陈蕾
- 作品数:12 被引量:24H指数:4
- 供职机构:中国科学院南海海洋研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技支撑计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学轻工技术与工程更多>>
- 2008年夏季南海北部浮游植物群落结构特征分析被引量:8
- 2012年
- 根据2008年8月15日—2008年9月7日南海北部调查期间所获得的网采浮游植物资料,对该海域的4个断面共计13个站位的浮游植物群落结构特征进行了研究,包括种类组成、丰度、分布、多样性以及浮游植物群落结构与环境因子之间相关关系等基本状况。本次调查共鉴定出浮游植物4门53属169种(含变种和变型),主要以暖水性、广温性和广布性种为主,其中硅藻门(Bacillariophyceae)37属114种,占总种数的67.4%,甲藻门(Pyrrophyta)12属50种,占总种数的29.6%,蓝藻门(Cyanophyta)2属3种及金藻门(Chrysophyta)2属2种等。浮游植物丰度平均值为18.06×104cells/m3,其中硅藻丰度平均值为55.72×106cells/m3,甲藻丰度平均值为0.81×106cells/m3。调查区域内的优势种包括铁氏束毛藻(Trichodesmium thiebautii),洛氏角毛藻(Chaetoceros lorenzianus),柔弱菱形藻(Nitzschia delicatissima),红海束毛藻(Trichodesmium erythraeum)和菱形海线藻(Thalassionema nitzschioides)。藻类为聚类分析(UPMGA)将站点大致上分为4个生态区(珠江口生态区,吕宋海峡区,琼东上升流区和18°N断面区),结果表明,在地理位置上分布比较相近的站点具有较高的群落结构组成相似性。
- 凌娟董俊德张燕英王友绍邓超林立陈蕾李涛龙丽娟
- 关键词:南海北部浮游植物聚类分析
- 一种红海榄根际纤维素降解真菌新种Hypoxylon sp.DPZ-SYz-36及其应用
- 本发明公开了一种红海榄根际纤维素降解真菌新种Hypoxylon sp.DPZ-SYz-36及其应用。炭团菌(Hypoxylon sp.)DPZ-SYz-36于2011年05月16日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微...
- 董俊德潘虎张燕英凌娟陈蕾张偲龙丽娟
- 一种高效纤维素降解真菌新种Acremonium sp.DPZ-SYz-2-3及其应用
- 本发明公开一种高效纤维素降解真菌新种Acremonium sp.DPZ-SYz-2-3及其应用。枝顶孢(Acremonium sp)DPZ-SYz-2-3于2011年05月16日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生...
- 潘虎张偲龙丽娟董俊德张燕英凌娟陈蕾
- 一种红树植物根际纤维素降解真菌新种Xylariaceae sp. DPZ-SY43及其应用
- 本发明公开红树植物根际纤维素降解真菌新种Xylariaceae sp.DPZ-SY43及其应用。炭角菌(Xylariaceae sp.)DPZ-SY43,该菌于2011年05月16日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通...
- 董俊德潘虎张燕英凌娟陈蕾张偲龙丽娟
- 基于RFLP技术的鹿角杯形珊瑚共附生固氮菌多样性分析被引量:1
- 2014年
- 对三亚湾鹿回头与西沙石岛的常见鹿角杯形珊瑚(Pocillopora damicornis)的固氮酶nif H基因多样性进行了分析,并对其共附生固氮微生物多样性进行了比较。利用Taq I和HaeⅢ两种限制性内切酶分别对三亚湾珊瑚的粘液(SYN)、组织(SYZ)和西沙珊瑚组织(XSZ)的阳性克隆子进行聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析,得到了23,25和13个OTUs,文库的覆盖率分别为90.3%,87.5%和94.1%,多样性指数Shannon-Wiener指数(H)分别为2.28,3.02和2.08,Evenness指数(E)分别为0.5,0.65和0.56。研究结果表明:1)3个文库重要组成部分都是绿菌门(Chlorobia)和变形菌门(Proteobacteria)α-亚门、γ-亚门、δ-亚门细菌;2)3个文库绝大部分OTUs的最相似序列来自珊瑚礁、海绵、水体、沉积物等环境中的不可培养细菌,反映鹿角杯形珊瑚组织和粘液可能蕴含着丰富的尚未被培养的固氮菌资源;3)发现了两大重要的类群——分别与绿菌门和脱硫弧菌属(Desulfovibrio)细菌序列最相似的类群,它们通过为珊瑚共生体提供有机氮源参与到珊瑚白化的调节或恢复过程中,在珊瑚共生体营养物质的循环中充当重要角色;4)从多样性指数分析可以看出,SYZ的固氮微生物多样性高于SYN,SYZ的固氮微生物多样性高于XSZ,反映了鹿角杯形珊瑚生活的地理位置不同,固氮菌共附生的生态位不同(如珊瑚粘液、组织等不同部位),都将导致珊瑚共附生固氮菌多样性的差异。
- 黄小芳陈蕾张燕英凌娟龙丽娟张偲董俊德
- 关键词:固氮菌
- 一种红海榄根际纤维素降解真菌新种Hypoxylon sp.DPZ-SYz-36及其应用
- 本发明公开了一种红海榄根际纤维素降解真菌新种Hypoxylon sp.DPZ-SYz-36及其应用。炭团菌(Hypoxylon sp.)DPZ-SYz-36于2011年05月16日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微...
- 董俊德潘虎张燕英凌娟陈蕾张偲龙丽娟
- 文献传递
- 一种高效纤维素降解真菌新种Acremonium sp.DPZ-SYz-2-3及其应用
- 本发明公开一种高效纤维素降解真菌新种Acremonium sp.DPZ-SYz-2-3及其应用。枝顶孢(Acremonium sp)DPZ-SYz-2-3于2011年05月16日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生...
- 潘虎张偲龙丽娟董俊德张燕英凌娟陈蕾
- 文献传递
- 一种红树植物根际纤维素降解真菌新种Xylariaceae sp. DPZ-SY43及其应用
- 本发明公开红树植物根际纤维素降解真菌新种Xylariaceae sp.DPZ-SY43及其应用。炭角菌(Xylariaceae sp.)DPZ-SY43,该菌于2011年05月16日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通...
- 董俊德潘虎张燕英凌娟陈蕾张偲龙丽娟
- 文献传递
- 三亚湾壮实鹿角珊瑚组织内共附生固氮菌多样性分析被引量:3
- 2013年
- 以海南省三亚鹿回头珊瑚礁自然保护区中一种常见的壮实鹿角珊瑚(Acropora robusta)为研究对象,用PCR-RFLP方法研究其组织内共附生固氮微生物固氮酶nifH基因的多样性;用TaqⅠ和HinfⅠ这两种限制性内切酶对所获得的196个阳性克隆子进行RFLP分析,得到24个不同的OTUs(operational taxonomicunits),文库覆盖率为87.65%.利用Clustal W与Mega软件对nifH基因构建的系统进化树聚成了3大类:变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和绿菌门(Choloria),大部分的文库序列(70.83%)与变形菌门的α亚簇和β亚簇具有较高的相似性,其中α-变形菌簇占66.67%,是本文库中的优势种;次优势类群为厚壁菌门,占整个文库OTUs的16.67%;绿菌门仅占12.5%.此外,在这株珊瑚样本中获得的24个克隆子中有13条nifH基因序列与它们最相近序列的相似性小于97%.综上结果表明该壮实鹿角珊瑚组织内的共生固氮菌的具有较高的多样性,而且还可能含有大量未被培养的新的固氮基因.
- 陈蕾张燕英董俊德凌娟潘虎张偲龙丽娟
- 关键词:固氮菌PCR-RFLP多样性
- 三亚湾珊瑚礁海域蓝藻群落组成的空间分布特征及其与环境因子的关系被引量:4
- 2013年
- 对三亚湾春季表层和底层蓝藻群落的空间分布差异和蓝藻群落组成与环境因子的相关关系进行了研究.利用流式细胞仪对蓝藻丰度进行了计数,其结果显示,表层蓝藻丰度范围为0.70×104-2.37×104cells/mL;底层蓝藻的丰度范围为范围是0.99×104-1.81×104cells/mL.采用的主要研究方法是变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)和多元统计学分析.DGGE图谱结果显示三亚湾表层和底层的蓝藻群落结构的组成存在显著的差异性,有些条带在同一站位的表层和底层都有出现而有些条带只存在于该站位的表层或者底层.表层和底层群落中的普遍存在蓝藻种都是Synechococcus或Synechococcus-like species(56.2%);此外,还有Chroococcidiopsis (6.3%),Cyanobium (6.3%)和Unclassified cyanbacterium (31.2%).冗余分析结果显示与表层和底层蓝藻群落结构组成显著相关的环境因子是不同的,其中与表层蓝藻群落结构组成显著相关的是叶绿素Chla,生化需氧量,硝酸盐和磷酸盐(P〈0.05),而与底层蓝藻群落结构组成显著相关的是硝酸盐,亚硝酸盐和磷酸盐(P〈0.05);环境因子对三亚湾表层和底层蓝藻群落结构的空间分布差异的解释程度可分别达99.3%和58.3%.
- 凌娟张燕英董俊德王友绍黄晖陈蕾黄小芳龙丽娟张偲
- 关键词:变性梯度凝胶电泳聚球藻