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叶琳
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
供职机构:
华大基因研究中心
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相关领域:
生物学
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合作作者
陈艳炯
西安交通大学医学院法医学系
邓亚军
西安交通大学医学院法医学系
耿佳宁
北京华大基因研究中心
李生斌
西安交通大学医学院法医学系
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作者
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叶琳
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李生斌
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耿佳宁
1篇
邓亚军
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陈艳炯
传媒
1篇
第四军医大学...
年份
1篇
2003
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家猪百日胚胎胸腺的基因表达谱
被引量:1
2003年
目的 :构建家猪 1 0 0d胚胎胸腺基因表达谱 ,为研究胸腺的发育和分化机制奠定基础 .方法 :随机挑取家猪1 0 0d胸腺cDNA文库 (FTY)的 1 1 71 2个克隆 ,进行单向全自动大规模测序 ,去污染后共获得 70 71个高质量的表达序列标签 (EST)用于基因表达分析 .结果 :对 70 71个高质量EST的聚类分析结果获得 95 9个多拷贝基因和 30 74个单拷贝基因 .与非冗余的核酸数据库、Swiss Prot数据库及人、牛和鼠的U nigene数据库进行BLAST ,发现 80 6个多拷贝基因和 1 6 6 9个单拷贝基因 (共计 5 4 4 2个ESTs)与已知序列有同源性 ,1 6 2 9个EST没有发现同源序列被认为是新基因 .根据功能将已知基因归为 7类 ,其中基因表达相关基因占 36 .99% ,胸腺特异的防御功能相关基因有一定程度表达 (占 7.5 5 % ) ,这与人婴儿胸腺基因表达谱相类似而不同于成年人胸腺组织 .将 1 0 9个既发现有ORF又具有PolyA的多拷贝新基因与人类基因组框架序列进行BLAST ,发现其中 5 8个有同源序列 .结论 :EST技术是发现新基因的有效手段之一 ;此期家猪胸腺仍处于发育阶段 .
陈艳炯
邓亚军
叶琳
耿佳宁
李生斌
关键词:
EST
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