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虹鳟肝组织新转录本分析及基因结构优化被引量：6: 2019年; 目的虹鳟热应激下肝RNA-seq数据中新转录本的分析及已注释基因结构优化。方法以虹鳟肝为材料提取总RNA,构建cDNA文库,并利用Illumina双端测序Hiseq 2500平台进行测序。运用Cufflinks软件对测序数据进行组装,将其与虹鳟参考基因组进行序列比对。结果发掘新转录本6555个,其中30个新转录本在热应激前后差异表达(P<0.05)。与GO数据库比对对新转录本进行功能注释,获得3097个新转录本的注释。与KEGG数据库比对,共有3617个新转录本注释到284条代谢通路中。对19 424个已注释基因的结构进行优化,延伸了14 719个基因的5′端和14 796个基因的3′端。结论通过对发掘的6555个新转录本分析,并对19 424个已注释基因结构优化,为虹鳟基因组注释信息的完善提供了有力的借鉴,并为进一步了解虹鳟热应激的机制提供更有力的理论基础。; 马芳刘哲康玉军权金强; 关键词：虹鳟转录组测序

虹鳟热应激相关miRNA及其靶基因鉴定、生物信息学分析及靶向关系验证: 虹鳟是典型的冷水性鱼类,对较高水温的耐受能力差,随着全球气候变暖,夏季高温对虹鳟养殖的威胁越来越严重,鉴定虹鳟应答高温刺激的相关基因,在基因表达的不同层次上理解热应激的响应策略和调控机理,可以为虹鳟耐高温遗传选育和改良、...; 马芳; 关键词：虹鳟热应激 MIRNA 内参基因; 文献传递

锌对家禽免疫功能的影响: 锌是家禽机体内的必需微量元素,对家禽免疫器官的正常发育至关重要,且能显著增强其细胞免疫和体液免疫功能,从而在家禽的营养免疫领域中成为研究热点。本文就这一领域的研究进展和研究展望作一综述。; 马芳史兆国; 关键词：锌家禽免疫免疫功能微量元素免疫器官; 文献传递

锌对家禽免疫功能的影响: 锌是家禽机体内的必需微量元素,对家禽免疫器官的正常发育至关重要,且能显著增强其细胞免疫和体液免疫功能,从而在家禽的营养免疫领域中成为研究热点。本文就这一领域的研究进展和研究展望作一综述。; 马芳史兆国; 关键词：锌免疫器官细胞免疫体液免疫; 文献传递

慢性热应激对虹鳟头肾miRNAs表达的影响: 近年来,动物小分子非编码RNA （microRNAs, miRNAs）的研究因其在发育过程中的调控作用和对非生物胁迫的响应而受到广泛关注。虹鳟鱼是一种商业性的冷水鱼类,通常会遇到热应激,影响其生长,造成巨大的经济损失。但...; 权金强马芳罗志成赵桂研李兰兰刘哲; 关键词：RNA-SEQ MIRNAS 虹鳟热应激; 文献传递

热应激下虹鳟mRNA和miRNA实时荧光定量内参基因的筛选: 虹鳟鱼是一种主要的商业和冷水鱼,通常受到高温的影响。基因表达分析是了解虹鳟热应激机制的重要方法之一。定量实时PCR（RT-QPCR）是分析基因相对表达的有效方法。影响彩虹鳟RT-qPCR的因素很多,包括参考基因,但在热应...; 马芳刘哲黄进强康玉军王建福; 关键词：虹鳟热应激内参基因; 文献传递

饲粮锌水平对肉仔鸡免疫力、生长性能和血清生化指标的影响: 试验选用健康AA雏鸡384只(公母各半)，随机分为8组(公母各4组)，每组设4个重复，每个重复12只鸡，按Zn添加量分为40 mg/kg、80mg/kg、120mg/kg、160mg/kg四个水平，探讨Zn的添加量对采食...; 马芳; 关键词：肉仔鸡饲粮血清生化指标; 文献传递

日粮中25-OH-D_3、VD_3不同水平组合对肉仔鸡生长性能的影响被引量：12: 2007年; 试验分为5个处理组,25-OH-D3(μg/kg)、VD3(IU/kg)的添加量分别为0、2760,69、0,34.5、1380,34.5、2760,69、1380,每组4个重复,每个重复10只健康艾维茵肉公雏,共200只,研究25-OH-D3和VD3不同添加水平组合对肉仔鸡生长性能的影响。结果表明,各处理组肉仔鸡生长性能均较好,而且相互之间的差异均不显著(P>0.05)。日粮中组合添加25-OH-D334.5μg/kg和VD31380 IU/kg时,肉仔鸡的生长性能最佳。; 贾洪阁魏时来杨德志马芳韩明霞谷大勇史兆国王哲宏赵成莹; 关键词：25-OH-D3 维生素D3 肉仔鸡

热应激对虹鳟CRT基因和PDIA4基因mRNA表达的影响被引量：2: 2019年; 在转录组测序研究中,筛选出了与虹鳟热应激相关的钙网蛋白基因CRT和蛋白二硫键异构酶基因PDIA4。为研究其在热应激过程的表达变化规律及应答机制,本试验以全同胞虹鳟为研究对象,通过持续升温,分别在18℃(对照组)、21℃、23℃、24℃、25℃和26℃下随机挑选3尾虹鳟,采用实时荧光定量(Real-timeFQ-PCR)方法测定并分析了肝脏和头肾CRT和PDIA4mRNA的表达变化特征。结果显示,与18℃相比,肝脏、头肾CRT表达量分别在24℃、26℃时显著上调且达到最高(19.16倍和2.76倍,p<0.05);PDIA4mRNA表达量分别在25℃、26℃显著上调且达到最高(57.45倍和188.68倍,p<0.05)。肝脏CRT的表达量在24℃和25℃时显著高于头肾(10.89倍和8.46倍,p<0.05),而PDIA4表达量在24℃、25℃和26℃时显著低于头肾(p<0.05)。因此认为,热应激诱导虹鳟肝脏、头肾中CRT和PDIA4mRNA的表达上调,25℃以上时,虹鳟热应激反应强烈,且对基因表达水平的影响存在组织特异性,肝脏对热刺激的反应比头肾更敏感。本研究为阐述鱼类在热应激下适应性保护机制提供指导。; 刘晓霞刘哲王永杰康玉军马芳王建福黄进强; 关键词：虹鳟热应激 CRT MRNA

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马芳