崔海玉
- 作品数:13 被引量:16H指数:2
- 供职机构:中国水产科学研究院东海水产研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生更多>>
- 我国沿海拟穴青蟹遗传变异的微卫星标记分析
- 拟穴青蟹属于一种肉食性梭子蟹,在我国主要分布于东南沿海海域。本文利用9个多态性微卫星标记分析了11个不同地理种群(分别是三门38只,宁德35只,漳州32只,汕头25只,深圳40只,湛江41只,海口37只,文昌51只,万宁...
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- 关键词:拟穴青蟹微卫星
- 文献传递
- 拟穴青蟹微卫星标记开发及家系遗传变异研究
- 拟穴青蟹隶属于甲壳纲、十足目、短尾亚目、梭子蟹科、青蟹属,是重要的经济养殖蟹类之一.近年来青蟹养殖规模不断扩大,对青蟹苗种的需求量也越来越大,优良品种的选育就显得尤为重要.家系选育是选择育种中的一种重要方式,家系选育过程...
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- 关键词:拟穴青蟹微卫星标记多态性家系
- 拟穴青蟹线粒体COI基因序列克隆及SNPs位点分析被引量:5
- 2011年
- 根据拟穴青蟹(Scylla paramamosain)线粒体全序列设计引物,采用PCR产物双向测序法,克隆了线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因部分序列(761 bp),并筛选、分析了拟穴青蟹的SNPs位点。共分析了采自福建省宁德市的16只拟穴青蟹,另外,从GenBank数据库中下载了31条前人提交的拟穴青蟹COI基因序列(长度在425-522 bp之间)。利用MEGA4.0软件对所有序列进行比对分析,结果表明碱基T、C、A和G的平均含量分别为37.6%、17.8%、28.9%和15.7%,G+C的含量平均为33.5%。分析结果表明,在所克隆的761 bp的COI基因序列中共发现29个SNPs位点,其出现频率为3.8%。在这29个SNPs位点中,13个为C/T转换(占44.8%),12个为A/G转换(占41.4%),2个为A/T颠换(占6.90%),1个为G/C颠换(占3.45%),另有一个位点(201 bp处)发生了A/C颠换和C/T转换两种类型的碱基替换。氨基酸分析表明,在29个SNPs位点中,有9个位点属于非同义突变,引起了氨基酸的变化;其他20个位点属于同义突变,未引起氨基酸的变化。这将为拟穴青蟹遗传背景和群体遗传多样性研究提供新的分子标记。
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- 关键词:拟穴青蟹COI基因SNPS聚合酶链式反应
- 一种拟穴青蟹微卫星分子标记的筛选方法
- 本发明涉及一种拟穴青蟹微卫星分子标记的筛选方法,包括:拟穴青蟹基因组DNA的提取并稀释备用;设计5’锚定引物及PCR扩增;扩增产物的克隆及测序;序列分析及微卫星特异引物设计;使用引物对拟穴青蟹不同地理群体或群体内个体的基...
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- 文献传递
- 拟穴青蟹微卫星标记开发及应用研究
- 拟穴青蟹(Scyllaparamamosain)隶属于甲壳纲(Crustacea)、十足目(Decapoda)、短尾亚目(Brachyura)、梭子蟹科(Portunidae)、青蟹属(Scylla),广泛分布于印度-西...
- 崔海玉
- 关键词:拟穴青蟹微卫星标记野生群体
- 文献传递
- 拟穴青蟹微卫星标记开发及家系遗传变异研究
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- 关键词:拟穴青蟹微卫星标记多态性家系
- 利用PCR-RFLP技术分析拟穴青蟹抗菌肽基因SCY2的SNP位点
- 2011年
- 本研究根据公布的锯缘青蟹SCY2基因序列设计引物SCY2-RFLPs和SCY2-RFLPa,利用PCR-RFLP技术分析了5个地理群体(宁德、汕头、万宁、东方、三亚)共计148个拟穴青蟹SCY2基因的多态性.结果表明,所扩增的SCY2基因片段含有2个StuⅠ内切酶识别位点,位于第一外显子的位点没有多态性,位于第一内含子的位点存在多态性.在148个个体中共检测到AA和AB两种基因型,等位基因B的出现频率非常低,只在三亚群体的1个个体中检测到,而在其他4个群体中均未检测到,其等位基因频率为0.003 4.序列分析结果表明,扩增片段长度为1 016 bp,包含部分5′非翻译区(282 bp)、第一外显子(131 bp)和部分第一内含子(603 bp).AA基因型表现为3条带(从大到小依次为509,356,151 bp),AB基因型表现为4条带(从大到小依次为660,509,356,151bp).B等位基因是由于867 bp处发生了C→G的单碱基突变导致StuⅠ内切酶失去了1个识别位点而形成的.
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- 关键词:拟穴青蟹
- 拟穴青蟹种质资源与转录组测序研究
- 拟穴青蟹是我国重要的海水养殖蟹类和海洋渔业资源,在我国水产养殖产业中占有重要的地位。本研究分析了青蟹属4种青蟹的线粒体COI基因序列,建立了基于PCR方法的分子鉴定技术。采用5种方法开发了拟穴青蟹的多态性徼卫星分子标记。...
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- 关键词:拟穴青蟹种质资源转录组测序
- 利用微卫星和线粒体标记分析海南岛拟穴青蟹遗传多样性
- 拟穴青蟹是我国重要的海水养殖蟹类之一,也是青蟹属4种青蟹中在我国分布最为广泛的一种蟹类.拟穴青蟹广泛分布于海南岛的沿海地区,在渔业经济中占有重要的地位.本研究利用核内(微卫星)和核外(线粒体)分子标记对海南岛6个拟穴青蟹...
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- 关键词:拟穴青蟹微卫星标记
- 利用微卫星标记比较分析拟穴青蟹不同家系的遗传多样性被引量:12
- 2011年
- 拟穴青蟹(Scylla paramamosain)是我国重要的海水养殖蟹类,随着市场需求量的增加及养殖规模的不断扩大,有必要培育高产、抗逆的优质新品种。家系选育是选择育种的有效途径,目前已应用于拟穴青蟹人工育种工作中。本研究利用8个微卫星标记对拟穴青蟹6个家系共275 ind个体进行了遗传多样性分析,共检测到50个等位基因,平均每个位点4-8个,其中3个家系各自在1个位点表现为单态,8个位点的PIC、HO和HE分别在0.40-0.77、0.33-0.81和0.42-0.80之间。对6个家系的分子方差分析(AMOVA)结果显示,家系间的固定系数FST=0.205 7,即总的遗传变异中有20.57%的变异来自家系间,79.43%的变异来自家系内。根据遗传距离采用UPGMA法对6个家系进行聚类分析,4号家系和5号家系之间的遗传距离最小,先聚合在一起,2号家系和6号家系间的遗传距离最大。本研究将为拟穴青蟹家系选择育种提供一定的理论依据。
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- 关键词:拟穴青蟹微卫星家系