王丹 作品数:11 被引量:47 H指数:4 供职机构: 哈尔滨师范大学生命科学与技术学院 更多>> 发文基金: 黑龙江省科技攻关计划 国际科技合作与交流专项项目 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
ABF转录因子在植物响应非生物胁迫中的作用 被引量:10 2021年 非生物胁迫严重影响植物的生长发育及农作物的产量。植物激素脱落酸(ABA,abscisic acid)是植物响应非生物胁迫的重要信号分子,其介导的ABA信号途径在植物应答非生物胁迫过程中发挥关键作用,其中ABF(ABA-responsive element binding factors)转录因子在ABA信号途径中扮演着重要的角色。ABF转录因子是一类特异识别ABA响应元件(ABRE,ABA-responsive element)的碱性亮氨酸拉链蛋白,属于bZIP家族中的A亚族。它含有5个高度保守的结构域,C1、C2、C3、C4以及可以结合DNA序列的bZIP区域,这些保守结构域能够被蔗糖非酵解型蛋白激酶2(SnRK2,sucrose nonfermenting-1 related protein kinase 2)和钙依赖蛋白激酶(CDPK,calcium-dependent protein kinase)等多种蛋白激酶磷酸化,进而激活ABF蛋白的转录活性,使其参与ABA和逆境胁迫的调控表达。近年来,有较多研究发现不同物种中的ABF类转录因子在植物响应非生物胁迫的过程中具有重要作用。本文综述了ABF转录因子的结构特征及识别的顺式作用元件如G-ABRE、C-ABRE、"偶联元件3"(CE3,coupling element 3)等、调控修饰途径及其在盐、干旱、低温等非生物胁迫应答中的作用,并对未来ABF转录因子的研究方向进行展望,为通过调控ABF转录因子从而培育优良抗逆作物品种提供研究思路。 陈乃钰 张国香 张力爽 安逸民 杜家欢 王丹 郭长虹关键词:非生物胁迫 植物 人工神经网络在作物基因组选择中的应用 被引量:3 2011年 目前,基因组选择育种主要采用线性模型估计遗传育种值指导作物遗传育种的筛选过程,但是生物体内的基因以及遗传位点的关系主要是复杂的非线性调控。本研究将人工神经网络技术应用到作物基因组选择育种中,对现有的作物基因组选择育种模型进行优化,建立了高效的作物基因组选择预测系统,并与其他线性回归预测模型进行比较。通过分析小麦的育种数据发现,基于人工神经网络的遗传育种估计效果优于其他线性回归预测模型,预测育种值与实际育种值间的相关系数平均值达0.6636,相应的岭回归BLUP、贝叶斯线性回归模型和基于系谱信息的贝叶斯回归模型的预测能力分别为0.6422、0.6294和0.6573;最优预测效果达0.8379,远高于其他2种模型的最优结果。同时,基于人工神经网络的基因组选择模型的预测效果稳定,与传统的统计模型相近。因此,利用人工神经网络技术建立基因组选择是可行的。 束永俊 吴磊 王丹 郭长虹关键词:小麦 人工神经网络 小麦杀配子染色体单体附加系CS-2C的DNA甲基化变异分析 被引量:2 2016年 本研究利用MSAP方法检测普通小麦中国春(CS)、中国春-杀配子染色体2C单体附加系(CS-2C单体附加系)的DNA甲基化变异,探究DNA甲基化与杀配子染色体的关系。结果表明,CS-2C单体附加系5'-CCGG位点的胞嘧啶甲基化水平(45.33%)高于CS(40.35%),其中全甲基化率与半甲基化率均有所升高。与CS相比,CS-2C单体附加系的5'-CCGG位点发生了明显的胞嘧啶甲基化模式变异,以胞嘧啶甲基化升高为主,其中CG位点甲基化变异幅度高于CHG位点甲基化变异幅度。通过对甲基化差异片段进行测序鉴定,结果显示部分差异片段与普通小麦Sukkula-like转座子等具有高度同源性。由此推测,转座子可能在杀配子作用机制中起作用。本研究为揭示杀配子染色体的分子机制奠定了基础。 杨丽娟 敖游 王丹 白琰 赵洁宇 郭长虹关键词:小麦 染色体断裂 甲基化敏感扩增多态性 我国蛇类物种的现状及其保护 被引量:2 2011年 中国的蛇类种类十分丰富,但是由于人对自然界大肆的掠夺,使环境严重受到破坏,加之人类对蛇类资源的无休止的需求,导致我国的很多蛇类都面临灭绝的现状。本文主要对我国蛇类的多样性、分布及其现状、原因的分析,提出保护蛇类的一些建议。 王丹关键词:多样性 濒危现状 养殖 利用比较基因组学开发山羊草属InDel分子标记 被引量:13 2012年 为开发和利用小麦野生近缘种的优异基因,采用比较基因组学方法,通过拟斯卑尔脱山羊草EST(expressed sequencetag)与小麦UniGene序列的比对分析,发现山羊草插入/缺失(InDel)位点137个,在这些位点两端序列设计引物24对,通过在15个小麦野生近缘属种基因组DNA的扩增分析,发现11对引物具多态性,可以作为InDel标记。这些包含突变位点的基因涉及亚细胞定位、蛋白质结合与催化以及代谢等过程。 吴磊 王丹 苏文悦 郭长虹 束永俊关键词:比较基因组学 小麦 肌醇代谢在植物响应非生物胁迫中的作用 被引量:1 2024年 非生物胁迫制约了植物的生长和发育,降低作物的产量,严重时导致植物死亡。为了应对非生物胁迫,植物在进化过程中形成了一系列胁迫响应机制,包括肌醇(MI,myo-inositol)代谢途径。肌醇为一类化学性质稳定的极性小分子,植物可通过积累其糖苷类衍生物参与渗透调节途径,从而响应非生物胁迫。肌醇-1-磷酸合酶(MIPS,myo-inositol-1-phosphate synthase)、肌醇单磷酸酶(IMP,inositol monophosphtease)和肌醇加氧酶(MIOX,myo-inositol oxygenase)在肌醇的生物合成或分解过程中发挥作用,它们通过调控植物中肌醇的含量,以及后续一系列复杂的转化途径,参与L-抗坏血酸(L-AsA,Lascorbic acid)和部分细胞壁多糖的合成,响应盐、干旱、碱和低温等非生物胁迫。本文综述了肌醇的结构、生物学作用、肌醇代谢途径相关酶和肌醇衍生物在植物响应非生物胁迫中的研究进展,并对未来的研究方向进行了展望,旨在为利用肌醇代谢增强植物对非生物胁迫的抗性,培育抗逆植物品种提供理论基础。 于点 郭卫冷 丁炀 刘磊 郭睿 王丹 孙玉刚 郭长虹关键词:非生物胁迫 植物miRNA在调节低磷胁迫响应中的作用 被引量:6 2020年 植物MicroRNA(miRNA)是一类内源性非编码小分子RNA,它们参与调节植物的生长、发育和代谢过程中多种基因的表达。近期的研究发现miRNA参与调节磷的吸收和利用,对植物适应低磷胁迫具有重要作用。本文概述了植物磷吸收和转运的机制,介绍了低磷胁迫下miRNA的表达水平变化,重点对miRNA在植物响应低磷胁迫中的作用,如改变根系结构、提高磷的转运和再利用效率、参与花青素和抗氧化物生物合成等进行了综述,以期为揭示植物低磷胁迫响应分子机制,提高植物对磷的吸收效率提供借鉴。 潘晓阳 张文睿 王丹 申忠宝 郭长虹关键词:植物 MIRNA 低磷胁迫 紫花苜蓿CAX基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应分析 2022年 Ca^(2+)/H+反向转运蛋白(CAX)是一类重要的跨膜转运蛋白,在调控植物Ca^(2+)平衡、抵抗非生物胁迫和转运重金属离子等方面具有重要作用。利用生物信息学方法在全基因组水平对紫花苜蓿CAX基因家族进行了鉴定,并对其理化性质、结构特征、系统进化关系、顺式作用元件、染色体定位等进行了分析。结果表明,在紫花苜蓿全基因组中共筛选鉴定出15个MsCAX基因,分布于紫花苜蓿15条染色体上,发生22对基因片段重复事件,编码367~460个氨基酸,等电点为5。2~6。5,且均表现为疏水性蛋白。系统进化关系分析结果表明,MsCAXs分为2个亚家族,同一亚家族成员具有相似的基因结构、保守基序和跨膜结构域数量。MsCAXs启动子区域存在光响应性、激素反应性和胁迫响应元件。利用qRT-PCR分析了6个MsCAXs基因在非生物胁迫下的表达模式,结果表明,在干旱和低温胁迫下,6个MsCAX基因均显著下调表达,在盐和盐碱胁迫下,3个MsCAX基因上调表达。说明在不同的非生物胁迫下,MsCAXs基因表现出不同的表达模式。研究结果为进一步探索紫花苜蓿CAX基因家族的功能提供了参考。 张国香 郭卫冷 毕铭钰 张力爽 王丹 郭长虹关键词:紫花苜蓿 全基因组 非生物胁迫 基因表达 长穗偃麦草1E附加系与杀配子染色体2C附加系杂交后代的细胞学及形态学分析 被引量:1 2012年 长穗偃麦草是小麦的野生近缘种属,具有抗寒、抗旱、抗病等优异性状。为了利用长穗偃麦草的优异基因,将‘中国春’-长穗偃麦草1E二体附加系与‘中国春’-柱穗山羊草2C二体附加系杂交、自交和回交,观察其后代的细胞学和形态学特性。结果表明,在杂交后代有丝分裂和减数分裂中观察到了染色体畸变现象;统计F1代自交结实率,发现与亲本相比,这些杂种后代的结实率明显降低;杂种后代的穗型发生了分离,除正常穗型外还观察到了密穗型,说明杀配子染色体2C可以诱导染色体畸变并对结实率和穗型均有一定的影响。本研究为进一步创制小麦-长穗偃麦草1E染色体易位系和缺失系奠定了基础。 刘春影 杨蕾 王丹 郭长虹关键词:长穗偃麦草 细胞学 形态学 小麦B-box基因家族全基因组鉴定与表达分析 被引量:8 2021年 B-box(BBX)是一类含有1个或2个B-box结构域的锌指蛋白,在植物生长发育中起着重要作用。本研究明确小麦B-box转录因子的数量、基因结构和分类进化关系,研究各基因成员在不同组织中的特异性表达以及对非生物胁迫的响应。从小麦全基因组中鉴定得到87个B-box基因家族成员,所有TaBBXs蛋白均含有B-box结构域。TaBBXs编码146~489个氨基酸,理论等电点为4.32~10.42。染色体定位分析表明,TaBBXs分布在除1A、1B和1D之外的18条小麦染色体上。通过系统发育分析将TaBBXs划分为5个亚家族,有0~4个内含子。在同组内同一个系统进化树分支中的亚族成员具有高度相似的基因结构。qRT-PCR分析的20个TaBBXs基因,具有不同的组织表达模式,16个基因在叶中有较高表达,TaBBX10和TaBBX39仅在叶中有较高表达,而TaBBX74在穗中表达,TaBBX43在根中特异性表达。在不同逆境胁迫下,TaBBXs呈现不同表达模式,11个基因在低温胁迫后上调表达,12个基因在ABA处理后下调表达,盐胁迫后10个基因出现上调表达,干旱胁迫后7个基因出现下调表达,TaBBX10、TaBBX39、TaBBX60、TaBBX67和TaBBX74基因在2种或2种以上胁迫下有显著的上调表达。 王艳朋 凌磊 张文睿 王丹 郭长虹关键词:小麦 全基因组 非生物胁迫 基因表达