田东
- 作品数:5 被引量:9H指数:2
- 供职机构:贵州师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:贵州省优秀科技教育人才省长资金项目贵州省科学技术基金贵州省国际科技合作计划更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 基于核基因RAG2部分序列探索菊头蝠总科、蝙蝠科和鞘尾蝠科物种的系统发育关系被引量:2
- 2012年
- 采用PCR技术获得了翼手目(菊头蝠总科、蝙蝠科以及鞘尾蝠科)16种19个个体的核基因重组激活基因2(Recombination activating gene,RAG2)部分序列,长度为730~760 bp.结合从Genbank中提取的翼手目3科14个体的RAG2序列,通过构建贝叶斯(Bayesian inference,BI)和最大似然树对翼手目种属间的系统进化关系进行研究.研究表明:在菊头蝠总科中,菊头蝠科和蹄蝠科是两个独立的科,且在蹄蝠科中,大蹄蝠、中蹄蝠、普氏蹄蝠3种之间的亲缘关系非常近;蝙蝠科中的南蝠属与棕蝠属是姊妹群;长翼蝠亚科应提升为长翼蝠科.此外,鞘尾蝠科与犬吻蝠科形成姊妹群关系.
- 袁小爱田东谷晓明
- 关键词:蝙蝠科系统发育关系
- 基于线粒体cytb片段探索小麂新亚种——江口亚种(Muntiacus reevesi jiangkouensis subsp.nov.)的分类地位
- 2011年
- 从保存于贵州师范大学生科院动物标本室的小麂陈旧皮张中提取DNA,利用线粒体DNA细胞色素b通用引物通过PCR扩增,获得小麂江口亚种(Muntiacus reevesi Jiangkouensis subsp.nov.)和小麂指名亚种(Muntiacus reevesi reevesi)的线粒体DNA细胞色素b基因的部分序列,对二者进行序列比对,计算序列差异,并且用最大简约(MP)和贝叶斯(BI)方法构建系统进化树,结果不能确定江口小麂是小麂的新亚种。
- 袁小爱田东朱玉婷肖羽
- 关键词:线粒体CYTB新亚种
- 基于部分线粒体DNA序列的疣螈属亚属(有尾目,蝾螈科,疣螈属)系统发育关系被引量:6
- 2012年
- 对疣螈属Yaotriton亚属5个已知物种23个个体的mtDNA序列数据(ND2、tRNATrp、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys和tRNA Tyr,1421bp),使用贝叶斯(BI)和最大似然(M P)方法重建了疣螈属Yaotriton的系统发育关系。结果表明:1)Yaotriton亚属的所有物种形成1个单元群;2)海南疣螈T.hainanensis是Yaotriton亚属的1有效物种,不是细痣疣螈T.asperrimus的同物异名;3)文县疣螈T.wenxianensis雷山种群应是细痣疣螈的地理种群,细痣疣螈绥阳种群应是文县疣螈的地理种群;4)6个文县疣螈地理种群和3个细痣疣螈地理种群分别形成单系群,文县疣螈是Yaotriton亚属的1有效物种。
- 谷晓明陈蓉蓉王会田应洲陈光照田东
- 关键词:系统发育关系MTDNA序列
- 基于核基因RAG1部分序列探讨菊头蝠科和蹄蝠科的系统发育关系被引量:2
- 2012年
- 应用核基因重组激活基因1(Recombination activating gene,RAG1)部分序列对贵州9种菊头蝠和5种蹄蝠的系统发育关系进行了研究,运用贝叶斯法(Bayesian inference,BI)、最大似然法(Maximum likelihood,ML)和邻接法(Neighbor-joining,NJ)构建了系统进化树。研究结果表明:1.菊头蝠科和蹄蝠科形成两个平行的分支,支持它们是两个平行科的结论。2.马铁菊头蝠是菊头蝠科中第一个独立出来的亚分支,与其余8种菊头蝠的亲缘关系最远;Rhinolophus sp.与大菊头蝠聚合为一支,推测Rhinolophus sp.可能是大菊头蝠,或者是大菊头蝠的近缘种,它们是继马铁菊头蝠之后分离出来的第二亚分支;中华菊头蝠、栗黄菊头蝠、中菊头蝠聚合为第三亚分支,贵州菊头蝠、大耳菊头蝠、菲菊头蝠聚合为第四亚分支,此两分支形成姊妹群。3.在蹄蝠科的亚分支中,三叶蹄蝠、小蹄蝠、普氏蹄蝠依次分离出来,最后分出的是大蹄蝠和中蹄蝠。
- 袁小爱田东谷晓明
- 关键词:菊头蝠科系统发育关系
- 南蝠线粒体DNA控制区结构及贵州7个种群遗传多样性的分析研究
- 2012年
- 采用PCR技术获得了贵州7个南蝠(Ia io)自然种群42个个体的线粒体DNA控制区全序列,长度为1256~1340 bp.对控制区结构进行分析,识别了其延伸的终止结合序列区(包括ETAS1和ETAS2元件)、中央保守区(包括F、E、D、C、B元件)和保守序列区(包括CSB1、CSB2和CSB3元件);同时,在延伸的终止结合序列区还发现了若干能形成发夹结构的主体序列TACAT—ATGTA.在7个自然种群42个个体中共定义了16个单倍型.遗传多样性分析表明:贵州南蝠种群具有较高的单倍型多样性(h=0.945)和中等的核苷酸多样性(π=0.012).基因流、AMOVA和系统进化树分析表明贵州这7个南蝠自然群体间没有发生遗传分化.
- 田东袁小爱谷晓明
- 关键词:南蝠MTDNA控制区结构