闫恒超
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
- 供职机构：华中农业大学生命科学技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 陆地棉开花后20d纤维抑制性消减文库的构建及分析
- 2012年
- 本研究以高比强度纤维材料0-153和转基因抗虫棉sGK9708为亲本构建的高代重组自交系群体(F6:9)中选育出的高比强度纤维品系(69307)作为材料,利用抑制性消减杂交技术,以15DPA纤维为driver、20DPA纤维为tester,成功构建出陆地棉开花后20d纤维的cDNA消减文库。通过蓝白斑筛选、菌落PCR及反向Northern技术最终筛选出差异表达的阳性克隆340个。通过对阳性克隆测序及序列分析,共得到115个单一序列,其中35个重叠群,80个单拷贝。利用Blast2GO等对差异表达基因进行生物信息学分析,结果表明这些差异表达基因广泛参与糖类、脂类、氨基酸等物质的代谢,以及纤维素生物合成、细胞壁合成与修饰、氧化还原、细胞信号转导等生物学过程。
- 王少干商海红计志斌闫恒超李俊文刘爱英石玉真龚举武巩万奎王涛袁有禄
- 关键词：棉花棉花纤维次生壁纤维强度抑制性消减杂交
- 棉花纤维次生壁加厚期基因的表达谱分析被引量：3
- 2011年
- 本研究以高纤维强度材料0-153和转基因抗虫棉sGK9708为亲本构建的高代重组自交系群体(F6:8)中纤维强度具有显著差异的两个系(高强材料69307和低强材料69362)作为材料,利用cDNA芯片技术,对纤维次生壁加厚阶段(15DPA和20DPA)的基因表达谱进行研究。共检测到差异表达基因3383个,占cDNA芯片基因序列的11.59%;并从中选择4个代表性基因利用荧光定量PCR进行验证,其表达模式与芯片数据一致,证明芯片结果可靠。通过次生壁加厚期标志基因的表达模式研究发现,两个材料纤维发育过程不同步,高强纤维材料比低强纤维材料晚进入次生壁加厚期。利用Blast2GO软件对差异表达基因进行富集分析表明,在15DPA到20DPA,寡糖或多糖等碳水化合物、类苯基丙烷和类黄酮合成等次生代谢、氧化还原、细胞信号转导等生物学过程中相关基因出现显著性富集。而且,这些差异表达基因在两个材料中的表达模式具有时间差异性。这种表达模式的差异可能是影响棉纤维强度性状的重要原因之一。本研究为棉纤维次生壁加厚相关基因的克隆奠定了基础,同时也为深入挖掘棉纤维品质性状重要基因,并将其用于棉纤维品质性状的改良奠定了基础。
- 计志斌商海红闫恒超王少干李俊文刘爱英石玉真龚举武巩万奎王涛袁有禄
- 关键词：棉花CDNA芯片表达谱纤维强度
- 棉花纤维发育伸长期和次生壁加厚期数字表达谱分析
- 棉花是重要经济作物，它不仅提供了世界上绝大部分天然纤维，而且是重要的食用油及蛋白质来源。棉纤维不仅具有重要的经济价值，也是理想的研究细胞伸长和纤维素合成途径的模式细胞。近年来通过大量的表达序列标签(EST)测序和基因芯片...
- 闫恒超
