刘书林
- 作品数:15 被引量:75H指数:6
- 供职机构:中国农业科学院蔬菜花卉研究所更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 黄瓜果实多刺基因ns的Indel标记及其应用
- 本发明“黄瓜果实多刺基因ns的Indel标记及其应用”,涉及生物技术辅助育种领域。本发明公开了与黄瓜果实多刺基因ns连锁的Indel标记,其特征在于:Indelns24-F/Indelns24-R:TTTGAATGGCA...
- 张圣平顾兴芳苗晗刘书林王烨
- 文献传递
- 黄瓜RIL群体瓜长和把长的QTL定位分析被引量:7
- 2014年
- 以黄瓜野生变种‘PI183967’(Cucumis sativus L.hardwickii)和新泰密刺选系‘931’为亲本,通过单粒传法获得包含160个株系的F9代重组自交系群体(RIL).结合分子遗传图谱和不同年份(2012年春、秋季和2013年春、秋季)的表型调查数据,利用MapQTL4.0软件进行黄瓜瓜长和把长的QTL定位.结果显示:(1)共检测到8个与瓜长和把长相关的QTLs,分布在染色体3、4、5、6、7上,LOD值在2.78~10.24之间,可解释7.4%~32.7%的表型变异率,贡献率≥10.0%的QTL位点4个,占QTLs总数的1/2,在春秋两季重复检测出的QTL位点有4个.(2)检测到4个与瓜长相关的QTLs位点Fl3.1、Fl4.1、Fl5.1、Fl6.1,4个与把长相关的QTLs位点Fsl3.1、Fs玛.2、Fsl5.1、Fsl6.1.(3)Fl6.1和Fsl6.1在2012、2013年春秋季中均可检测到,位于第6号染色体的109.2 cM处,标记SSR17591~C80之间;Fl6.1在4次中的贡献率在13.8%~32.7%之间,Fsl6.1在4次中贡献率为12.1%~24.1%;(4)Fl3.1和Fsl3.2位于第6号染色体标记SSR16152~SSR07706之间,其中Fl3.1在2012年秋季和2013年春秋两季中均可检测到,贡献率总共为25.1%,Fsl3.2仅在2012年秋季中检测到,解释8.8%的表型变异率.研究表明,第6号染色体上标记SSR17591~C80和第3号染色体上的SSR16152~SSR07706等2个区域聚集了控制瓜长和把长的主效QTL位点,这2个区域应作为今后研究的重点.
- 王敏刘书林张圣平苗晗王烨田桂丽鲁宏伟顾兴芳
- 关键词:黄瓜RIL群体QTL
- 瓜类种子性状遗传及分子生物学研究进展被引量:4
- 2013年
- 种子性状与植物的生长发育、产品器官的产量和品质以及环境适应性等密切相关。探究种子性状遗传和发育调控机制对作物种质改良、提高产量与解决生物能源问题具有重要作用。近年来,种子性状研究在瓜类蔬菜作物上取得较快进展,本文综述了瓜类种子性状的遗传特性、发育调控机制及分子生物学方面的研究进展,并对目前该领域相关研究中存在的问题进行了讨论,对未来的研究方向提出了展望。
- 王敏张圣平苗晗刘书林董邵云王烨顾兴芳
- 关键词:瓜类种子
- 黄瓜果皮光泽性状的遗传分析及基因定位研究被引量:23
- 2013年
- 以黄瓜(Cucumis sativusL.)果皮有光泽自交系‘1101’(P1)为母本,以3个无光泽自交系‘1116’(P2)、‘9930’(P3)、‘1107’(P4)为父本,分别构建6世代遗传群体,对黄瓜果皮光泽性状进行遗传规律分析和基因定位研究。结果表明,黄瓜果皮有光泽性状由显性单基因G控制,有光泽对无光泽为显性。利用‘1101’ב1116’的F2群体,结合分离群体分组分析法(bulked segregate analysis,BSA)筛选得到了30对与黄瓜果皮有光泽基因G相关的SSR标记,将该基因定位到黄瓜第5染色体上,侧翼标记为CS28和SSR15818,遗传距离分别为2.0cM和6.4cM。两侧翼标记之间的物理距离为454kb,在该区域中共预测了177个候选基因。
- 董邵云苗晗张圣平王烨王敏刘书林顾兴芳
- 关键词:黄瓜SSR基因定位
- 黄瓜黑色果刺基因染色体定位及候选基因分析被引量:11
- 2014年
- 【目的】黄瓜作为重要的果菜类蔬菜,果实品质一直是黄瓜育种研究的重点。果实品质包括内在品质和外观品质,其中外观品质对黄瓜的商品性具有重要影响。果刺颜色作为黄瓜重要的品质性状之一,对其进行遗传分析和基因定位将有助于了解果刺颜色遗传的分子机理,为黄瓜果实性状改良提供理论依据和技术支撑,同时也可为刺色基因的精细定位及克隆奠定基础。【方法】研究利用黄瓜白色果刺自交系GY14(P1)和黑色果刺自交系NC76(P2)为亲本构建遗传群体,进行黄瓜果刺颜色的遗传分析。以F2分离群体为试材,应用分离群体分组分析法(BSA)和2 112对SSR引物进行SSR分析,结合9 930黄瓜全基因组序列信息和100份核心种质重测序结果开发新标记,对初定位区域进行标记加密。采用JoinMap 4.0作图软件和MapInspect软件构建连锁群并完成连锁群与染色体的对应,实现黄瓜黑色果刺性状的基因定位。运用生物信息学,在定位区域进行候选基因分析。利用包含156个株系的重组自交系(RILs)群体,对黑色果刺基因紧密连锁的两侧翼分子标记进行验证,确定标记用于分子标记辅助选择(MAS)育种的准确性。【结果】研究表明,黄瓜自交系NC76的黑色果刺符合质量性状遗传特点,由显性单基因B控制,黑色对白色为显性。初步定位筛选获得了与B基因连锁的8对SSR引物,将B定位于黄瓜4号染色体(Chr.4)上,最近的连锁标记为SSR22231,遗传距离为10.8 cM;根据初定位区域的序列信息,设计合成了新的SSR引物212对和Indel引物25对,利用这些引物对双亲和F2群体DNA进行分析,最终构建了一个包含14个SSR标记和1个InDel标记的分子标记连锁群,获得与B连锁的两侧翼标记SSRB-181和SSRB-130,遗传距离分别为2.0 cM和1.6 cM,该区段物理距离为422.1 kb,有60个预测候选基因,推测Csa4G003095和Csa4G001690是与黑色果刺形成相关性较大的候选基因�
- 刘书林顾兴芳苗晗王烨Yiqun WengTodd C Wehner张圣平
- 关键词:黄瓜染色体定位SSR标记候选基因CUCUMISSATIVUS
- 黄瓜种子大小遗传分析与QTL定位
- 种子性状(即种子形态、成分含量及产量与休眠特性等)与植物的生长发育、产品器官的产量和品质以及环境适应性等密切相关。探究种子性状遗传和发育调控机制对作物种质改良,提高产量与解决生物能源问题具有重要作用。种子大小是决定种子质...
- 王敏苗晗张圣平刘书林董邵云王烨顾兴芳
- 关键词:黄瓜种子大小QTL定位
- 黄瓜黑色果刺基因B连锁的SSR标记引物及其应用
- 本发明“黄瓜黑色果刺基因B连锁的SSR标记引物及其应用”,涉及生物技术辅助育种领域。黄瓜黑色果刺基因B紧密连锁的SSR标记引物,其特征在于:SSR07209-F/SSR07209-R:CTGTCTGCAGAGCCATCT...
- 张圣平顾兴芳苗晗刘书林王烨
- 文献传递
- 黄瓜种瓜红色果皮遗传分析及基因定位
- 目前对于黄瓜(Cucumis sativus L.)果实性状的研究多集中在嫩果性状方面,在种瓜性状方面研究较少。本研究旨在探究黄瓜种瓜果皮颜色的遗传规律,筛选与黄瓜种瓜红色果皮基因R紧密连锁的SSR分子标记,实现其在染色...
- 刘书林顾兴芳苗晗王敏王烨Todd C.Wehner张圣平
- 关键词:黄瓜SSR标记基因定位
- 黄瓜果实多刺基因ns的Indel标记及其应用
- 本发明“黄瓜果实多刺基因ns的Indel标记及其应用”,涉及生物技术辅助育种领域。本发明公开了与黄瓜果实多刺基因ns连锁的Indel标记,其特征在于:Indelns24‑F/Indelns24‑R:TTTGAATGGCA...
- 张圣平顾兴芳苗晗刘书林王烨
- 文献传递
- 瓜类蔬菜蔓枯病研究概况被引量:13
- 2013年
- 蔓枯病(gummy stem blight)是近几年在瓜类蔬菜上发生和蔓延较快的一种病害,对生产造成的损失日益严重。本文对瓜类蔓枯病的病原菌、发病规律及为害症状、抗病性鉴定技术、抗病资源、抗性遗传规律、抗病基因分子生物学研究及防治方法等方面进行了系统的综述。针对目前研究中存在的问题,提出了今后的研究方向和重点。
- 刘书林顾兴芳石延霞李宝聚苗晗王敏王烨张圣平
- 关键词:瓜类蔬菜蔓枯病抗病育种