李文奇 作品数:83 被引量:303 H指数:10 供职机构: 江苏省农业科学院 更多>> 发文基金: 江苏省自然科学基金 国家科技支撑计划 江苏省农业科技自主创新基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 自动化与计算机技术 更多>>
利用重测序染色体片段代换系群体定位水稻籽粒长宽比QTL 被引量:1 2020年 水稻籽粒长宽比是影响水稻品质和产量的重要农艺性状之一,是由多基因控制的数量性状。染色体片段代换系由于可以减少分离群体中个体间遗传背景的干扰,已成为定位和克隆复杂性状QTL的重要材料。本研究利用以籼稻品种9311为背景、以粳稻品种日本晴为代换片段构建的128个经过2代重测序的染色体片段代换系群体作为试验材料,利用多元回归,结合Bin-map图谱,定位到了4个控制水稻籽粒长宽比的QTL。其中,qLWR2.1被定位在第2染色体上的812 145 bp区间内,加性效应值为-0.04,加性效应百分率为-1.12%;qLWR2.2被定位在第2染色体上的324 166 bp区间内,加性效应值为0.17,加性效应百分率为4.14%;qLWR3.1被定位在第3染色体上的17 825 bp区间内,加性效应值为-0.25,加性效应百分率为-7.73%;qLWR11.1被定位在第11染色体上的945 168 bp区间内,加性效应值为0.21,加性效应百分率为5.15%。本研究结果为精细定位并克隆相应QTL,进而探明水稻籽粒长宽比QTL的分子调控机制奠定了基础。 卫纯洁 陶亚军 范方军 李文奇 李文奇 许扬 王芳权 仲维功 杨杰 王军关键词:水稻 染色体片段代换系 QTL定位 水稻多蘖矮杆突变体htd7(t)的遗传分析与基因定位 被引量:1 2016年 分蘖是水稻最重要的农艺性状之一,其决定水稻的最终产量。多蘖矮杆突变体htd7(t)是粳稻品种‘日本晴’经350 Gy的60Co-γ射线辐射处理后产生的突变体。为了克隆HTD7(t)基因,将htd7(t)与‘9311’配制正反杂交组合进行遗传分析发现,htd7(t)多蘖矮杆性状是受1对隐性核基因控制。利用SSR分子标记将HTD7(t)初步定位在第11染色体分子标记RM21与RM254之间,遗传距离分别为5.6 c M和3.2 c M。利用已经公布的水稻基因组数据,在该基因附近新发展了13对In Del标记,对HTD7(t)进行精细定位。根据定位结果构建覆盖HTD7(t)基因的BAC重叠群,最终将HTD7(t)定位在In Del11-3和In Del11-5之间的64.8 kb的物理距离内。 王军 范方军 朱金燕 李文奇 王芳权 仲维功 杨杰关键词:水稻 基因定位 一种利用CRISPR/Cas9技术快速获得香稻材料的方法 本发明公开了一种利用CRISPR/Cas9技术快速获得香稻材料的方法,基于Badh2基因的序列特征,设计靶序列,构建CRISPR/Cas9‑Badh2基因编辑载体,转化不香的水稻材料,对基因组编辑材料编辑位点的鉴定和T‑... 王芳权 杨杰 许扬 陈智慧 王军 范方军 李文奇 蒋彦婕 陶亚军文献传递 江苏省不同类型粳稻主推品种的遗传多样性分析 江苏省是我国水稻主产和高产省份,江苏省水稻以粳稻为主,粳稻面积占全省水稻面积的近90%。本研究利用中华人民共和国农业行业标准《水稻品种鉴定技术规程-SSR标记法(NY/T1433-2014)》中规定的48对SSR标记对2... 王军 宫丹妮 杨杰 范方军 朱金燕 李文奇 王芳权 仲维功关键词:粳稻 SSR标记 聚类分析 文献传递 利用分子标记辅助培育抗除草剂咪草烟粳稻品种的方法 本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种利用分子标记辅助培育抗除草剂咪草烟粳稻品种的方法。本发明人从7403份水稻品种资源材料中筛选到一个抗咪草烟的水稻材料“金粳818”。将抗除草剂咪草烟粳稻品种金粳818作为供体,常规粳稻... 杨杰 费云燕 王芳权 范方军 王军 仲维功 李文奇 许杨水稻稻瘟病抗性基因Bsr-d1功能标记的开发和利用 被引量:14 2018年 稻瘟病是危害水稻最严重的病害之一,选育抗病品种是防治该病害最有效的方法。Bsr-d1是对稻瘟病菌具有广谱抗性的一个重要基因。为提高Bsr-d1基因在育种中的选择效率,根据Bsr-d1与其感病等位基因bsr-d1在功能区域存在的单核苷酸差异,设计和筛选出Bsr-d1基因不同类型的基因功能标记CAPs5-1和3Bsr-d1/3bsr-d1,结合测序分析验证,可准确鉴定出Bsr-d1的不同基因型。利用3Bsr-d1/3bsr-d1对34份籼稻品种、江苏历年来主要推广的110份粳稻品种、其他省份的13份粳稻品种、148份太湖流域地方粳稻资源和19份太湖流域地方籼稻资源进行了Bsr-d1基因型检测,筛选到携带Bsr-d1基因的籼型资源11份,271份粳型资源中均不携带Bsr-d1基因,这也说明Bsr-d1主要分布在籼型水稻资源中,在粳型资源中几乎不存在。本研究为Bsr-d1基因的育种利用和分子标记辅助选择奠定了基础。 王军 王军 许扬 范方军 范方军 李文奇 朱金燕 费云燕 李文奇 杨杰关键词:水稻 稻瘟病 CAPS 不同温光条件下水稻抽穗期QTL的定位与分析 被引量:3 2016年 以广陆矮4号为受体,日本晴为供体的85个染色体单片段代换系群体为试验材料,通过单因素方差分析和Dunnett多重比较,测验单片段代换系与广陆矮4号之间抽穗期的差异,对代换片段上抽穗期相关的QTL进行了定位。以P≤0.001为阈值,在南京和海南不同温光条件下共定位到40个抽穗期相关的QTL。其中,21个QTL在2个环境中均被检测到;15个QTL只在南京环境中被检测到;4个QTL只在海南环境中被检测到。南京环境中定位到的36个抽穗期相关QTL,其加性效应值变化范围为2.8d^15.7d,加性效应百分率变化范围为3.8%~21.1%;海南环境中定位到的25个抽穗期相关QTL,加性效应值变化范围为1.8d^12.1d,加性效应百分率变化范围为1.7%~11.3%。这些QTL的定位,为进一步精细定位并克隆相应主效QTL和优异品种特定环境下的生育期改良奠定了基础。 王军 朱金燕 周勇 杨杰 范方军 李文奇 王芳权 仲维功 梁国华关键词:数量性状基因座 抽穗期 水稻紫色果皮的延迟遗传及Pb基因功能标记开发 被引量:7 2014年 以香血糯(紫色果皮)、02428(白色果皮)及以它们为亲本的衍生世代F1、F2和F3为材料,研究紫色果皮的遗传特征;根据已克隆的紫色果皮Pb与白色果皮pb等位基因第7外显子的差异,设计酶切扩增片段长度多态性标记(CAPS),分析标记基因型;选取10份材料PCR产物进行测序分析。结果表明,以白色果皮02428为母本时,F1的果皮颜色为白色,而以紫色果皮香血糯为母本时,杂交种F1的果皮颜色为紫色;正反交F1植株所结F2种子果皮都为紫色,没有分离;F2植株所结F3种子果皮颜色发生分离,符合3∶1分离比例;CAPS标记分析结果表明紫色果皮基因能被切开,而紫色颖壳基因不能切开,测序结果说明紫色果皮材料相对于白色果皮材料在第7外显子存在GT缺失。因此,水稻紫色果皮是单基因控制的显性遗传,由母体基因型决定,是典型的延迟遗传;紫色果皮与紫色颖壳由不同基因控制;紫色果皮基因的CAPS分子标记可以作为紫米育种的基因功能标记。 王芳权 杨杰 范方军 王军 朱金燕 李文奇 沈文飚 仲维功关键词:水稻 水稻抗菌蛋白AntiB-1及其应用 本发明公开了水稻抗菌蛋白AntiB‑1及其应用。水稻AntiB‑1蛋白在制备防治水稻稻瘟病中的应用。该蛋白的基因序列在Genbank中的编号为XM_015779840.2。本发明利用源于水稻自身的抗菌蛋白,对稻瘟病菌的防... 李文奇 杨杰 王军 范方军 王芳权 许扬 陶亚军 蒋彦婕 陈智慧一种受病原诱导的水稻启动子P71Z2及其应用 本发明涉及一种受病原诱导的水稻启动子P71Z2及其应用,属于水稻生物育种领域。本发明的目的是提供一种从水稻中分离到的能够响应白叶枯病菌侵害,可以作为病原诱导型启动子使用的DNA序列片段,该DNA序列片段是水稻P450单加... 李文奇 杨杰 王军 范方军 朱金燕 仲维功文献传递