王立贵
- 作品数：10 被引量：17H指数：2
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- 相关领域：生物学医药卫生农业科学更多>>
- 补体在流感病毒/金葡菌共感染致严重肺炎中的作用研究
- 研究目的:基于已有工作基础,研究补体调节在流感病毒/金葡菌共感染所致严重肺炎中的激活情况;利用补体抑制物与补体缺陷小鼠,研究补体与严重肺炎的关系及对死亡率的影响;通过补体抑制物治疗流感病毒/金葡菌共感染所致严重肺炎,探索...
- 梁媛王立贵张江云郝荣章张传福杨明娟谢靖李鹏杜昕颖孙岩松邱少富贾雷立宋宏彬
- 关键词：流感共感染补体致病机制
- 文献传递
- 基于机器学习的细菌sRNA基因预测研究
- 细菌sRNA是一类长度在40～500nt之间,以RNA形式发挥作用的一类分子,功能多样。现有研究表明,细菌sRNA在细菌的转录调节、RNA加工与修饰、mRNA稳定性与翻译、以及蛋白质降解、质粒复制和细菌感染等方面发挥重要...
- 王立贵
- 关键词：SRNA细菌
- 文献传递
- 基于SVM方法构建细菌sRNA靶标预测模型
- 2008年
- 目的:为实验方法鉴定细菌sRNA靶标和研究sRNA功能提供生物信息学支持。方法:首先以实验证实的132个sRNA与靶标相互作用数据为训练集,其中包含46个阳性数据和86个阴性数据;其次,以实验证实的22个阳性数据和随机生成的1 700个阴性数据为测试集;最后以RNA二级结构谱等特征为变量,运用支持向量机(SVM)方法构建sRNA靶标预测数学模型。结果和结论:构建的模型对训练集的敏感性和特异性均为100%,对测试集的敏感性和特异性分别为72.73%和80.65%。所构建的数学模型为实验发现sRNA靶标提供了生物信息学支持。
- 赵雅琳李华侯妍妍查磊曹源王立贵应晓敏李伍举
- 关键词：SRNA靶标SVM
- 基于RNA-Seq技术发现福氏志贺菌新sRNA及探讨其致病机制研究
- 目前研究表明，sRNA（small regulatory RNAs）在细菌生命的各个环节均发挥着重要调控作用，细菌10％－30%的基因受sRNA调控，如sRNA参与了细菌环境耐受、质粒复制和细菌入侵等重要功能调节。为此，...
- 王立贵
- 关键词：福氏志贺菌致病机制高通量测序
- 文献传递
- 补体在流感病毒/金葡菌共感染致严重肺炎中的作用研究
- 研究目的：基于已有工作基础，研究补体调节在流感病毒/金葡菌共感染所致严重肺炎中的激活情况;利用补体抑制物与补体缺陷小鼠，研究补体与严重肺炎的关系及对死亡率的影响;通过补体抑制物治疗流感病毒/金葡菌共感染所致严重肺炎，探索...
- 梁媛王立贵张江云郝荣章张传福杨明娟谢靖李鹏杜昕颖孙岩松邱少富贾雷立宋宏彬
- 关键词：流感共感染补体致病机制
- pBV220载体中外源基因高效表达的自动化设计被引量：2
- 2009年
- pBV220载体是国内科学家构建的原核系统表达载体,目前仍在广泛应用.但是,实现外源基因的高效表达需要综合考虑诸如RNA二级结构等多种因素,极其耗时费力.为此,基于我们提出的pBV220载体中外源基因高效表达数学模型,编写了外源基因高效表达的自动化设计软件,并可定性用于原核系统其它载体中外源基因表达水平分析,最终为加快实验进程提供帮助.
- 查磊应晓敏王立贵曹源骆志刚苑波李伍举
- 关键词：PBV220自动化设计
- 细菌sRNA基因及其靶标预测研究进展被引量：8
- 2009年
- 细菌sRNA是一类长度在40-500 nt之间的非编码RNA，主要以不完全碱基配对方式与靶标mRNA5′端相互作用进而发挥其生物学功能。鉴于预测方法可以为细菌sRNA及其靶标的实验发现提供指导，因此，细菌sRNA与靶标预测研究受到了广泛重视。文章首先将sRNA预测方法分为3类，分别是基于比较基因组学的预测方法、基于转录单元的预测方法和基于机器学习的预测方法；其次，将sRNA靶标预测方法分为2类，分别是序列比较方法与基于RNA二级结构的预测方法；最后对各类方法的原理、核心思想、优点和局限性进行了分析，并探讨了进一步的发展方向。
- 王立贵赵雅琳李伍举
- 关键词：SRNA靶标细菌
- 我国食源性疾病现状与防控被引量：4
- 2012年
- 食源性疾病是指通过摄食而进入人体的致病因子所造成的人体感染性或中毒性疾病。据报告,在发达国家,每年罹患食源性疾病的人口比例高达30%。例如在美国,估计每年发生7600万例食源性疾病,造成325000人次住院和5000人死亡[1]。而在我国平均每年食源性疾病暴发事件数十万起,发病人数逾千万人次[2]。
- 王汉斌王立贵宋宏彬蒲卫
- 关键词：食源性疾病疾病防控食物中毒中毒性疾病
- 羊布鲁氏菌非编码小RNA分子BSR-2的预测与鉴定被引量：2
- 2010年
- 利用RT-PCR和RACE等方法对生物信息学预测的羊布鲁氏菌非编码小RNA(smallnon-codingRNA,sRNA)BSR-2进行了实验鉴定,并通过分析BSR-2在胞内生存缺陷株中的转录情况以及预测BSR-2的靶标基因对BSR-2的功能进行初步探讨.RT-PCR结果表明,BSR-2在羊布鲁氏菌的总RNA中存在转录本,而且在不同的应激条件下转录水平不同.RACE结果表明,BSR-2长224nt,位于Ⅱ号染色体的BMEII0742和BMEII0743之间的基因间区.进一步的实验结果表明,BSR-2可能与布鲁氏菌的胞内生存能力相关.
- 王同坤王立贵陈泽良杜昕颖汪舟佳黄留玉刘波王玉飞
- 关键词：布鲁氏菌靶基因
- sRNASVM——基于SVM方法构建大肠杆菌sRNA预测模型(英文)被引量：1
- 2009年
- 在理解细菌与环境的相互作用方面,细菌sRNA的识别发挥重要作用。文章介绍了一个通过增加训练集中实验证实的sRNA来构建细菌sRNA预测模型的策略,并以大肠杆菌K-12的sRNA预测为例来说明策略的可行性。结果表明,按此策略构建的模型sRNASVM的10倍交叉检验精度达到92.45%,高于目前文献中报道的精度。因此,构建的这一模型将为实验发现sRNA提供较好的生物信息学支持。有关模型和详细结果可以从网站http://ccb.bmi.ac.cn/srnasvm/下载。
- 王立贵应晓敏曹源查磊李伍举
- 关键词：SRNA
