李文超
- 作品数：15 被引量：102H指数：6
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- 2007-2010年湖南省B型流行性感冒病毒基因特性分析被引量：4
- 2012年
- 目的了解湖南省2007-2010年B型流行性感冒（简称流感）病毒基因变异情况。方法选取2007-2010年湖南省流感监测网络实验室分离到的42株B型流感病毒毒株，对其血凝素重链区（HAl）及神经氨酸酶（NA）基因进行RT-PCR，扩增产物纯化后进行序列测定，测序结果与2007-2010年WHO北半球流感疫苗株序列进行同源性比对，绘制基因进化树并进行分子特征分析。结果HAl基因进化树中，在Victoria系分支中，2007-2009年的毒株在V1分支中，与疫苗株Malaysia／2506／2004类似；2010年的毒株在V2分支中，与疫苗株Brisbane／60／2008类似；在Yamagata系分支中，2007年的毒株在Y1分支中，与2008-2010年的毒株（Y2分支）在进化树上距离较远。NA基因进化树中所有病毒均在Yamagata系分支中，为Yamagata系来源。对2010年的7株病毒全基因序列分析显示，病毒为基因型2和15型。HAl分子与WHO推荐的流感疫苗株进行比较，Victoria系的同源性：2007年为98．6％-99．1％、2008年为98．6％-99．1％、2009年为98．1％-99．1％、2010年为97．6％-99．1％。Yamagata系：2007年为97．9％-98．5％、2009年为97．9％-98．5％、2010年为97．9％-98．2％。2007年毒株的主要突变位点为：R48K，K88R，P108A，D197N和S230G。而2009-2010年毒株的突变主要集中在：K88R，S150I，N166Y，D197N和S230G。结论2007-2010年湖南省人群中流行的B型流感病毒持续发生着变异。
- 刘运芝赵翔黄一伟陈长李芳彩高立冬李希妍李文超胡世雄谭敏菊张恒娇张红
- 关键词：流感病毒B型序列同源性抗原变异
- 2017—2020年湖南省哨点监测流感样病例流行特征被引量：13
- 2022年
- 目的 通过分析湖南省2017—2020年度流感样病例(influenza-like illness, ILI)的哨点监测结果,了解湖南省ILI流行病学特征,为湖南省流感防控提供依据。方法 通过中国流感监测信息系统,收集2017—2020年度湖南省ILI哨点监测数据和病原学检测数据,采用Excel 2007、SPSS 20进行统计分析。结果 2017—2020年湖南省23家哨点医院总共报告799 699例ILI,ILI%为4.58%。2017—2018年、2018—2019年、2019—2020年度ILI%分别为5.23%、4.12%、4.42%(χ^(2)=8 469.13,P<0.05);2017—2020年监测年度的ILI报告数年龄别分布相似,构成比依次顺位为0~岁、5~岁、25~岁、15~岁、60~岁组;2017—2020年度的ILI%波动区间在1.86%~7.58%之间。在冬春季(12月至次年2月)和夏季(5—7月)期间出现两个高峰。三个年度ILI%走势基本一致;湖南省各市州之间ILI%报告总体有差异(χ^(2)=173 310.88,P<0.05),居前五位的市州分别是岳阳市、永州市、湘潭市、张家界市、常德市;2017—2020年度湖南省哨点医院共采集ILI标本77 754份,检出流感病毒阳性12 243份,阳性率15.75%,阳性标本中A(H3N2)占35.87%、A(H1N1)占29.69%、B(Victoria, BV)占19.05%、B(Yamagata, BY)系占15.18%。结论 2017—2020年湖南省ILI流行呈现冬春季和夏季两个流行高峰。总体上2017—2020年以A型毒株为主要的流行优势毒株,主要感染人群是5岁以下的儿童。
- 曾舸黄超洋王小磊刘子言罗垲炜黄一伟李文超赵善露戴志辉陈生宝杨浩孙倩莱胡世雄
- 关键词：流感样病例病原学
- 2009-2010年长沙市哨点医院住院严重急性呼吸道感染病例监测分析被引量：7
- 2011年
- 目的了解住院严重急性呼吸道感染(SARI)病例流行病学特征、临床特征及流行性感冒(流感)病毒感染情况。方法对长沙市某哨点医院监测到的SARI病例进行流行病学调查及采集咽拭子标本开展流感病毒核酸检测。结果 2009年11月至2010年12月共监测住院SARI病例179例,主要来自儿内科、呼吸内科和神经科;病例的发病时间主要集中在2009年第48周至2010年第3周,共122例;年龄中位数为38岁(0～90岁),不同年龄组住院SARI病例中的确诊流感病例比例差异有统计学意义(χ2=20.321,P=0.002),以5～14岁组最高,占62.50%;流感病毒核酸阳性病例53例,阳性率为29.61%,其中41例为甲型H1N1流感,占77.36%;并发症肺部感染发生率最高,占56.42%,流感病毒检测阳性组和阴性组各项并发症发生率的差异无统计学意义。结论住院严重急性呼吸道感染病例监测丰富了流感监测的内容,为流感防控工作提供了科学依据。
- 张恒娇黄一伟潘慧琼张斯钰李文超邓志红刘运芝胡世雄
- 关键词：流感病毒
- 中国大陆地区H9亚型禽流感病毒时空进化分析被引量：1
- 2019年
- 目的从分子水平研究中国大陆地区H9亚型禽流感病毒的起源、进化和地理扩散情况,为禽流感的防控提供科学依据。方法从全球公共流感病毒数据库收集中国大陆地区的H9亚型禽流感病毒HA基因序列,通过对下载的序列进行比对和聚类筛选,得到1997—2018年180株含有准确采样信息的序列,使用BEAST等生物信息学软件分析病毒选择压力、构建贝叶斯法时间进化树以及重建病毒进化时空动态。结果序列的核苷酸差异在0.2%~20.7%之间,氨基酸的差异在0.0%~15.8%之间。编码区的核苷酸替代率分别为:0.540、0.607和1.853。非同义突变率与同义突变率的比值的平均值为0.1789,但是在7个位点上比值大于1。HA基因的平均进化替代率为2.476×10^-3替换/位点/年,最早的公共祖先出现在1947.457年。构建的基因进化树的拓扑结构分为多个分支,根节点最有可能的位置是广东省,后验概率为21.7%。基于目前数据的时空动态分析显示,1959—2018年间病毒从广东传播到安徽,再到广西、江苏,再以江苏为中心向周边多个省份传播,最后在多个省份之间出现传播。其中江苏传出的6条路径具有统计学支持。结论H9亚型禽流感病毒出现的时间可能比国内最早报导的早很多,在中国多个省份之间传播扩散情况复杂,江苏省是传播扩散的一个重要中心。
- 黄一伟张红李文超黄超洋黄凰
- 关键词：H9亚型禽流感进化分析
- 湖南省甲型H1N1流感病毒感染状况及快速血清学调查研究被引量：1
- 2011年
- 目的了解不同时期湖南省人群甲型H1N1流感病毒感染状况和评估方法。方法在长沙市选择14个医疗卫生机构于2009年11月至2010年3月期间，先后5次进行甲型H1N1流感病毒血凝抑制（HI）抗体阳性率快速调查，并与全省抽样调查结果比较。结果共有2131名对象参与快速调查，五次调查的全人群标准化抗体阳性率依次为9．32％、14．62％、31．08％、28．43％和22．80％；6～17岁年龄组人群的抗体阳性率最高；调查对象甲流抗体阳性中仅9．84％可归因于疫苗接种；快速血清学调查与同期全省抽样调查所得标准化抗体阳性率差异无统计学意义（P〉0．05）。结论湖南省人群的甲型流感抗体阳性率在2010年1月下旬时最高；在急性传染病大规模流行期间，可以采用小范围的快速调查评估感染状况。
- 刘运芝王五红李芳彩杨浩张红邓志红王媛陈长李文超张恒娇刘富强张斯钰胡世雄
- 2011年湖南省某些地区流行性腮腺炎病毒基因特性分析被引量：4
- 2013年
- 目的了解湖南地区流行性腮腺炎（流腮）病毒流行株基因特性及变异情况。方法采用Vero／SLAM细胞分离流行性腮腺炎病毒，通过小疏水蛋白基因（SH基因）的序列分析，与其他基因型参考株进行同源性比较，构建亲缘进化树。结果从2011年湖南多地区上送的16份咽拭子标本中分离到腮腺炎病毒4株，通过基因特性分析，4株毒株均属于F基因型。结论2011年湖南省流行性腮腺炎的流行株为F基因型，未发现基因型变异。
- 李芳彩张红向星宇黄一伟李文超刘运芝崔爱利邓莉
- 关键词：流行性腮腺炎腮腺炎病毒流行病学分子
- 2007-2016年湖南省流感监测结果分析被引量：26
- 2018年
- 目的了解2007-2016年湖南省流感流行规律,为今后的流感防控工作提供科学依据。方法运用描述流行病学方法对2007-2016年湖南省流感样病例(influenza like illness,ILI)数据、流感毒株分离数据和流感暴发疫情数据进行分析。结果 2007-2016年哨点医院共报告ILI病例1 520 652例,占就诊病人总数的百分比(ILI%)为4.82%。0~岁、5~岁、15~岁、25~岁和60~岁五个年龄组的ILI人数分别占ILI病例总数的65.98%、20.77%、4.49%、6.68%和2.08%;湖南省流感流行呈现冬春季和夏季双高峰;共分离到流感病毒8 788株,分离率为5.99%,毒株分型为H1N1 476株、新甲型(H1N1)pdm09(新甲H1)2 422株、H3N2 2 985株、B型Yamagata系(BY)1 361株和Victorian系(BV)1 532株、未定型12株,不同型别毒株每隔1~2年成为优势毒株;共报告ILI暴发疫情264起,230起发生在中、小学校,占总疫情的87.12%。结论冬春季和夏季是湖南省的流感流行高峰;H3、新甲型H1和B型流感毒株每隔1~2年交替成为优势毒株;中小学校是流感暴发疫情的高发场所,应重点加强防控。
- 黄超洋张恒娇高立冬黄一伟邓志红李芳彩李文超刘运芝湛志飞李俊华张红
- 关键词：流感流感样病例流感病毒
- 湖南省2014-2017监测年度流行性感冒哨点监测病原学结果分析被引量：29
- 2018年
- 目的通过分析湖南省2014年第14周~2017年第13周流行性感冒(流感)哨点监测病原学检测结果,研究流感的流行特征和规律。方法全省14个市州的23家哨点医院,每家医院每周采集20例流感样病例的咽拭子标本,标本采用病毒分离方法检测,并采用血凝试验和血凝抑制试验进行病毒鉴定与分型,检测结果进行描述分析并使用统计学软件进行计算。结果 2014-2017年湖南省共检测流感样病例标本78 909份,分离并鉴定出流感毒株4 061株,检测阳性率为5.15%。毒株的型别分布为:H3N2亚型占有最高比例,占42.28%(1 717/4 061),其次为B型Victoria系和甲型H1N1亚型,分别占21.08%(856/4 061)和20.46%(831/4 061)。流感确诊病例年龄组构成比最多的为1~4岁组,占35.34%(1 434/4 058)。男性确诊病例多于女性,男女性别比1.27∶1(2 270∶1 788)。时间分布上一共主要有5个流行高峰出现。三年检测阳性率最高的市州分别是长沙(9.75%)、株洲(11.59%)和湘潭(8.12%)。结论湖南省2014-2017年度流感流行的季节性特征明显,每年优势毒株不同,15岁以下的少年儿童可能为流感的高发群体。
- 黄一伟张红张斯钰李文超曾舸黄超洋张恒娇蔡亮邓志红湛志飞
- 关键词：流感哨点监测病原
- 湖南省2009～2011年甲型H1N1流感哨点监测病原学结果及病毒基因特性分析被引量：3
- 2013年
- 了解和掌握2009～2011年湖南省甲型H1N1流感流行动态和变化规律,掌握甲型H1N1流感流行株基因特性及耐药性情况。收集哨点医院采集的流感样病例咽拭子标本,通过荧光PCR法或病毒分离法对流感病毒进行检测,选取部分阳性毒株进行基因序列测定,序列使用MEGA 5.05软件完成进化分析。2009年第20周至2011年52周,共检测标本17 773份,检出流感阳性标本3 831份,检测阳性率为21.6%,其中甲型H1N1流感阳性标本1794份,占流感阳性的比例为46.8%。甲型H1N1流感共有2个流行高峰,分别出现在2009年第41～53周和2011年第1～12周。测序的23株毒株HA基因亲缘关系较近,病毒在基因进化树中基本上按照时间顺序分布。全基因组序列分析显示7株毒株的所有8个基因片段均与疫苗株同源,并未发现基因重配。23株毒株的HA氨基酸位点相对于疫苗株高度相似(同源性为98.2%～100%),但均有P83S、S203T和I321V的突变。在A/Hunan/YQ30/2009毒株中发现了可能导致病毒毒力增强的222位点突变,突变为D222E。所有检出毒株均未发现对奥斯他韦耐药性的突变。2009～2011年湖南省甲型H1N1流感流行呈双峰分布,未发现病毒基因发生大规模变异,临床上使用奥斯他韦仍然是有效的。
- 张红黄一伟刘运芝李芳彩陈长李文超邓志红胡世雄高立冬
- 关键词：甲型H1N1流感基因特性
- 2009-2018年湖南省甲型H1N1亚型流感病毒监测结果及其全基因组进化分析被引量：6
- 2019年
- 目的分析2009-2018年湖南省流感哨点医院甲型H1N1亚型流感监测结果,对分离病毒全基因组进化情况和分子特征进行分析。方法在全省14个市州的23家哨点医院开展流感监测工作,每周每家哨点医院门诊采集5~20份流感样病例的咽拭子标本进行核酸检测和/或病毒分离。对分离的毒株全基因测序,使用BEAST软件贝叶斯方法构建基因进化树,序列与疫苗株进行比较。结果2009-2018年湖南省流感监测哨点医院共采集流感样病例标本190289份,其中甲型H1N1流感阳性8014份,阳性率为4.21%。时间分布共有7个较明显的流行高峰,峰值以2009年最高。1~5岁(占25.13%)和5~15岁(占32.83%)年龄组所占比重较多,人群男女性别比为1.23∶1。对分离的60株甲型H1N1亚型流感病毒进行同源性分析,与疫苗株相比全基因组序列的同源性在97.2%~99.9%之间。贝叶斯基因进化树呈现阶梯状生长。推断最早的公共祖先出现在2009.177年,平均进化速率为2.695×10-3个替换·位点-1·年-1。贝叶斯天际线模型分析甲型H1N1流感的种群动态2009-2018年间基本维持稳定。表面蛋白选择压力分析dN/dS值为0.201与0.219。表面蛋白血凝素分子的主要变异位点为L8M、S91R、S160G、S181T、A214T、I312V。2株病毒神经氨酸酶分子出现H275Y耐药位点的突变。结论2009-2018年湖南省每年甲型H1N1流感阳性率和甲型H1N1流感所占流感比例各不相同,流行高峰出现在冬季,病例以儿童和少年为主,病毒基因持续变异,种群动态稳定。
- 黄一伟张斯钰湛志飞曾舸黄超洋胡世雄李文超张红高立冬
- 关键词：流感基因进化
