和条件优化后,以固相pH梯度等电聚焦为第一向和SDS均一胶(T=12.5％)的水平电泳为第二向,研究人肾小管上皮细胞蛋白质组。结果 成功地得到了人肾小管上皮细胞双向电泳图谱,并通过ImageMaster 2D Elite 3.01软件进行图像分析,输出初步的检测结果。结论 建立蛋白质组研究的技术平台,为从更高的水平来寻找肾脏疾病的功能蛋白和特异性蛋白,阐明肾脏疾病发生发展的网络机制等后续研究工作奠定基础。
- 李娅陈楠王伟铭张群业黄秋花
- 关键词：肾小管蛋白质组双向电泳计算机图像分析肾脏疾病
- 磷酸化蛋白质组学揭示小热休克蛋白27是胶质细胞源性神经营养因子引起神经突触生长的新信号分子被引量：2
- 2010年
- 胶质细胞源性神经营养因子（GNDF）是胶质细胞分泌的一种神经营养刚子，是胶质细胞对神经元发挥保护作用最主要的途径。GNDF对多巴胺能神经元的保护及促生长作用明显，是神经保护治疗帕金森病（PD）首选神经营养因子。而对GDNF信号转导的机制尚不清楚，因此，我们用蛋白质组学的方法寻找参与GDNF信号转导通路的可能信号分子。
- 洪桢张群业刘军王志全张煜肖勤鲁静周海燕陈生弟
- 关键词：胶质细胞源性神经营养因子蛋白质组学促生长作用热休克蛋白27神经突触磷酸化
- 差异表达蛋白质组学中的常用技术被引量：9
- 2004年
- 人类基因组计划基本完成后,人们又开始对生物所有蛋白质性质和功能进行大规模研究,即蛋白质组学。尤其是由于差异表达蛋白质组学在制药和疾病研究中的巨大潜力,更是倍受重视。蛋白质组学的极端复杂性决定了它所应用的技术更加复杂和综合,本文简要介绍了在差异表达蛋白质组学中的常用技术。
- 张群业陈竺
- 关键词：二维凝胶电泳ICAT层析
- 人APL细胞株NB4不同二维电泳条件对电泳结果的影响被引量：4
- 2004年
- 本研究探讨不同二维电泳条件对人急性早幼粒细胞性白血病 (APL)细胞株NB4二维电泳结果的影响。选用 2 4cm ,pH3- 10L的固定 pH梯度 (immobilizedpHgradient,IPG)胶条 ,用IPGphor进行第一相等电聚焦 ,然后用EttanDaltII垂直电泳系统进行第二相SDS PAGE ,银染后用ImageMaster 2DElite软件进行分析。结果表明 :采用低离子强度的缓冲液冲洗收集样品可以提高等电聚焦效果。裂解液中 7mol/L尿素、4 0mmol/LDTT能溶解NB4细胞大部分蛋白质 ,而水化液中硫脲与尿素合用可以明显增加碱性端中低分子量区可分辨的蛋白质点。NB4细胞用 2 4cm ,pH3- 10L的IPG胶条进行二维电泳时 ,10 0 μg左右的上样量、6 32 0 0V小时左右的等电聚焦时间是恰当的。结论 :APL细胞的蛋白质种类繁多 ,受多种因素影响 ,正确选择样品制备方法和二维电泳条件十分重要。
- 张群业黄秋花沈树红王海红陈赛娟陈竺
- 关键词：NB4细胞株二维电泳IPG
- 应用IP-2D nano-HPLC-MALDI-TOF-TOF鉴定蛋白质泛素化修饰被引量：2
- 2008年
- 近年来,在蛋白质研究中,特别是在蛋白质翻译后修饰(PTM)的研究中,生物质谱技术的应用越来越广泛,与纳升级HPLC的联合应用,使这一技术手段更加有效.针对泛素化在细胞功能调控中发挥关键作用的PTM的特点,将免疫沉淀、2Dnano-HPLC和基质辅助激光解吸/电离串联飞行时间质谱(IP-2D nano-HPLC-MALDI-TOF-TOF)有机整合,建立了天然状态下蛋白质泛素化位点的鉴定方法,并应用这一方法确定出K562细胞内具有酪氨酸激酶活性的蛋白c-ABL的泛素化位点.为定性鉴定生理和病理状态下内源性蛋白的泛素化修饰提供了借鉴.
- 毛建华张群业黄秋花陈竺陈俭陈赛娟
- 关键词：泛素化蛋白质翻译后修饰
- 在转录组和蛋白组水平系统研究维甲酸诱导APL细胞分化的分子机制
- 急性早幼粒细胞性白血病(acute promyelocytic leukemia,APL)是M3型急性髓性白血病(acute myeloid leukemia,AML),占全部AML的10％-15％.在大多数的APL患者...
- 郑培煙王侃侃张群业黄秋花张庆华陈赛娟陈竺张济
- 关键词：急性早幼粒细胞性白血病分子机制全反式维甲酸生物治疗
- 文献传递
- 结膜松弛症泪液蛋白质肽质量指纹谱分析被引量：2
- 2010年
- 目的分析结膜松弛症泪液蛋白表达谱的变化。方法收集22例结膜松弛症患者和13例正常对照组的泪液样本,毛细管从每眼收集15μL泪液,采用ZipTip C18柱浓缩和纯化泪液样本,利用基质辅助的激光解吸质谱进行线性模式和肽质量指纹谱(PMF)检测,并对PMF图谱数据进行多变量数据统计分析,比较结膜松弛症组和正常对照组的泪液PMF的差异。结果2组泪液的质谱检测峰在数量上差异无统计学意义(P>0.05),主成分分析结合偏最小二乘法分析显示结膜松弛症组泪液蛋白质表达与正常对照组比较有差异,结膜松弛症组泪液蛋白质表现为"离群"样本,且离群分散度较大的样本为结膜松弛症Ⅳ级的患者。结论应用ZipTipC18柱分离联合基质辅助的激光解吸质谱技术可有效筛查泪液蛋白质。对PMF图谱进行多变量数据统计分析,可以观察到结膜松弛症组与正常对照组泪液蛋白质存在差异,并可为结膜松弛症临床诊断、疾病发生发展的机理及治疗提供参考。
- 项敏泓张兴儒李青松张梦晖鲁静张群业张延
- 关键词：结膜松弛症肽质量指纹谱主成分分析
- 基因和蛋白质的批量注释系统UBROAD
- 2007年
- 以DNA微阵列、二维电泳、二维高压液相色谱和质谱等技术为代表的转录组和蛋白质组高通量实验技术,能够产生海量的基因或蛋白质数据,对这些基因或蛋白质的注释是对相关数据进行后期处理的基础和必要条件.海量数据的注释人工难以完成,而目前基因和蛋白质的批量注释网站给出的注释又往往不够全面.在比较常用基因和蛋白质的批量注释网站的基础上,本工作研发了基因和蛋白质的批量注释系统UBROAD(Unified Batch Retriever ofAnnotation Data),该系统整合了NCBI、Swiss-Prot、BIND、enzyme-expasy、gene2accession和gene2Unigene 6个有关基因和蛋白质的数据源;支持Uniprot/trEMBL AC、Uniprot Entryname、Genbank Protein Accession Number、Genbank mRNA gi、Genbank mRNA Accession Number、Gene name、Gene ID和Unigene ID 8种登录号混合查询;含有各种登录号以及基因或蛋白质的基本信息、功能分类、相互作用共38项注释项供选择;提供微软电子表格形式的注释结果.可以通过访问网页http://www.bioscience.org.cn/ubroad免费使用该系统.
- 郭景康张祥云杨旭智张群业王健
- 关键词：生物信息学数据库整合
- 在转录组和蛋白质组水平对维甲酸/三氧化二砷诱导早幼粒细胞性白血病细胞分化/凋亡的系统研究
- 肿瘤细胞对于有效的治疗药物的反应是十分复杂的,要充分理解这种反应的复杂性和动力学就必须要求有高通量、假设驱动的能够在时间和空间水平对蛋白质和基因进行定量研究的方法。在临床上,维甲酸和三氧化二砷联合应用对于治疗急性早幼粒细...
- 张群业张小伟鲁静黄秋花郑培烝张济陈赛娟陈竺
- 文献传递
