王海妮
- 作品数:6 被引量:48H指数:4
- 供职机构:西北农林科技大学植物保护学院陕西省农业分子生物学重点实验室更多>>
- 发文基金:长江学者和创新团队发展计划国家自然科学基金高等学校学科创新引智计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 泡桐丛枝和枣疯病植原体相关基因分析
- <正>泡桐丛枝病(Paulownia witches’broom,简称PaWB)由泡桐丛枝植原体(Paulownia witches phytoplasma)侵染引起,分布于陕西、河北、山东、河南、安徽、湖南、湖北、江苏...
- 史英姿王海妮吴云锋顾沛雯安凤秋杨艳田小曼
- 文献传递
- 枣疯病和酸枣丛枝病植原体的分子鉴定及相关基因的克隆和生物信息学分析
- 枣疯病(Jujube witches’broom)是由植原体(Phytoplasma)引起的一类病害。该病遍布于我国秦、晋、豫、冀、鲁等各大枣区,直接经济损失高达数亿元,严重阻碍了枣树产业的发展。由于枣疯病植原体严格寄生...
- 王海妮
- 关键词:枣疯病植原体丛枝病分子鉴定同源性比较生物信息学方法
- 文献传递
- 西北旱区枣疯病植原体核糖体蛋白基因的生物信息学分析被引量:6
- 2010年
- 枣疯病是枣树上的一种具有毁灭性的植原体病害,几乎分布于国内所有的枣树栽培区,造成了巨大的经济损失。对我国陕西、宁夏、甘肃3省枣疯病样品植原体核糖体蛋白基因进行克隆和测序,获得枣疯病植原体的核糖体基因片段为1 196bp,包含部分rps19,rpl22和rps3三个基因,其中rpl22和rps3大小分别354bp和753bp,分别编码118和251个氨基酸,且这两个基因为非重叠基因。序列同源性比较结果表明:我国陕西、宁夏、甘肃的枣疯病植原体的核糖体蛋白rp基因大小一致,归属于植原体16SrⅤ-B组;该植原体核糖体蛋白基因特性与樱桃致死黄化(CLY5)和桃树黄化印度分离株系(PY-In)植原体相似。首次报道了我国枣疯病核糖体蛋白基因rp基因的序列,把枣疯病植原体归到16SrⅤ-B组,为枣疯病植原体提供了新的分类依据。
- 吴宽颜永杰王海妮张珏
- 关键词:核糖体蛋白基因生物信息学
- 侵染荷兰郁金香的郁金香碎色病毒和黄瓜花叶病毒的RT-PCR检测被引量:5
- 2008年
- 以从荷兰引进的4个郁金香品种病株为材料,利用马铃薯Y病毒的简并引物和黄瓜花叶病毒CP基因的一对特异引物,通过RT-PCR技术分别扩增出与预期大小相一致的1800 bp和840 bp左右的片段,而对照无任何产物。感受态转化后,进行测序,结果表明田野、多道多、雪莉和克思尼4个品种中均能检测到郁金香碎色病毒和黄瓜花叶病毒。
- 杨玉秀王海妮吴云锋
- 关键词:郁金香黄瓜花叶病毒RT-PCR
- 枣疯病和酸枣丛枝病植原体16S rDNA和tuf基因的序列同源性分析被引量:32
- 2007年
- 【目的】枣疯病是枣树上由植原体引起的一种毁灭性病害,遍布于中国华北、西北、华东、华南等25个省(市)的枣区,造成了巨大的经济损失。【方法】经PCR扩增,分别对中国陕西的彬县、阎良、武功、佳县、杨凌,河北沧州和山东德州7个枣区的枣疯病样品和杨凌4个酸枣丛枝病样品植原体16SrDNA基因保守序列和延伸因子tuf基因进行克隆和测序。【结果】获得枣疯病和酸枣丛枝病植原体的16SrDNA基因片段均为1239bp,tuf基因均为851bp。通过序列同源性比较,结果表明中国陕西、河北、山东的枣疯病的病原一致,归属于植原体16SrⅤ-B组。由于枣疯病和酸枣丛枝病的植原体16SrDNA有5个碱基的差异,tuf基因的同源性为99.6%,推测为同一个种的不同寄主生物学型。【结论】首次报道了中国枣疯病和酸枣丛枝病植原体16SrDNA和延伸因子tuf基因的序列,确定了枣疯病和酸枣丛枝病植原体的分类地位,为研究枣疯病植原体的致病分子机理、遗传本质提供理论依据。
- 王海妮吴云锋安凤秋顾沛雯张昭亮
- 关键词:枣疯病植原体RDNA序列
- 小麦蓝矮植原体免疫膜蛋白(Imp)基因的克隆和分子特性分析被引量:7
- 2008年
- 【目的】探讨小麦蓝矮植原体免疫膜蛋白在介体-病原-寄主互作的分子机理。【方法】通过植原体免疫膜蛋白基因序列两侧的保守区设计引物对Imp1051/Imp2265,用PCR方法扩增小麦蓝矮植原体免疫膜蛋白基因;对扩增片段的最大开放阅读框和基因的同源矩阵、系统发育树分析;对克隆基因所编码蛋白进行跨膜区、亲疏水区和前导信号序列分析。【结果】从小麦蓝矮病病株和接种长春花中均扩增到约1.0kb的特异片段,其中小麦蓝矮植原体免疫膜蛋白基因长495bp,推导的编码蛋白含有164个氨基酸。与10种植原体的免疫膜蛋白基因进行序列同源性分析,小麦蓝矮与三叶草绿变植原体同源性最高,核苷酸和编码的氨基酸序列的同源率分别为98.4%和95.1%。蛋白质结构分析结果表明:小麦蓝矮免疫膜蛋白N端有一个跨膜的前导信号序列,C端为跨膜锚定区,中间为膜外亲水区。【结论】小麦蓝矮植原体与三叶草绿变、翠菊黄化、洋葱黄化和泡桐丛枝植原体的免疫膜蛋白为同型蛋白。
- 顾沛雯吴云锋王海妮安凤秋
- 关键词:同源性蛋白结构