郭营 作品数:42 被引量:137 H指数:6 供职机构: 山东农业大学 更多>> 发文基金: 山东省农业良种工程项目 山东省自然科学基金 国家现代农业产业技术体系建设项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
一种控制小麦株高的QTL及其候选基因TaRPS27和应用 本发明公开了一种控制小麦株高的QTL及其候选基因<I>TaRPS27</I>和应用,本发明从小麦的4B染色体定位到一个与株高相关的稳定主效QTL—<I>QPH‑4B‑10824</I>,在其峰值区间中选取一个编码40s核... 赵岩 翟耘辉 郭营 李斯深 张浩祯 王辉 马龙腾 许清小麦抗黄矮病相关基因片段的克隆 小麦黄矮病(wheat yellow dwarf disease,WYD)是小麦的主要病害之一,由蚜虫传播的大麦黄矮病毒(BYDV)引起。小麦黄矮病可引起小麦严重减产,因此防治小麦黄矮病对于小麦的稳产具有重要意义。目前还... 郭营关键词:小麦抗黄矮病 基因片段 蚜虫传播 抗病品种 差异基因 文献传递 一种影响小麦产量的QTL定位及其候选基因TaIFABPL-3B和应用 本发明公开了一种影响小麦产量的QTL定位及其候选基因TaIFABPL‑3B和应用。所述QTL为QTgw‑3B‑12014,位于3B染色体上,其遗传距离为1207.5~1216.5cM。在所述QTL QTgw‑3B‑120... 李斯深 韩旭 赵岩 郭营 安艳荣一种控制小麦株高的主效QTL及其候选基因和应用 本发明公开了一种控制小麦株高的主效QTL及其候选基因和应用。所述主效QTL为QPh‑2D.1,位于2D染色体上,其遗传距离为1995.71~2002.73cM,物理区间大小为212Kb;所述候选基因为TaSDR‑2D,其... 李斯深 郭宝晋 赵岩 郭营 安艳荣 孙俊生小麦抗黄矮病基因相关cDNA片段的克隆 被引量:3 2008年 以从小麦品种间杂交组合‘川35050/山农483’F7株系中分离出的感、抗小麦黄矮病的2个近等基因系为材料,利用DDRT—PCR技术和抗病基因保守结构域序列设计的7条简并或特异引物进行差异显示,PCR分析获得4条差异序列,并分别命名为:Rbdv1~Rbdv4(GenBank注册号:EU267934~EU267937)。以Rbdv1为靶序列,利用RACE对其3′末端进行PCR扩增,得到长778bp、末端有poly(A)尾巴的序列。用DNAMAN软件将3′RACE得到的序列与靶序列拼接得到1196bp长的片段,命名为A1(GenBank注册号:EU267938)。BlastN分析表明,A1与拟南芥、水稻中CDC48蛋白的同源性分别为81%和90%,其氨基酸序列中包含1个P—Loop,具有R基因的特征结构域,推测该片段很可能与抗小麦黄矮病基因相关。 郭营 许云峰 蒋方山 王平 李瑞军 李斯深关键词:小麦 小麦黄矮病 RACE 小麦产量及氮效率相关性状的全基因组关联分析 被引量:3 2021年 【目的】探明控制产量及氮效率相关性状的稳定基因关联位点,为高产和氮素高效小麦育种及养分管理提供参考。【方法】采用134个小麦品种(系)为试验材料,依据小麦产量水平600和400 kg/hm^(2)的需氮量设置正常氮(T1)和低氮(T2)2个处理,进行了2年田间试验,共形成4个处理环境。对小麦成熟期与产量及氮效率相关的14个性状进行了表型鉴定,采用GLM+Q一般线性模型和MLM+K+Q混合线性模型相结合的方法,利用群体差异S NP分子标记(90 K SNP芯片)对小麦产量和氮效率相关性状进行全基因组关联分析。【结果】与正常氮处理相比,低氮处理条件下小麦籽粒产量、秸秆产量显著下降;所有性状的遗传力均在75%以上,其中小穗数的遗传力最高(95.12%)。利用9329个SNP标记进行关联分析,共检测到382个SNP标记位点与供试14个性状存在显著关联(P≤0.001),分布在21条染色体上。有305个(79.84%)SNP标记位点仅在一个关联分析环境中被检测到;有77个位点在至少两种处理环境(包含平均值环境)中被检测到与同一性状显著关联(稳定关联标记)。其中9个SNP标记位点在至少3个环境中被检测到。在4个环境下(包括平均值环境)均检测到的稳定关联位点有4个:BobWhite_c47168_598、Kukri_c31599_1456、wsnp_CAP11_c1761_958064和Excalibur_c62826_254,分别与穗粒数、籽粒氮含量和小穗数显著关联;同时与至少3个性状显著关联的SNP标记位点共12个,分别位于2A、3A、4A、5B和7B染色体上,贡献率为11.14%~22.97%,其中,标记BobWhite_c47168_598和Kukri_c31599_1456还分别定位了两个多环境(4种环境)稳定位点。根据12个与多性状共同定位位点和4个多环境(4个环境)稳定位点关联的SNP标记位置获得稳定位点附近区域的基因(基于LD block等方式估算的区间大小),使用NCBI中CDD工具和EnsemblPlants网站对这些基因进行基因功能注释,根据功能注释,共得到10个与产量和氮 张鹏霞 周秀文 梁雪 郭营 赵岩 李斯深 孔凡美关键词:小麦 全基因组关联分析 氮效率 小麦苗期生物量及氮效率相关性状的全基因组关联分析 被引量:2 2021年 【目的】探究不同氮素供应环境下与小麦苗期生物量及氮效率相关性状显著关联的SNP位点,预测相关候选基因,为小麦氮效率的基因克隆及其在育种中的应用提供参考。【方法】以134个小麦品种(系)组成的群体为供试群体,设置低氮、正常氮和高氮3个处理,各处理重复4次,并在2年(2013和2014年)进行了2次完全重复的营养液培养试验。试验对小麦苗期生物量及氮效率相关的14个性状进行了表型鉴定,采用MLM+K+Q混合线性模型,利用90K SNP芯片对小麦生物量及氮效率相关性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),获得显著关联的SNP位点。【结果】与正常氮处理相比,低氮处理条件下,根系、地上部及植株氮含量和氮积累量均显著下降,而根生物量和根、植株氮效率均显著增加,高氮处理下,几乎所有鉴定性状均显著增加;14个性状的广义遗传力均在40%以上,其中,植株总干重的遗传力最高(95.73%)。利用9329个SNP标记进行关联分析,共检测到838个SNP标记位点与供试材料的14个性状存在显著关联(P≤0.001),分布在21条染色体上。有435个(51.91%)SNP标记位点仅在一个关联分析环境中被检测到;有403个位点至少在2个处理环境(包含均值环境)中被检测到与同一性状显著关联(稳定关联标记)。其中8个SNP标记位点至少在3个环境中被检测到。在4个环境下(包括均值环境)均检测到的稳定关联位点有2个:Kukri;65481;21和tplb0025f09;052,分别与植株总氮利用效率(total nitrogen use efficiency of plant,TNUE)和根系总氮利用效率(root nitrogen use efficiency,RNUE)显著关联;同时与至少6个性状(生物量及养分效率相关性状)显著关联的SNP标记位点共5个,分别位于1A、1B(3)和2A染色体上;根据小麦基因组注释及LD衰减水平,在同时定位了6个性状的5个SNP位点和2个多环境(4个环境)稳定关联的SNP位点的214 kb的基因组区域中共筛� 张鹏霞 周秀文 梁雪 郭营 赵岩 李斯深 孔凡美关键词:小麦 全基因组关联分析 生物量 氮效率 小麦苗期冷驯化相关cDNA的克隆 被引量:2 2007年 以中国春小麦幼苗为材料,利用改进的mRNA差异显示方法和银染技术,对不同低温驯化诱导表达的差异基因进行分离,共得到cDNA差异片段60条.经Reverse Northern验证,检出阳性表达片段8条,克隆并测序,分别命名为TIGW1~TIGW8.其中,TIGW2和TIGW3可能与抗冻蛋白积累、低温诱导蛋白的生成或低温信号的感受与传递有关;TIGW1、TIGW6、TIGW8中具有ACGT应答元件,TIGW3含有CAACA应答元件,说明可能获得了冷诱导基因的启动子序列. 雷天东 郭营 李林志 李瑞军 李斯深关键词:小麦 冷驯化 CDNA MRNA差异显示 与小麦株高相关的基因TaOSCA2.1、分子标记及其应用 本发明公开了一个与小麦株高相关的基因<I>TaOSCA2.1</I>、与该基因相关的分子标记TaOSCA2.1‑5A‑C/T或TaOSCA2.1‑5A‑A/G,及该标记的应用。如果利用TaOSCA2.1‑5A‑C/T标记... 吕广德 郭营 王超 王瑞霞 赵岩 钱兆国 吴科 李斯深文献传递 一种影响小麦籽粒品质的基因TaXip及其应用 本发明公开了一种影响小麦籽粒品质的基因TaXip及其应用。所述基因TaXip包括基因TaXip‑6A、基因TaXip‑6B和基因TaXip‑6D,其中基因TaXip‑6A包含SNP分子标记,其位于小麦染色体6A上,所述S... 李斯深 孙正娟 赵岩 郭营 安艳荣文献传递