徐启聪 作品数:15 被引量:86 H指数:6 供职机构: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家科技基础条件平台建设计划 国家科技支撑计划 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
植原体的最新分类研究动态 被引量:36 2008年 简要介绍了植原体分类研究历史与现状,综述了最新的植原体分类方法和植原体候选种的描述规则,指出了我国在植原体分类鉴定方面与当今世界先进水平的差距及今后发展方向。 赖帆 李永 徐启聪 田国忠关键词:植原体 植原体遗传多样性研究现状与展望 被引量:7 2016年 植原体是引起众多植物病害的一类重要的无细胞壁的原核致病菌,其寄主种类多、危害面积广,对经济、环境等影响严重。大量研究表明植原体存在丰富的遗传多样性。本文就植原体遗传多样性研究现状作一概要评述,并对植原体遗传变异的研究技术、产生机制、与致病性关系等今后可能的研究方向作一展望。对已完成的5个植原体全基因组序列分析发现,它们在大小、结构和功能等方面皆存在显著差异,缺少很多标准代谢所需的基因。不同植原体中质粒的数量、大小和功能等也存在一定差异。植原体含有2个核糖体RNA编码基因,其序列在不同株系中的变异奠定了现今植原体分类鉴定的基础。对植原体蛋白编码基因如核糖体蛋白编码基因(rp)、蛋白延伸因子基因(tuf、fus A)、转运蛋白基因(sec Y、sec A)、效应子及非编码区序列如启动子、假基因等的深入研究可进一步揭示植原体更丰富的遗传变异特征。由于植原体分离培养困难,人们对其形态特征、生理代谢等了解甚少,因而全基因组测序、多位点序列分析等现代分子生物学技术将会成为植原体遗传变异研究的主要手段。植原体遗传多样性研究进展有助于从分子水平上系统地阐明植原体遗传变异规律、系统进化特征及其与寄主(植物和昆虫)、生态环境间的互作和适应关系,并产生新的认识。这对于提高植原体的分类鉴定、致病机制、流行预测及病害防治等研究水平具有重要的作用和意义。 于少帅 徐启聪 林彩丽 王圣洁 田国忠关键词:植原体 系统进化 全国各地不同枣树品种上枣疯病植原体的PCR检测及分子变异分析 为了检测不同地区枣树品种上的枣疯植原体侵染及保守基因序列的变异,本研究利用植原体16S rDNA的通用引物R16mF2/R16mR1, 16S-23S间区序列(SR)的通用引物SR1/SR及跨膜蛋白质基因(sect)引物... 徐启聪 田国忠 王振亮 孔繁华 李永 王合关键词:枣树品种 枣疯病植原体 分子检测 基因测序 猪屎豆丛枝病植原体的分子检测与鉴定 被引量:3 2010年 Crotalaria witches’-broom phytoplasma (CrWB) collected from Hainan Province,was classified and identified by sequencing techniques and Virtual RFLP.Two different type universal primer pairs of phytoplasma were used to amplify a 1.8 kb fragment of 16S rDNA and a 1.3 kb fragment of rp gene.The PCR-amplified products were cloned and sequenced.The results of sequencing and homologuous comparison with other phytoplasmas showed that Crotalaria witches’-broom phytoplasma shared 99.9 % similarity with peanut witches’-broom phytoplasma in 16S rRNA gene and 99.9% in rp gene.Crotalaria witches’-broom phytoplasma is sorted into Peanut witches’-broom group(16SrII),16SrII-A,according to the results of Virtual RFLP of 16S rDNA,phylogenetic analysis of 16S rRNA and rp gene,which is related to Ca.Phytoplasma australasiae. 李永 徐启聪 田国忠 郭民伟 朴春根关键词:植原体 分子鉴定 臭矢菜丛枝病植原体的分子鉴定研究 本实验采用 DAPI 荧光显微镜、PCR、克隆和测序等技术,对海南臭矢菜丛枝病样进行了检测和病原鉴定。以染病臭矢菜总 DNA 为模板应用三对植原体特异性引物进行 PCR 扩增,获得 PCR 产物为16S rDNA(143... 李永 朴春根 徐启聪 田国忠 汪来发 郭民伟文献传递 野生酸枣疯病与栽培大枣疯病发生的关系 被引量:9 2009年 为了明确野生酸枣疯病与栽培大枣疯病发生和流行的关系,采用随机徒步调查、挖根和接穗嫁接法对我国野生酸枣、栽培大枣及大枣接穗嫁接野生酸枣的枣疯病进行了田间调查,并取样检测病菌及比较不同菌株的保守基因序列。结果显示,我国野生酸枣疯病发生范围广,且地区间自然发病率差异很大,在0~40%之间;病株呈明显的团簇状分布,病菌在团簇中的根蘖苗与母株间传播或通过介体昆虫传播到后代种子苗上。在枣疯病流行区,栽培大枣发病与枣园周围分布的野生酸枣发病程度有关;用感病品系的接穗或带菌接穗嫁接到野生酸枣砧木上易导致嫁接苗发病和病害流行,而采用抗病的壶瓶枣和婆枣抗病品系接穗嫁接野生酸枣则发病率明显下降。用巢式PCR进行的病菌检测结果显示,在病害流行区酸枣或大枣无症状枝叶样品的带菌检出率为10%~32%。不同地区栽培大枣和野生酸枣上植原体的16SrDNA、16S-23SrDNA间区(SR)及核糖体蛋白基因(rp)序列比较鉴定结果显示,侵染酸枣的植原体与栽培大枣疯病植原体应为相互传染的同种致病菌。 田国忠 徐启聪 李永 温秀军 王振亮关键词:枣疯病植原体 野生酸枣 抗病品种 嫁接繁殖 中国各地不同枣树品种上枣疯病植原体的PCR检测及分子变异分析 被引量:28 2009年 【目的】检测不同地区枣树品种上的枣疯植原体侵染及保守基因序列的变异。【方法】利用植原体16S rDNA的通用引物R16mF2/R16mR1、16S-23S间区序列(SR)的通用引物SR1/SR及secY基因引物FD9f/r,通过PCR检测采自国内7个地区14个枣树品种上的32个枣疯病和4个酸枣丛枝病样品。将PCR产物进行直接或克隆测序,结合已报导的测序数据,进行序列同源性和系统进化分析。【结果】所有枣疯病样品中均检测到植原体;皆属于榆树黄化16SrV-B亚组,与我国重阳木丛枝和樱桃致死黄化遗传关系更近,而与国外的其他植原体亲缘关系较远。不同地区和不同抗性品种上的植原体在16S rDNA、SR和secY基因上都存在程度不同的序列差异。直接测序法检出的优势株系分布范围很广。不同株系间的secY基因变异比16S rDNA和SR更明显,某些碱基替换并不影响编码氨基酸种类,但有的株系的碱基缺失使编码框中断。【结论】不同地区不同品种枣树上枣疯植原体间存在着较为丰富的遗传多样性,与PCR产物直接测序法相比,用克隆测序结果能检测到更多的碱基突变,对于鉴别不同植原体株系及研究其系统发育关系更为有用。 徐启聪 田国忠 王振亮 孔繁华 李永 王合关键词:枣疯病 植原体 分子变异 泡桐丛枝病植原体南阳分离物延伸因子(EF-Tu)tuf基因的克隆、原核表达及抗血清的制备 <正>泡桐为玄参科(Scorphulariaceae)泡桐属(Paulownia)落叶乔木的通称,在我国有2000多年的栽培历史,是重要的速生用材树种。泡桐丛枝病(Paulownia witches-broom,PaWB... 王洁 竺晓平 李向东 李永 林彩丽 高瑞 徐启聪 朴春根 李怀方 田国忠文献传递 泡桐丛枝病病树周围几种植物上植原体的分子检测 被引量:10 2010年 【目的】初步明确自然条件下可能感染泡桐丛枝病植原体的寄主植物。【方法】用植原体16S rRNA基因的通用引物,对从泡桐丛枝病病树周围采集的表现黄化、小叶、皱叶、丛枝等症状或无症状的16种植物样品的DNA进行巢式PCR扩增,对所扩增的片段进行序列测定和分析。并利用泡桐从枝病植原体延伸因子的抗血清对部分样品进行间接免疫荧光观察。【结果】巢式PCR结果显示从牛筋草(Eleusine indica)、辣椒(Capsicum annuum)、狗尾草(Setaria viridis)、山药(Dioscorea opposita)、灯笼泡(Physalis angulata)、花生(Arachis hypogaea)及南瓜(Cucurbita moschata)共7种植物样品和阳性对照PaWB菏泽分离物(PaWB-HZ)中均得到了约1.2kb的特异性片段。序列分析表明这7种植原体分离物和PaWB-HZ属于翠菊黄化组的16SrI-D亚组。对所采集的植原体侵染的寄主植株辣椒、山药、花生、南瓜和泡桐进行间接免疫荧光观察结果显示,仅在PaWB-HZ侵染的泡桐中发现翠绿色特异荧光,在健康泡桐及其它4种分离物侵染的植物中均未检测到明显的植原体特异荧光。【结论】首次从泡桐丛枝病病树周围存在的7种其它植物中检测到植原体,并且测定其植原体16S rDNA核苷酸序列与泡桐丛枝植原体相关基因片段高度同源,初步推测这7种植物可能是泡桐丛枝病植原体自然寄主或是通过昆虫偶尔被感染。 王洁 田国忠 徐启聪 刘永光 高瑞 李向东 竺晓平关键词:泡桐丛枝病 植原体 RRNA基因 间接免疫荧光 寄主植物 中国不同地区地不同枣树品种上枣疯植原体的分子鉴定及变异分析 枣树原产于中国,栽培历史悠久,适生范围广,有700余个品种。由植原体侵染引起的枣疯病是我国许多枣产区枣树上的毁灭性病害,严重影响红枣产业的发展和农民的致富。已知不同的枣树品种对枣疯病的抗性存在明显差异,且不同的品种分布区... 徐启聪关键词:枣树品种 分子鉴定 抗病资源 文献传递