金钟
- 作品数:65 被引量:64H指数:5
- 供职机构:中国科学院计算机网络信息中心更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划中国科学院战略性先导科技专项更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术理学文化科学动力工程及工程热物理更多>>
- GROMACS在鲲鹏920平台的性能分析及运行优化
- 2024年
- 【应用背景】ARM众核架构处理器以其高性能、高并行性及低功耗的特点,在分子动力学、流体及天气模拟等领域扮演着越来越重要的作用。【局限】然而,分子动力学模拟软件运行时不同维度的任务分解策略(如粒子作用、时空域分解等)、多样化的并行策略导致负载特征多样而与众核处理器基于高度并行的计算资源所产生的算力这一特点难以很好地匹配,进而导致各计算单元运行时效率低的问题已成为了限制运行时性能提升的重要瓶颈之一。【方法】针对这一问题,以华为技术有限公司自主研发ARM架构鲲鹏920处理器和GROMACS软件为研究对象,通过对鲲鹏920处理器结构特点和算力特征、GROMACS软件任务分解、并行执行过程进行深入分析,提出运行时并行参数优化策略,以更好地适配软件的算力需求和硬件的算力特点,提升了软件计算性能。【结果】通过系统分析性能瓶颈并实践优化策略,相比优化前取得了16.9%的加速效果。【结论】此研究成果可为分子动力学模拟在众核计算环境下的性能优化、国产高性能计算系统及分子动力学模拟专用机等的研发提供一定的参考依据。
- 原惠峰陆腾朱延超晏臣马英晋刘倩金钟
- 关键词:分子动力学GROMACS
- 基于云平台的计算化学科学计算云服务社区
- 计算化学云服务社区采用软件即服务的模式,使用浏览器/服务器结构来提供专业交互式的计算化学科学计算服务,以“降低使用门槛、提高使用效率,助跑计算化学用户的科学研究工作”为目标,研究社区中各种软硬件资源的分类方式,方便用户快...
- 刘倩金钟曹荣强
- 关键词:计算化学软件开发功能模块
- 文献传递
- 基于Intel MIC平台大规模耗散粒子动力学模拟的设计与优化
- 2017年
- 耗散粒子动力学(DPD)模拟是一种重要的研究流体动力学特性的计算模拟方法,基于Intel MIC平台设计实现了面向大规模耗散粒子动力学模拟,充分结合了DPD模拟本身的特性和MIC平台的特征。对DPD模拟中的近邻列表构建和短程作用力关键代码实现了向量化优化,在CPU和MIC协处理器之间采用任务计算负载平衡机制,支持MPI进程内线程数量负载平衡控制。分别在原型程序上和LAMMPS集成中做了性能对比分析,实验结果显示了引入相关优化技术的有效性,为进一步研究面向MIC众核平台的分子动力学相关工作奠定了基础。
- 徐顺刘倩张宝花何连花金钟
- 关键词:耗散粒子动力学图像处理单元分子动力学
- 一种材料智慧专家系统
- 本申请提供了一种材料智慧专家系统,包括:多源数据管理模块,对多种类型的材料数据库中的数据进行融合,构建结构化数据库;处理模块,获取以自然语言方式输入的用户提问,用户提问包括材料需求和/或计算需求;根据材料需求在结构化数据...
- 张宝花许黄超刘倩马英晋李天颜金钟
- 基于网格的计算化学应用整合系统
- 本发明公开了一种基于网格的计算化学应用整合系统,包括分布式的化学资源部、网格中间件部、操作界面部;分布式的化学资源部分布在不同的网格结点,该部内设有安装了计算化学应用软件的计算资源和与化学领域相关的概念及方法的化学知识单...
- 金钟段启智刘倩张宝花迟学斌
- 文献传递
- 基于网格的高性能计算化学系统SCChem最新进展
- 金钟刘倩张宝花段启智迟学斌
- 关键词:网格计算蛋白质二级结构JAVAAPI
- 燃烧数据平台设计与实现
- 燃料燃烧作为发动机的共性问题,对其过程的研究有着重要的意义。动力学建模是发动机燃烧数值模拟的必要条件,高精度动力学模型和数据库系统是发动机研发的重要基础。本工作依托"发动机燃烧的动力学模型和数据库系统"重大计划集成项目,...
- 张宝花金钟任海生王静波李象远
- 关键词:航空燃料数据库检索
- 文献传递
- 基于GRIDMOL的等密度图算法实现与应用
- 等密度图是由一系列密度相同的点所构成的面,它在高分子材料研究领域应用广泛。本文介绍了基于高性能计算化学系统(SCCHEM)的GRIDMOL程序中等密度图显示功能的实现。应用MARCHING CUBES算法实现,并采用法向...
- 底杏杏陈建华刘倩金钟
- 关键词:高分子材料
- 文献传递网络资源链接
- 燃烧动力学平台设计
- 2022年
- 燃料的相关研究在发动机研制中扮演着重要角色,数据是燃烧模型耦合的基础,反应机理是燃烧数值模拟的关键.针对我国在燃烧数据库建设方面的短板问题和个性化燃烧反应机理构建的迫切需求,本文设计了燃烧动力学平台,包括燃烧数据库和燃烧反应机理在线计算系统.燃烧数据库系统通过数据的标准化和分级管理建立了高效的搜索流程,形成了国内独有的多类型理论和实验数据检索系统,并通过数据的汇交与审核机制保证可以吸收高质量数据到平台.燃烧反应机理在线计算系统通过基于Web交互式分子建模,建立了软件输入文件创建、计算与结果获取一站式计算流程.通过燃烧动力学平台的建设和应用,将减少我国对国外数据平台的依赖,推动国内基础燃烧反应数据的交流与共享,显著降低燃料反应机理软件使用门槛,进一步深化燃烧反应领域的创新研究.
- 张宝花任海生王静波徐江李象远李象远
- 关键词:航空燃料热力学数据
- 专题序言
- 2024年
- 随着创新算力与新一代人工智能技术的发展,超算与人工智能的融合已成为驱动科技创新的关键力量,将长期为我国各行业转型升级和数字经济发展提供核心驱动力。近年来,中国超算通过国产先进计算架构、高性能多核处理器、高速互连网络、大规模存储等关键技术构建,在通用CPU计算能力、网络能力、存储能力以及应用服务能力等多方面实现倍增,用以支持高性能计算、AI大模型训练以及大数据分析各类应用模式。基于国产异构加速计算平台的计算资源,通过联合产业链上下游企业、高校、科研院所、重点用户单位等相关创新力量。
- 金钟
- 关键词:人工智能技术多核处理器高速互连