丁少雄
- 作品数：125 被引量：734H指数：18
- 供职机构：厦门大学海洋与地球学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生天文地球更多>>
- 中国6种经济鱼类的基因组大小测定被引量：18
- 2010年
- 采用流式细胞术,以人(Homo sapiens)淋巴细胞DNA含量(7.00pg/2C)为标准,以鱼的红血细胞为材料,测定中国6种重要经济鱼类条纹斑竹鲨(Chiloscyllium plagiosum)、斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)、赤点石斑鱼(Epinephelus akaara)、大黄鱼(Pseudosciaena crocea)、中华乌塘鳢(Bostrichthys sinensis)、大菱鲆(Scophthalmus maximus)的基因组大小(C-值)。结果显示,这6种经济鱼类的单倍体DNA含量分别为:条纹斑竹鲨(4.91±0.24)pg;斜带石斑鱼(1.25±0.04)pg;赤点石斑鱼(1.23±0.11)pg;大黄鱼(0.76±0.03)pg;中华乌塘鳢(0.85±0.04)pg;大菱鲆(0.65±0.01)pg。研究结果可为这6种经济鱼类的种质鉴定提供依据。此外,根据本研究的实验结果并结合其他鱼类的基因组大小资料,对鱼类基因组大小与其染色体数目及进化地位之间的相关性进行了探讨,对比分析显示,鱼类进化地位越高则DNA含量越少,同时鱼类基因组的大小差异存在复杂性,并不完全与染色体数目相关。本研究还就鱼类基因组大小的测定方法等问题提出建议,认为应采用流式细胞术和人淋巴细胞作为规范的检测方法和对照标准。
- 高静黄晓红曾华嵩尤颖哲丁少雄
- 关键词：基因组大小经济鱼类流式细胞术
- 一种提升基因克隆效率的方法
- 一种提升基因克隆效率的方法，涉及一种基因克隆方法。于目标基因中间片段设计1对特异性引物；对RACE过程中不同来源的模板进行特异性PCR扩增；扩增产物经1.5%琼脂糖电泳分析，检测产物阳性条带存在与否及其亮度，从而确定RA...
- 施晓峰丁少雄王军苏永全
- 文献传递
- 大黄鱼IFNG基因的扩增引物及其设计方法
- 大黄鱼IFNG基因的扩增引物及其设计方法，涉及一对引物IF和IR。提供大黄鱼IFNG基因第一内含子SSR序列的扩增引物及其设计方法。扩增引物由两条单链寡聚核苷酸组成。登陆Genebank搜索硬骨鱼类IFNG基因的保守区，...
- 曾华嵩蒋秋芬丁少雄王军苏永全
- 闽粤沿海鮸状黄姑鱼野生种群和人工繁育群体遗传多样性的RAPD分析被引量：13
- 2003年
- 采用RAPD技术对鮸状黄姑鱼(Nibea miichthioides)野生种群及人工繁育群体进行了DNA多态性检测。共采用40个随机引物进行扩增,其中35个引物在野生种群和人工繁育群体中都扩增出230个RAPD位点。野生种群和人工繁育群体的多态位点比率P分别为16.5％和15.7％;群体相似系数S为0.954和0.967;Shannon信息指数H_0为0.113和0.104;基因多样性指数H为0.085和0.083;而两群体间的遗传距离D为0.022。所得结果表明两群体间具有非常相近的亲缘关系,且遗传多样性水平都比较贫乏。
- 丁少雄苏永全王军全成干
- 关键词：鮸状黄姑鱼野生种群RAPD分析
- 一种rpsL基因突变天蓝色链霉菌及其获得方法
- 本发明公开了一种rpsL基因突变天蓝色链霉菌及其获得方法，以天蓝色链霉菌Streptomyces coelicolorAS4.242为出发菌株，利用构建的CRISPR‑Cas9系统实现rpsL基因K88E和P91S两个位...
- 陈军金梦迪梁君雨刘昭远丁少雄
- 文献传递
- 赤点石斑鱼HSP60基因克隆及弧菌应激前后的组织表达特性分析被引量：6
- 2011年
- HSP60(heat shock protein 60,热休克蛋白60)作为高度保守的热休克蛋白家族的一员,不仅可以在应激状态下帮助其他蛋白正确折叠并恢复天然构象,还可作为危险信号作用于天然免疫系统。基于HSP60的EST序列设计特异引物,采用RACE技术成功克隆获得赤点石斑鱼HSP60 cDNA全序列及基因组全序列。其cDNA序列全长2 351 bp,包括75 bp的5′UTR,539 bp的3′UTR和1 737 bp的开放阅读框,共编码578个氨基酸。核苷酸及氨基酸序列比对结果显示该基因与其他脊椎动物的相似性很高。基于氨基酸序列构建的系统进化树与传统物种树基本吻合,说明HSP60可能是1个潜在的可用于物种系统进化研究的良好标记。所获得的赤点石斑鱼HSP60基因组全序列含有8个内含子和9个外显子,也与已知其他硬骨鱼类基本一致。这种在序列特征、蛋白空间结构及基因组结构上的高度保守性意味着HSP60在动物生命活动中可能发挥着至关重要的作用。通过实时PCR检测结果发现HSP60在赤点石斑鱼各组织中均有表达,而攻毒后鱼体肝的表达量显著增高(P<0.05),鳃、脾、胃和脑等重要组织器官的表达量也有不同程度的提高,该结果证实了HSP60基因在鱼类非特异性免疫应答中发挥了作用。
- 曲朦施晓峰张之文丁少雄
- 关键词：赤点石斑鱼HSP60克隆
- 第二节中国东南沿海斜带石斑鱼群体遗传结构的等位酶分析
- 斜带石斑鱼(Epinepheluscoioides)俗称青斑,广泛分布于太平洋和印度洋的热带亚热带海域,在我国的台湾及粤琼沿海均有分布,是我国南方传统的名贵海水鱼类.近年来,由于对其需求量的迅速增加,其野生资源量已开始逐...
- 丁少雄王军郭丰苏永全
- 关键词：斜带石斑鱼群体遗传结构等位酶人工养殖
- 文献传递
- 斜带髭鲷野生与养殖群体遗传结构的ISSR分析被引量：24
- 2007年
- 采用ISSR分子标记技术,对斜带髭鲷3个群体(柘林湾人工繁育群体、厦门湾人工繁育群体和厦门近海捕捞野生群体)的遗传多样性水平和群体遗传结构进行了研究.筛选出17个ISSR引物对3个群体共54个样品进行扩增,共得到145个清晰的扩增位点,其中多态性位点80个,多态位点百分率为55.17%.Popgene分析结果表明:厦门野生群体的遗传多样性水平最高(PPB=51.72%,h=0.182 6,I=0.271 9),略高于其他2个人工繁育群体的遗传多样性水平.群体间的Nei’s遗传分化系数和基因流分别为:0.087 6和5.209 8.表明斜带髭鲷3个群体的遗传分化尚未达到种群的分化水平.本文通过对斜带髭鲷野生群体及人工繁育群体遗传结构和遗传多样性水平的研究,为其种质资源的科学管理提供理论依据.
- 王世锋杜佳莹苏永全丁少雄王军
- 关键词：斜带髭鲷ISSR群体遗传结构
- 大黄鱼异精雌核发育的研究
- 大黄鱼(Pseudosciaena crocea(Richardon))和浅色黄姑鱼(Nibea Chui,Trewavas)同属
- 王德祥丁少雄王世锋苏永全王军
- 关键词：异精雌核发育浅色黄姑鱼大黄鱼雌核发育二倍体
- 文献传递
- 中国近海8种石首鱼类的线粒体16S rRNA基因序列变异及其分子系统进化被引量：14
- 2004年
- 通过PCR扩增出中国近海石首鱼科(Sciaenidae)6属8个代表种的线粒体16S rRNA基因,纯化后直接测序.利用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析,计算Kimura 2-parameter遗传距离、平均核苷酸变异数、平均每位点核苷酸替代数等遗传信息指数,并结合GenBank上大斑石鲈(Pomadasys maculates)同源序列构建UPGMA,NJ,ME和MP系统树.结果表明,叫姑鱼(Johnius belengerii)为最早分化的一枝,其次为黄姑鱼(Nibea albiflora)和白姑鱼(Argyrosomus ar-gentatus),而黄鱼亚科(包括大黄鱼(Pseudosciaena crocea)、小黄鱼(Pseudosciaena polyactis)、棘头梅童鱼(Collichthys lucids)、黑鳃梅童鱼(Collichthys niveatus)和鲵鱼(Miichthys miiuy))分化最晚,这支持了形态学得出的结论.在分子水平上明确了叫姑鱼亚科和黄鱼亚科的系统进化地位,并得出黄姑鱼比白姑鱼更早分化的新推论,但对于形态学上将白姑鱼和黄姑鱼归属于同一个亚科的结论还有待使用多个不同进化速率的基因加以分析考证.为探讨中国石首鱼类分子系统进化做了尝试,并就线粒体16S rRNA基因在该科鱼类系统进化研究的应用潜力进行了剖析.
- 蒙子宁庄志猛丁少雄金显仕苏永全唐启升
- 关键词：线粒体RRNA基因序列分子系统
