刘海情
- 作品数：8 被引量：28H指数：3
- 供职机构：广东海洋大学水产学院更多>>
- 发文基金：广东省科技计划工业攻关项目国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 基于12SrRNA和16SrRNA序列的龟鳖类系统进化特征研究被引量：3
- 2012年
- 【目的】研究龟鳖类的系统进化关系,为龟鳖类资源的保护和合理开发利用提供理论依据。【方法】采用PCR扩增和测序的方法,获得小鳄龟(Chelydra serpentina)的12S rRNA和16S rRNA序列,分别结合NCBI中其他龟鳖的同源性序列进行比对分析;基于Kimura双参数模型计算龟鳖类种间、属间、科间的遗传距离;采用邻接(NJ)法、最大简约(MP)法和最大似然(ML)法构建分子系统进化树。【结果】经比对后得到394bp的12S rRNA一致序列和544bp的16SrRNA一致序列,二者合并得到938bp的联合序列。其中,可变位点327个,序列总变异率为34.9%,简约信息位点222个,单变异多态位点105个。T、C、A、G的平均含量分别为23.6%、24.1%、33.5%和18.7%,A+T含量为57.1%,G+C含量为42.8%。在327个可变位点中,转换数为61,颠换数为24,转换/颠换比率(R)为2.54。拟水龟属间的遗传距离为0.021～0.060,平均为0.467;淡水龟科8属之间的遗传距离为0.022～0.110,平均为0.0724;曲颈龟亚目7科(除平胸龟属外)间的遗传距离为0.071～0.123,平均为0.105。分子系统进化树显示,木纹龟属首先和陆龟科聚在一起,然后再与淡水龟科汇聚;中华花龟、大头乌龟与拟水龟属的成员相互镶嵌,聚成一支;鳄龟科、海龟科、棱皮龟科聚为一支;动胸龟科独成一支。【结论】应将龟亚科、淡水龟亚科提升为龟科、淡水龟科,并将大头乌龟、中华花龟并入拟水龟属,而平胸龟应从鳄龟科中分离出来,独立自成平胸龟科。
- 刘海情刘楚吾刘丽
- 关键词：龟鳖类系统进化树
- 基于COⅢ和HNF-1α序列研究龟鳖类的系统进化特征被引量：2
- 2012年
- 用PCR扩增和测序的方法,获得小鳄龟(Chelydra serpentina)的COⅢ和HNF-1α序列,并分别结合NCBI中其他龟鳖的同源性序列进行比对分析。比对后得到757 bp的COⅢ一致序列和769 bp的HNF-1α一致序列。其中,COⅢ一致序列含有可变位点324个,序列总变异率为42.8%,简约信息位点230个;T、C、A、G的平均含量分别为27.5%、26.6%、30.8%、15.1%,A+T含量(58.3%)高于G+C含量(41.7%),转换/颠换比率(R)为2.62。HNF-1α一致序列有变异位点112个,变异率为14.6%,简约信息位点67个;T、C、A、G的平均含量为26.1%、23.1%、28.3%、22.6%,A+T含量为54.4%,G+C含量为45.7%,转换/颠换比率(R)为1.42。基于Kimura双参数模型计算龟鳖类种间、属间、科间遗传距离,并采用邻接法、最大简约法和最大似然法构建分子系统进化树。结果显示:基于COⅢ序列的淡水龟科4个属间的遗传距离为0.090～0.153,平均遗传距离为0.129;曲颈龟亚目5个科之间的遗传距离为0.150～0.207,平均遗传距离为0.177;基于HNF-1α序列的龟科9属间的遗传距离为0.003～0.051,平均为0.016;鳄龟科、龟科、淡水龟科3科间的遗传距离为0.044～0.067,平均为0.053。由遗传距离和构建的系统进化树可知,淡水龟科与陆龟科具有较近的亲缘关系,而与龟科的亲缘关系较远;支持龟科重新划分为两个分支;鳄龟科和海龟科亲缘关系较近,大鳄龟(Macroclemys temminckii)和小鳄龟可能同为一属。
- 刘海情刘楚吾刘丽
- 关键词：龟鳖类系统进化
- 利用微卫星分析吉富罗非鱼群体的遗传多样性被引量：11
- 2012年
- 【目的】为吉富罗非鱼种质资源的保护、评价以及育种提供理论依据。【方法】利用微卫星分子标记技术分析广东省化州光辉养殖场有限公司新选育的吉富罗非鱼第16代群体(F16)的遗传多样性。【结果】筛选出的8个微卫星位点在吉富罗非鱼群体中共检测到44个等位基因,各位点的等位基因数为3～8个,平均5.5个,而平均有效等位基因数为4.77个。等位基因片段长度为118～256bp,平均观测杂合度(H)o为0.8058,平均期望杂合度(H)e为0.7292,群体内个体间在不同位点的平均基因多样性为0.7044,群体内平均固定系数(FIS)为-0.2261,平均多态信息含量(PIC)为0.7044。所检测的8个位点均为高度多态位点(PIC>0.5000)。【结论】研究所选用的吉富罗非鱼群体的多态信息含量较丰富,具有较高的遗传异质性和较大的选育空间,可作为下一步选育工作的基础选育群体。
- 刘海情郭昱嵩王中铎刘丽刘楚吾
- 关键词：吉富罗非鱼微卫星标记等位基因杂合度
- 杂色龙虾线粒体基因组全序列的测定与分析被引量：2
- 2014年
- 为了解杂色龙虾(Panulirus versicolor)线粒体基因组多态位点及遗传变异,对龙虾类的分类研究奠定基础,作者通过常规PCR步移扩增法获得杂色龙虾线的线粒体基因组全序列,分析了其线粒体基因组的基本特征以及基因排列情况,并结合中国龙虾(Panulirus stimposni)、波纹龙虾(Panulirus homarus)线粒体基因组全序列,综合分析了龙虾属线粒体编码基因多态位点及基因变异状况。结果表明:杂色龙虾线粒体基因组全序列为15 700 bp,由13个蛋白质编码基因、22个t RNA基因、2个r RNA基因和D-loop区组成,保持了泛甲壳动物线粒体基因组的原始排列。杂色龙虾线粒体DNA的碱基组成具有AT偏好性,A+T含量为67%,4种碱基的含量分别为(A=34.6%,T=32.1%,C=20.5%,G=12.8%)。预测了杂色龙虾18个t RNA以及2个r RNA的二级结构。龙虾属线粒体基因组中的nad 2、nad 5基因以及D-loop区的多态位点比例较高,适合作为分子标记用于龙虾类系统进化关系、种内多态性以及遗传分化等方面的研究。
- 刘皓姚维刘海情刘楚吾刘丽
- 关键词：线粒体基因组RNA二级结构
- 蛇鳄龟微卫星标记的开发及一个养殖群体的遗传多样性分析被引量：5
- 2013年
- 利用磁珠富集法,以生物素标记的(CA)15为探针,构建了蛇鳄龟(Chelydra serpentina L.)微卫星富集文库。通过PCR法从富集文库中共筛选出70条微卫星序列,一共设计了48对微卫星引物,采用PCR扩增的方法从中筛选出36对引物,对一个蛇鳄龟养殖群体进行遗传多样性分析。通过分析,36个位点获得的等位基因数从2—9不等,平均为4.361,有效等位基因为1.461—7.767,平均为3.498。等位基因片段大小为56—342 bp,观测杂合度为0.067—1.000,平均为0.725;期望杂合度为0.316—0.850,平均0.600;多态信息含量为0.2655—0.8359,平均为0.5573;结果表明此蛇鳄龟养殖群体存在较高的遗传多样性水平。群体内固定系数0.688—0.856,平均为0.214,说明蛇鳄龟群体中杂合子过剩。
- 刘丽刘海情郭昱嵩王中铎刘楚吾
- 关键词：蛇鳄龟微卫星标记磁珠富集法
- 龟鳖类系统进化及蛇鳄龟养殖群体的遗传多样性研究
- 龟鳖类动物隶属于脊索动物门（Chordate）、脊椎动物亚门（Subphylum Vertebrata）、爬行纲（Reptilia）、龟鳖目（Testudines），是爬行动物中十分特化的一个类群。由于生态平衡破坏、环境...
- 刘海情
- 关键词：蛇鳄龟养殖群体
- 文献传递
- 不同饲料对蛇鳄龟生长影响的研究被引量：5
- 2013年
- 在湛江自然温度下,分别用冰鲜鱼、水产配合粉料、水产膨化粒料3种饵料饲养蛇鳄龟289d,以研究饲料对蛇鳄龟生长的影响。结果显示,冰鲜鱼、配合粉料和膨化粒料组平均体质量分别由9.7g增加至168.6g、9.5g增加至269.5g、9.9g增加至359.0g,生长速度,膨化粒料组>配合粉料组>冰鲜鱼组;饵料系数,冰鲜鱼、配合粉料和膨化粒料组分别为6.42、3.69、1.92,冰鲜鱼组>配合粉料组>膨化粒料组,水产膨化粒料的饲料效率最高;蛋白质效率,冰鲜鱼、配合粉料和膨化粒料组分别为0.732、0.546、1.108,膨化粒料组>冰鲜鱼组>配合粉料组,水产膨化粒料的蛋白质吸收效率最高;单位增质量饲料成本,冰鲜鱼、配合粉料和膨化粒料组分别为32.08元、38.77元、23.99元,配合粉料组>冰鲜鱼饵料组>膨化粒料组水产膨化粒料成本优势明显。研究结果还证明了低温抑制蛇鳄龟的生长,3—11月,冰鲜鱼、配合粉料和膨化粒料组月平均增长率分别为64.6%、76.3%、100.6%;12-2月,三组的月平均增长率则分别为12.8%、35.3%、37.2%。因此,在推广蛇鳄龟规模化养殖中恒温下使用膨化颗粒饲料养殖较好。
- 刘海情刘楚吾刘丽
- 关键词：蛇鳄龟饲料
