马国正 作品数:46 被引量:104 H指数:5 供职机构: 华南师范大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省自然科学基金 广东省科技计划工业攻关项目 更多>> 相关领域: 理学 电气工程 文化科学 化学工程 更多>>
静电和疏水效应对SARS冠状病毒3CL蛋白酶二聚体稳定性的影响 被引量:2 2005年 从 TGEV 3 CL蛋白酶二聚体结构出发 ,研究了 TGEV 3 CL蛋白酶二聚体单体之间的静电和疏水相互作用 .蛋白质的静电相互作用通过有限差分方法求解 Poisson-Boltzmann方程得到 ,疏水相互作用通过分析溶剂可及性表面模型得到 .考察了不同 p H值对 SARS3 CL蛋白酶二聚体静电和疏水相互作用的影响 ,在p H=5 .5~ 8.5时 ,二聚体静电相互作用能、静电去溶剂化能和疏水自由能都具有较小的数值 ,表明在该条件下静电和疏水相互作用有利于二聚体的稳定存在 .由于 SARS 3 CL蛋白酶活性模式为二聚体 ,因此 ,在该p H值范围内 ,有利于蛋白酶保持活性 .在 p H=7.0条件下 ,蛋白酶单体之间具有最强的静电和疏水相互作用 ,从而使蛋白酶具有最强的活性 ,这与实验结果相一致 .p H值对静电去溶剂化能的影响大于疏水自由能 ,表明静电作用是造成强酸或强碱条件下二聚体不能稳定存在的主要原因 . 郑柯文 俞庆森 蒋勇军 马国正 赵文娜 曾敏关键词:SARS 静电作用 疏水作用 PH值 DNA小沟结合药物DB818的分子动力学模拟和结合自由能分析 被引量:3 2009年 采用分子动力学模拟了DNA小沟结合芳香二脒药物DB818形成的复合物.通过5ns的模拟研究表明:DB818药物分子可紧密结合在DNA的AATTC小沟区域,和双螺旋d[CGCGAATTCGCG]2形成稳定的复合物.由于噻吩硫原子的弱电负性,使DB818能够以更大的伸展程度与DNA的小沟结合,形成更强的结合力.DB818苯并咪唑的氮原子能够与DNA7位和19位T碱基上的氧原子形成两个稳定的氢键,同时,DB818末端氨基氮原子分别与DNA的20位T碱基的氧原子和9位C碱基的氧原子形成两个氢键.另外,运用MM_PBSA方法计算了DB293-DNA和DB818-DNA复合物的结合自由能,计算结合能与实验值能较好的吻合,通过比较其结合自由能,从热力学能量角度说明了DB818有较大的熵值与较小的焓值贡献,从而与DNA小沟结合的结合力比DB293强.本文在分子水平上提供了DB818直接与双螺旋DNA相互作用的结构及复合物的动态变化情况,为设计出更高生物活性的DNA小沟结合剂提供一定的理论依据. 马国正 刘聪 求亚芳 南俊民关键词:DNA 动力学模拟 球形氧化锌/石墨烯复合材料的制备及其对铅酸电池循环寿命的影响 被引量:2 2020年 采用水热法制备了球形氧化锌/石墨烯(S-ZnO/rGO)复合材料,首先采用水热法制备S-Zn O,再将氧化石墨(GO)和S-Zn O的混合水溶液在180℃下水热反应12 h,最终得到S-ZnO/rGO复合材料.以S-ZnO/rGO复合材料为铅酸蓄电池负极添加剂,探究了0.5%、1.0%、1.5%、2.0%这4种添加质量分数对铅酸电池电化学性能的影响.电化学测试结果表明:电池在高倍率部分荷电状态(HRPSoC)下的循环寿命随着复合材料添加质量分数的增加先增大后减小,其中掺入1.0%S-ZnO/rGO复合材料的电池在HRPSoC下循环性能最好,寿命可达19158次,比普通铅酸蓄电池的寿命(7210次)延长了165.7%.由此表明添加S-ZnO/rGO复合材料能够改善负极板的硫酸盐化现象,从而提高电池的循环稳定性. 徐绮勤 马国正 吴宝珠 陈红雨关键词:水热法 铅酸电池 太阳能级多晶硅除硼热力学分析 <正>本文采用自行设计的真空熔炼炉、定向凝固炉对太阳能级多晶硅在不同的渣系条件下进行除硼探究,实验后用电感耦合等离子原子发射光法(ICP-AES)和扫描电子显微镜(SEM)法 林涛 胡玉燕 卢东亮 田俊 马国正 郭长娟 孙艳辉 李核 陈红雨 李前树关键词:硼 渣系 热力学分析 文献传递 诺氟沙星-DNA复合物的分子动力学模拟 被引量:8 2007年 采用分子模建的方法构建了诺氟沙星-DNA复合物的初始结构,通过2 ns的分子动力学(MD)模拟研究表明:诺氟沙星能够和双螺旋d[ATATCGATAT]_2形成稳定的复合物,药物分子可紧密结合在DNA的小沟区域,并且能够与DNA的鸟嘌呤碱基形成两个稳定的氢键.在分子水平上提供了诺氟沙星直接与双螺旋DNA相互作用的结构及复合物的动态变化情况. 马国正 蒋勇军 俞庆森关键词:诺氟沙星 DNA 分子模建 分子动力学模拟 双CPU计算服务器MPI并行环境的实现及其在生物大分子动力学模拟中的应用 被引量:1 2007年 在Red Hat Linux 9.0操作系统环境下,通过建立双CPU服务器,并采用MPICH并行技术,实现双CPU的并行计算。采用分子动力学模拟程序Amber 7.0分析双CPU并行系统的计算效率,结果表明:该并行系统能够有效地利用现有计算资源,同时计算效率得到较大幅度地提高。在该系统的基础上,采用分子动力学模拟计算生物大分子核酸与药物小分子复合物,在分子水平上提供了较详细、明确的结构变化情况。 马国正 南俊民关键词:双CPU 并行计算 分子动力学 基于HPPK靶标酶的分子对接研究——金属离子Mg^(2+)的影响 被引量:5 2005年 6-羟甲基-7,8-二氢喋呤磷酸化酶(HPPK)催化细菌进行叶酸合成反应中的第一步,即焦磷酰从三磷酸酰酐(ATP)转移到6-羟甲基-7,8-二氢喋呤(HP),被认为是基于结构虚拟筛选新型抗生素的理想靶标.本工作分别以HPPK和含有金属离子Mg2+的HPPK为受体,以底物类似物为配体进行了对接,发现活性口袋大小、金属镁离子对对接结果有较大的影响.特别是金属镁离子的加入不仅可大大提高对接结果的可信度,同时可增加虚拟筛选的命中率.这一结果将为设计新的HPPK抑制剂提供一定的理论指导. 赵文娜 邹建卫 蒋勇军 马国正 俞庆森关键词:MG^2+ 叶酸 受体 新型抗生素 羟甲基 海藻酸辅助合成5V正极材料LiNi_(0.5)Mn_(1.5)O_4 2015年 首次利用海藻酸为模板剂,辅助合成了Fd3m空间群结构的锂电正极材料Li Ni0.5Mn1.5O4,同时分析了其结构、形貌及电化学性能等.与普通共沉淀法相比,海藻酸辅助制备的样品表现出了良好的形貌特征和电化学性能.X射线衍射(XRD)和扫描电子显微镜(SEM)观察的结果表明:制备的材料结晶度较高,颗粒晶型完整并达到微-纳级别.充放电测试结果表明:0.2C第一次放电表现出127.8 m Ah/g的比容量,且50次循环保持率在99%以上.同时,循环伏安(CV)和交流阻抗(EIS)测试结果可很好的解释其容量较高的原因. 马国正 张瑜 赵瑞瑞关键词:海藻酸 呋喃二脒抗寄生虫衍生物的3D_QSAR研究 2009年 应用分子场分析法(MFA)对一系列呋喃二脒类抗寄生虫衍生物进行了三维定量构效关系研究,采用偏最小二乘法建模,得到了一个良好的统计模型,r2=0.963,r2cv=0.940.利用该模型对随机选取的4个化合物组成的测试集进行了预测,外在预测的r2pred值达到0.953. 马国正 罗东升关键词:三维定量构效关系 偏最小二乘法 冶金级硅除钛的研究 <正>本文提出了一种从冶金级硅中去除杂质钛的简单方法。实验表明,低温处理过的硅粉,经湿法浸出后,纯度比未经低温处理的有很大提高。利用扫描电镜(Scanning electron 卢东亮 胡玉燕 林涛 田俊 马国正 郭长娟 孙艳辉 李核 陈红雨 李前树关键词:湿法浸出 文献传递