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赵超

作品数:2 被引量:3H指数:1
供职机构:复旦大学基础医学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金上海市科学技术委员会科研基金更多>>
相关领域:医药卫生更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇医药卫生

主题

  • 2篇蛋白
  • 1篇蛋白质
  • 1篇蛋白质组
  • 1篇蛋白质组学
  • 1篇蛋白质组学研...
  • 1篇定量蛋白质组...
  • 1篇原位
  • 1篇原位杂交
  • 1篇突变
  • 1篇突变型
  • 1篇肿瘤坏死因子
  • 1篇肿瘤坏死因子...
  • 1篇细菌感染
  • 1篇相关蛋白
  • 1篇坏死因子
  • 1篇基因
  • 1篇基因功能
  • 1篇分枝杆菌
  • 1篇杆菌
  • 1篇白质

机构

  • 2篇复旦大学
  • 1篇三峡大学

作者

  • 2篇牛辰
  • 2篇赵超
  • 1篇高谦
  • 1篇施旭骏
  • 1篇王德成
  • 1篇王风华
  • 1篇彭刚
  • 1篇谢玲玲

传媒

  • 1篇微生物学报
  • 1篇微生物与感染

年份

  • 1篇2017
  • 1篇2016
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
肿瘤坏死因子α突变型斑马鱼在海分枝杆菌感染中的应用研究被引量:1
2017年
肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factorα,TNF-α)作为重要的炎性细胞因子,在类风湿关节炎、感染性休克等疾病的发病中起重要作用。为探究TNF-α在宿主抵抗海分枝杆菌感染中的作用,本研究采用成簇的规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9[clustered regularly interspaced short palindromic repeat(CRISPR)/CRISPR-associated protein 9(Cas9),CRISPR/Cas9]技术,使野生型斑马鱼TNF-α基因发生突变,成功构建并筛选出含有移码突变的TNF-α突变型(TNF-α-/-)斑马鱼。利用原位杂交技术,发现TNF-α-/-斑马鱼中TNF-αmRNA表达水平显著降低。与野生型斑马鱼相比,海分枝杆菌在TNF-α-/-斑马鱼体内扩散和增殖更显著。结果提示,本研究成功构建TNF-α-/-斑马鱼,有助于深入探究TNF-α在斑马鱼抵抗海分枝杆菌感染中的作用及其免疫调节机制。
谢玲玲王风华王德成赵超彭刚牛辰
关键词:肿瘤坏死因子Α原位杂交细菌感染
应用iTRAQ定量蛋白质组学研究海分枝杆菌mkl的基因功能被引量:2
2016年
【目的】通过分离海分枝杆菌野生株和mkl突变株的全菌蛋白,并进行差异蛋白质组分析,以期为探索分枝杆菌重要毒力基因mkl的功能提供新思路。【方法】以海分枝杆菌野生株和mkl突变株为研究材料,提取全菌蛋白,i TRAQ试剂标记后进行质谱鉴定和定量分析,并利用Uni Prot数据库对差异蛋白进行生物信息学分析。【结果】共鉴定出在野生株和mkl突变株中差异表达蛋白566个,其中在突变株中上调表达蛋白232个(比值≥1.4),下调表达蛋白334个(比值≤0.7)。生物信息学预测这些蛋白主要参与细菌脂质代谢、细胞壁和细胞进程、中间代谢、呼吸作用等生物学功能。其中Des A3下调最显著,其功能为脂肪酸去饱和酶,与油酸合成相关,进一步验证发现mkl突变株在不含油酸的固体培养基中生长受限,提示mkl可能在油酸的生物合成通路中发挥功能。【结论】通过i TRAQ分析了海分枝杆菌mkl突变株和野生株的差异表达蛋白谱,发现可能影响分枝杆菌油酸、脂质等合成代谢通路,为进一步研究mkl基因在分枝杆菌致病中发挥作用的相关机制奠定了基础。
施旭骏赵超牛辰高谦
关键词:分枝杆菌定量蛋白质组学ITRAQ
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