王禹
- 作品数：11 被引量：11H指数：2
- 供职机构：西北农林科技大学动物科技学院更多>>
- 发文基金：国家生猪现代产业技术体系建设项目国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生更多>>
- 基于全基因组重测序SNP分析宁蒗高原鸡保种群的群体遗传多样性和群体遗传结构
- 2024年
- 旨在分析宁蒗高原鸡保种群的群体遗传多样性和群体遗传结构,以期更好的保护和利用宁蒗高原鸡这一种质资源。本研究利用全基因组重测序技术检测宁蒗高原鸡(n=57)、大围山微型鸡(n=20)、尼西鸡(n=11)和独龙鸡(n=10)群体的单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP),以群体观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态性标记比例(P_(N))、核苷酸多态性(Pi)、次等位基因频率(Maf)以及连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)衰减情况分析群体遗传多样性;使用主成分分析、系统发育树、群体结构分析探究不同品种的群体遗传结构;以群体分化指数(Fst)评估品种间的分化程度,以状态同源(identity by state,IBS)、G矩阵和群体近交系数(F ROH)分析宁蒗高原鸡保种群体的亲缘关系。结果显示,宁蒗高原鸡群体的观测杂合度(Ho)为0.212,小于其0.221的期望杂合度(He),而大围山微型鸡、独龙鸡和尼西鸡的Ho均高于He,表明宁蒗高原鸡群体遗传多样性较为丰富;LD衰减分析表明,4个品种的衰减速度由快到慢依次为宁蒗高原鸡、大围山微型鸡、尼西鸡、独龙鸡,说明宁蒗高原鸡群体遗传多样性最高,基因组受选择程度最低;主成分分析和系统发育树结果表明,宁蒗高原鸡分为3个支系,大围山微型鸡与宁蒗高原鸡、独龙鸡和尼西鸡之间的遗传背景差异较大;群体结构分析显示,当K=2时为最优分群数,宁蒗高原鸡血统较为复杂,独龙鸡和尼西鸡血统较为相似;群体遗传分化结果发现,宁蒗高原鸡与大围山微型鸡、尼西鸡、独龙鸡之间均出现中等程度的分化,而独龙鸡和尼西鸡之间的遗传分化指数较小;IBS矩阵和G矩阵分析发现,宁蒗高原鸡保种群体间大部分个体亲缘关系较远,少数个体亲缘关系较近。以上结果表明,宁蒗高原鸡与大围山微型鸡、尼西鸡、独龙鸡之间均存在中等程度的分化,宁蒗高原鸡保种群体的遗传�
- 徐扩卫李卓辉冷堂健熊宝周杰珑郭盘江王禹陈粉粉
- 关键词：全基因组群体遗传多样性群体遗传结构
- 脂肪组织特异性PU.1敲除小鼠的鉴定及其活体脂肪和肌肉含量分析被引量：1
- 2014年
- 本研究运用基因工程和同源重组等技术,产生了脂肪组织特异性PU.1敲除小鼠(aP2-cre-PU.1fl/fl),并用PCR技术进行基因型判定。Western blot结果表明,与PU.1fl/fl小鼠相比,aP2-cre-PU.1fl/fl小鼠脂肪组织PU.1蛋白表达显著降低,达到敲除水平。在此基础上,对1~6月龄的PU.1fl/fl和aP2-cre-PU.1fl/fl小鼠体重和活体成分进行了分析。研究发现,aP2-cre-PU.1fl/fl小鼠在出生后第5和第6月龄体重显著高于PU.1fl/fl小鼠(P<0.05);6月龄时,肌肉量无显著差异,但aP2-cre-PU.1fl/fl小鼠脂肪量明显高于PU.1fl/fl小鼠(P<0.05)。结果提示,aP2-cre-PU.1fl/fl小鼠脂肪重量的增加是其体重增加的主要原因。脂肪组织特异性PU.1敲除小鼠的生产为深入研究PU.1基因在体调控脂肪生成的功能奠定了基础,也为探索PU.1基因控制家畜体脂沉积提供了理论依据。
- 庞卫军卫宁王禹熊燕童强杨公社
- 关键词：脂肪肌肉
- 长链非编码RNA的生物学功能研究进展被引量：1
- 2014年
- 长链非编码RNA(lncRNA)是转录本长度超过200个核苷酸(nt)的,可在表观遗传、转录以及转录后等多层面上调控基因表达的一类RNA。高通量转录组分析结合RNA-免疫共沉淀等研究揭示了lncRNA与DNA、mRNA、miRNA和蛋白的相互作用及其过程中的重要调控功能。论文从lncRNA的概念、分类、生物学功能及其在癌症等疾病发生、发展中的作用等方面系统介绍了该领域最新研究成果,为深入研究lncRNA在机体代谢和相关疾病中的调控功能提供参考。
- 王国强卫宁王禹庞卫军
- 关键词：长链非编码RNA表观遗传转录调控转录后调控生物学功能疾病
- 白唇鹿的微卫星遗传多态性分析被引量：5
- 2011年
- 为科学评价、保护和利用白唇鹿资源,采用微卫星DNA标记技术,从牛微卫星引物中筛选出13对引物对38头白唇鹿进行遗传多样性分析。结果显示,共检测到39个等位基因,其中位点RT1、RT13、CSSM19呈单态性;其余10个位点中,多态信息含量(PIC)和杂合度(He)分别为0.049 9～0.652 6,0.051 9～0.702 8,白唇鹿群体的平均PIC为0.320 2,平均期望He为0.396 5。Shannon信息指数(I)为0.121 7～1.369 3,平均为0.694 2。位点NVHRT48的3项指标都最大,说明其变异水平最高,具有明显的遗传优势。3项指标都表明白唇鹿群体属于中度多态性,应加以重点保护和合理利用。研究结果进一步验证了PIC与He的相关性。
- 任战军熊建杰邓铸疆何婷宋旭旭靳程李军亮王禹张慧
- 关键词：白唇鹿微卫星标记遗传多态性
- 脂肪及肌肉生成相关基因天然反义转录本的预测及鉴定
- 王禹卫宁许儒祥熊燕毋文静庞卫军
- 猪LEF-1基因多态性与总乳头数性状关联性分析
- 许儒祥卫宁熊燕王禹毋文静庞卫军
- 关键词：SNP性状关联分析
- 过表达miR-155抑制C2C12成肌分化被引量：4
- 2014年
- 为明确miR-155在C2C12成肌分化中的作用及分子机制,本研究构建了miR-155过表达腺病毒载体,运用过表达miR-155的腺病毒感染C2C12,并诱导其成肌分化。通过形态学观察,成肌标志基因mRNA和蛋白表达水平的检测,以及双荧光素酶报告基因系统对预测的miR-155靶基因(TCF4)的验证,结果表明,C2C12细胞分化中,过表达miR-155明显降低了肌管的形成,成肌标志基因MyoG和MyHC的mRNA表达量极显著地下降(P<0.01),而MyoD差异不显著(P>0.05),成肌标志基因蛋白检测结果与mRNA检测结果一致;进一步研究显示miR-155与预测的TCF4基因的3'UTR 3个靶点(1487-1493,1516-1522,4532-4583)中的1个(4532-4538)结合,并发现过表达miR-155显著降低了TCF4的mRNA水平(P<0.05)。表明miR-155可能通过靶向TCF4抑制C2C12成肌分化。
- 熊燕王禹卫宁许儒祥杨公社庞卫军
- 关键词：MIR-155C2C12成肌分化TCF4腺病毒
- 干扰C1q肿瘤坏死因子相关蛋白6(CTRP6)抑制3T3-L1前体脂肪细胞的分化
- 毋文静宋子仪熊燕李岳峰卫宁王禹庞卫军杨公社
- 关键词：脂肪因子SIRNA
- 过表达miR-155抑制C2C12成肌分化的作用及其分子机制
- 熊燕王禹卫宁许儒祥杨公社庞卫军
- 关键词：MIR-155C2C12成肌分化TCF4腺病毒
- 猪PU.1反义长链非编码RNA的鉴定及干扰载体的构建
- 卫宁王禹许儒祥熊燕毋文静庞卫军
- 关键词：AS
