李慧莹 作品数:37 被引量:261 H指数:7 供职机构: 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 国家自然科学基金 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
中国2006-2007年诺如病毒胃肠炎暴发及其病原学特征分析 被引量:95 2010年 目的了解中国2006-2007年诺如病毒胃肠炎暴发及其病毒基因型别。方法收集2006-2007年19起胃肠炎暴发的流行病学资料以及腹泻粪便样本,用RT-PCR方法对201份粪便标本进行诺如病毒、轮状病毒、星状病毒、腺病毒和札如病毒检测,对扩增产物进行序列测定。用Clustal X1.83和MEGA4.0生物软件对诺如病毒序列进行序列比对和系统进化分析。结果诺如病毒是引起病毒性胃肠炎暴发的主要病原之-(12/19,63.2%)。在12起诺如病毒胃肠炎暴发中,变异株GⅡ-4/2006b是引起暴发的流行优势株(11/12,91.7%),其他型别包括GⅡ-17、GⅡ-6和GⅡ-3。诺如病毒引起的疫情暴发主要集中在冬春季节(12月至4月),发生场所多样,且各年龄组人群均有发病。同时,12起诺如病毒暴发中有2起与其他腹泻病毒混合感染,且在同一起暴发中病原具有病毒多样性和基因型别多样性。结论诺如病毒是2006-2007年引起胃肠炎暴发疫情的主要病原之一,变异株GⅡ-4/2006b为流行优势株。 靳淼 孙军玲 常昭瑞 李慧莹 刘娜 章青 崔淑娴 张静 王子军 段招军关键词:诺如病毒 胃肠炎 基因分型 诺如病毒广州株GZ20133135全基因组序列测定及分析 被引量:5 2014年 目的 分析GⅡ-4型诺如病毒广州株GZ20133135全基因组序列,了解其分子结构特点及基因组类型.方法 根据Sydney2012参考株全序列设计引物,用RT-PCR分段扩增诺如病毒全基因组,经分子克隆、测序后进行系统进化分析.结果 GⅡ-4型NoVs广州株GZ20133135病毒基因组全长7566 bp,病毒基因组分三个开放阅读框(ORFs),ORF1、ORF2及ORF3长度分别为5100 bp、1623 bp和807 bp,ORF1与ORF2之间有19个核苷酸重叠.广州株GZ20133135基因组核苷酸序列与参考株GⅡ-4型Sydney2012变异株同源性最高,全长同源性为99.07%.根据系统进化分析,广州株GZ20133135株属于GⅡ-4 Sydney2012变异株.通过对衣壳区氨基酸比对,Sydney2012变异株位点变化情况为:aa294V或A或P→T,aa296S或T→S,aa297H或Q→R,aa298D或N或T→N,aa368T或N或S或A→E,aa372 N或S→D,aa393 N或D或S,aa394 T或G或S→T,aa395T或A→T,aa407 N或D→S,aa412T或D→N,aa413G或I→T.结论 诺如病毒广州株GZ20133135与参考株Sydney2012NSW0514同源性最高,属于GⅡ-4Sydney2012变异株.全长序列可应用于流行病学诊断、疫苗开发、预测新变异株的出现及诺如病毒流行株进化研究. 田毅 裴银辉 靳淼 谢华萍 陈克娜 李慧莹 段招军关键词:诺如病毒 基因 2012-2014年乌鲁木齐市5岁以下急性腹泻儿童患者诺如病毒感染及基因型研究 被引量:6 2018年 目的了解2012—2014年新疆维吾尔自治区(新疆)乌鲁木齐市<5岁住院儿童患者诺如病毒的分子流行病学特征。方法收集2012—2014年乌鲁木齐市895例<5岁急性腹泻儿童患者粪便标本和流行病学资料,应用实时荧光反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析。结果诺如病毒的检出率为16.8%(150/895),不同年份阳性率差异有统计学意义(χ2=21.080,P<0.05);不同年龄组阳性率差异有统计学意义(χ2=13.367,P=0.020)。137份样本获得聚合酶区序列,其中89份获得衣壳蛋白区序列。聚合酶区和衣壳区分别包括11和9个基因型。根据89株双分型结果,GⅡ.4 Den Haag 2006b和GⅡ.Pe/GⅡ.4 Sydney 2012分别占21.3%和32.6%,GⅡ.P12/GⅡ.3占29.2%。根据衣壳区分型结果,在GⅡ.4基因型中,2012—2014年GⅡ.4 DenHaag 2006b所占比例分别为90.0%、0%和0%;GⅡ.Pe/GⅡ.4Sydney 2012所占比例分别为10.0%、100%和100%。结论新疆乌鲁木齐市急性腹泻儿童诺如病毒具有遗传多样性;GⅡ.Pe/GⅡ.4 Sydney 2012在新疆地区出现,逐渐替代GⅡ.4 DenHaag 2006b成为新的流行优势株。 沙比热木·托合塔木 肖克来提·努尔 周海健 靳淼 孔翔羽 周永康 李慧莹 段招军 马合木提关键词:诺如病毒 基因型 腹泻 双重荧光定量一步RT-PCR法同时检测GⅠ、GⅡ型诺如病毒 被引量:14 2013年 建立一种可同时检测诺如病毒GⅠ和GⅡ型的双重荧光定量一步法RT-PCR方法。应用针对GⅠ型和GⅡ型诺如病毒的特异性引物以及Taqman探针,优化反应体系及条件,建立双重荧光定量一步法RT-PCR方法。对该方法的灵敏度、特异性、重复性进行评估,并对粪便标本进行检测,以传统RT-PCR方法作为参考评价此方法。结果表明,该方法特异性强,与肠道腺病毒、轮状病毒、星状病毒均无交叉反应,对GⅠ和GⅡ型诺如病毒核酸的最低检出限分别可达103拷贝/μL,具有很好的重复性。对100份粪便标本进行检测,诺如病毒的阳性率为31%,其中GⅠ型为3%,GⅡ型为28%,而传统RT-PCR法的检出率为22%。本文建立的双重荧光定量一步RT-PCR法能同时对GI和GII型诺如病毒进行快速检测,其灵敏度高、特异性好,可应用于胃肠炎病人中检测诺如病毒。 周冬梅 靳淼 李慧莹 徐子乾 段招军关键词:诺如病毒 一步法 RT-PCR GII.12型诺如病毒与受体HBGAs结合模式分析 被引量:1 2015年 为阐明GII.12型诺如病毒与组织血型抗原(Histo-blood group antigens,HBGAs)受体结合模式,本研究首先合成GII.12型诺如病毒毒株Pune株(GenBank登录号:EU921353)P区基因序列,并在原核系统中表达P蛋白,利用快速液相色谱分析鉴定P粒子的形成,将P粒子免疫小鼠,应用HBGAs表型明确的唾液样本分析P粒子的HBGAs结合模式。通过唾液结合分析,GII.12型诺如病毒Pune株与B型、AB型唾液结合较高,与A型、O型分泌型及O型非分泌型唾液结合较低,表明GII.12型诺如病毒与B抗原亲和性更高,这与先前GII.12型诺如病毒晶体结构的研究一致。这些研究提示,B型、AB型个体相对于其他血型个体,可能对GII.12型诺如病毒更具易感性。GII.12型诺如病毒与B抗原有更高的亲和性,为GII.12型诺如病毒的预防和控制提供了科学基础。 靳淼 陈克娜 宋敬东 李慧莹 章青 孔翔羽 刘娜 高基民 段招军关键词:诺如病毒 急性胃肠炎 深圳地区诺如病毒感染及其与宿主受体相互作用的分子流行病学研究 何雅青 段招军 靳淼 杨洪 李慧莹 张海龙 陈龙 孔翔羽 姚相杰 吴微 冼慧霞 杨小柯 陈惠玲 在国内率先建立涵盖市、区疾控中心、哨点医院的深圳地区诺如病毒监测网络,并连续10年对诺如病毒腹泻进行主动、全面的监测,为深圳地区诺如病毒腹泻的科学防治提供了第一手宝贵的资料。建立多种诺如病毒检测方法,其中发明专利“轮状病...关键词:关键词:诺如病毒感染 腹泻 基于受体捕获诺如病毒检测方法的特异性及应用 被引量:1 2018年 目的评价新型感染性诺如病毒检测方法原位捕获反转录实时定量PCR(In situ capture realtime quantitative reversetranscription polymerase chain reaction,ISC-RT-qPCR)的特异性,并将其应用于新鲜草莓中诺如病毒的检测。方法以诺如病毒GⅡ组不同基因型和不同浓度的临床粪便标本评价ISC-RT-qPCR方法的特异性。此外,利用ISC-RT-qPCR方法对以GⅡ组诺如病毒人工污染新鲜草莓样本进行检测。结果ISC-RT-qPCR可特异性检测所有GⅡ诺如病毒8种基因型临床腹泻样本;与传统RT-qPCR相比,检测的Ct值并未随着诺如病毒滴度的降低而升高。人工污染新鲜草莓的ISC-RT-qPCR检测限为1.36基因组拷贝数。结论ISC-RT-qPCR是一种可用于临床腹泻样本和草莓中GⅡ组感染性诺如病毒的检测方法,为食品中诺如病毒的检测与监测提供了技术储备。 李慧莹 王飞 王大鹏 靳森 程露阳 段招军关键词:诺如病毒 草莓 通用引物高通量测序扩增GⅡ.4 Sydney[P31]型诺如病毒基因组及进化分析 被引量:1 2022年 目的分析2017至2020年我国诺如病毒流行株GⅡ.4 Sydney[P31]基因型的基因组以及变异情况。方法利用通用引物初步建立GⅡ组诺如病毒基因组扩增方法,扩增GⅡ.4 Sydney[P31]株基因组,并应用高通量测序技术对其基因组测序,对GⅡ.4 Sydney[P31]株进行系统进化分析和关键位点分析。结果利用初步建立的GⅡ组基因组扩增方法,8株GⅡ.4 Sydney[P31]株中,6株扩增成功并获得基因组序列。通过系统进化分析表明,本研究获得的自2017—2020年6株毒株和2015—2019年的GⅡ.4 Sydney[P31]参考株划为一簇,2013年我国毒株GZ20133135株与2012—2014年GⅡ.4 Sydney[P31]参考株划为一簇。血型抗原受体结合位点(HBGAs)分析表明2014年以后的毒株在SiteⅡ发生了氨基酸突变Asp372Asn。通过抗原表位分析,2017年以后的毒株,在A表位(297、372和373)、B表位(333)、E表位(414)和H表位(309、310)都发生了变化;2020年的毒株20HN261和20HN253株在A表位(368)和G表位(355)较之前的毒株出现了新变化。结论本研究确定了我国流行株GⅡ.4 Sydney[P31]基因组关键位点变异情况,跟踪新毒株的出现提供了科学依据,为针对我国流行株疫苗研发设计提供了基础数据。 朱曦 王鹏飞 闫玉晓 章青 李慧莹 靳淼 段招军关键词:诺如病毒 基因组 系统进化分析 热力及紫外线对鼠诺如病毒的消毒作用分析 被引量:1 2020年 目的检验热力及紫外线对鼠诺如病毒(murine norovirus,MNV)的消毒效果,完善预防人诺如病毒(human norovirus,HuNV)感染的消毒措施。方法通过半数组织培养感染剂量(median tissue culture infective dose,TCID50)检测在不同温度、不同作用时间等条件下热力及紫外线对MNV的消毒效果。结果MNV在4℃、25℃下可以稳定存在14 d,在37℃下可以维持5 d。在56℃下30 min、58℃下5 min、60℃下1 min作用MNV均可达到消毒效果。在距离紫外光源15 cm或30 cm处辐射7.5 min,以及在距离紫外光源1 m或2 m处辐射60 min,均可对MNV产生消毒效果。结论通过热力及紫外线均可对MNV进行有效消毒,为消毒和灭活HuNV提供了参考方法和依据。 李伯阳 李慧莹 章青 孔翔羽 庞立丽 裴银辉 段招军关键词:诺如病毒 紫外线 热力 北京2008-2009年成人急性胃肠炎病例中札如病毒的检测和分型 被引量:11 2015年 目的 了解北京地区2008-2009年成人急性胃肠炎病例中札如病毒的分子流行病学特征.方法 收集2008年8月至2009年7月519例14岁以上急性胃肠炎门诊病例粪便标本和流行病学资料,利用RT-PCR方法检测札如病毒,测定所有阳性毒株序列并进行系统进化分析.结果 札如病毒的检出率为3.7%(19/519),主要在20 -39岁年龄组中检出,5月检出率最高,系统进化分析表明GⅣ札如病毒为主要毒株,其他基因型包括GⅠ.2和GⅡ.3型.结论 札如病毒是北京地区成人急性胃肠炎的病原之一,GⅣ基因型是主要流行型别. 靳淼 李慧莹 孔翔羽 刘娜 章青 田耕 李全瑞 康利红 段招军关键词:札如病毒 胃肠炎 基因型