汪洋 作品数:151 被引量:185 H指数:9 供职机构: 中国农业大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家科技支撑计划 广州市科技计划项目 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 生物学 轻工技术与工程 更多>>
动物源细菌的酰胺醇类药物耐药基因四重PCR检测试剂盒 本发明公开了一种动物源细菌的酰胺醇类药物耐药基因四重PCR检测试剂盒。本发明提供了检测细菌对酰胺醇类药物耐药性的引物组,由引物对1、引物对2、引物对3和引物对4组成;本发明的实验证明,本发明根据细菌中主要的4个酰胺醇类药... 沈建忠 吴聪明 汪洋 李君文献传递 全基因组测序与生物信息学分析在细菌耐药性研究中的应用 被引量:17 2019年 随着耐药细菌的大量出现及广泛传播,细菌耐药性成为全球备受关注的问题。耐药细菌的特征如耐药基因、毒力因子、质粒分型等以及不同菌株间亲缘关系对于细菌耐药性流行病学及分子生物学的研究有着十分重要的意义。但是传统的技术手段如聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)和脉冲场凝胶电泳(Pulsed field gel electrophoresis,PFGE)等得到的结果不够全面且精确度低,对于现有的研究存在很大的局限性。全基因组测序技术(Whole genome sequencing,WGS)和生物信息学分析(Bioinformatics analysis)由于能够快速详尽地得到耐药细菌的特征,也能更加精细地判断不同菌株间的进化关系,逐渐成为更加有效的技术手段,为耐药性研究提供了有效的帮助。因此,文中系统地介绍全基因组测序分析流程中的各个步骤,主要包括文库构建、平台测序以及后期数据分析三大方面的不同方法和其相应的特点,期望相关研究人员对此能够有更全面的了解,并得到一定的帮助。 沈应博 史晓敏 沈建忠 汪洋 王少林关键词:耐药性 全基因组测序 生物信息学 河南猪源大肠杆菌mcr-1阳性菌株分离鉴定及耐药表型研究 [目的]多黏菌素E是治疗革兰氏阴性菌,尤其是耐碳青霉烯类药物菌株所引起感染的最后一道防线。而可转移黏菌素耐药基因mcr-1的出现使得抗感染的最后一道防线岌岌可危。研究表明畜禽养殖业是mcr-1基因产生的源头。本研究以河南... 付玉林 王政 杜向党 汪洋关键词:大肠杆菌 多黏菌素E 北京地区宠物源mcr-1阳性大肠杆菌的分子流行特征研究 [目的]通过对2012-2016年五年间的宠物源多粘菌素耐药大肠杆菌进行mcr-1基因的检测,研究mcr-1阳性大肠杆菌在宠物源的流行情况和分子特征。[方法]在 2012年至2016年五年间从中国农业大学动物医院共采集到... 雷蕾 欧嫣然 吴逸璠 李玫 汪洋 沈张奇关键词:耐药性 大肠杆菌 用于检测四环素类抗生素耐药基因的荧光定量PCR成套试剂及其应用 本发明公开了用于检测四环素类抗生素耐药基因的荧光定量PCR成套试剂及其应用。本发明首先公开了用于检测四环素类抗生素耐药基因的成套试剂,由试剂I和试剂II组成。本发明进一步公开了检测待测样本中是否含有四环素类抗生素耐药基因... 王少林 李一鸣 沈建忠 沈张奇 汪洋我国部分地区禽源弯曲菌的流行及耐药性调查 【目的】了解我国部分地区禽源弯曲菌流行及其耐药情况,为养殖过程中使用抗生素所引起的弯曲菌耐药风险评估与防控提供数据支持。同时,为保障公共卫生安全提供科学依据。【方法】2013年从我国三个地区,包括广东、宁夏、上海,采集禽... 姚红 董延妮 刘德俊 刘志海 汪洋 吴聪明 沈建忠关键词:禽源 弯曲菌 耐药性 文献传递 多重耐药基因cfr在耐甲氧西林金黄色葡萄球菌中的分子分型 【目的】:了解我国部分地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌中多重耐药基因cfr阳性菌株的分子分型及传播情况。【方法】:2013-2014年从我国广东,上海,山东和河南等猪场,屠宰场及动物医院分离到460猪MRSA菌株,设计cfr... 李德喜 樊润 汪洋 吴聪明关键词:CFR MRSA 分子分型 文献传递 白屈菜红碱在抑制黏菌素耐药基因转移中的应用 本发明公开了白屈菜红碱在抑制黏菌素耐药基因转移中的应用。本发明通过接合转移试验证明了白屈菜红碱可以显著抑制携带黏菌素耐药基因mcr‑1的质粒在大肠杆菌间的转移。由此可见,白屈菜红碱可以抑制黏菌素耐药质粒的传播,为黏菌素耐... 汪洋 吴聪明 王雪杨 宋黄威 张慕琛 邹之宇 杨思源 沈应博 刘德俊 沈建忠机器学习方法在预测细菌耐药表型中的应用 2024年 随着我国经济迅速发展和医疗需求不断增长,人医临床、宠物临床和畜牧养殖行业中抗菌药物的使用愈发频繁,导致病原菌耐药问题日趋严峻,造成公共卫生安全隐患。快速、准确的细菌耐药表型检测能够有效指导临床医生对感染性疾病的诊断和治疗,降低由经验用药和不合理用药引发的耐药风险。然而,现有检测技术耗时较长且操作繁琐,难以在临床中推广,种类单一的快速检测试剂等产品又无法满足临床的多元化需求。因而,亟需开发新的技术方法以提供快速鉴定细菌耐药表型的有效解决方案。细菌的组学信息中蕴含大量与细菌耐药表型相关的特征,从中快速、准确地挖掘相关信息能够为快速诊断和治疗提供帮助。机器学习模型在处理复杂结构数据方面有显著优势,在挖掘组学信息工作中展示巨大应用潜力。随着该领域的快速发展,机器学习方法有望为临床快速、准确地预测耐药表型提供技术支持,助力医生诊疗准确性的提升。本综述系统总结了机器学习模型在细菌耐药表型预测领域的研究现状和发展趋势,并比较了不同机器学习方法的特点和性能,同时归纳总结细菌耐药表型预测建模工作所需的关键要素,为后续相关研究提供参考。 邹之宇 张凯英 马士珍 杨璐 陈丝雨 吕艳丽 吴聪明 沈建忠 夏兆飞 王璐 汪洋关键词:细菌耐药性 细菌对磷霉素耐药分子机制研究进展 姚红 汪洋 马立才 邓凤如 董延妮 刘德俊 沈建忠