余乐正
- 作品数：14 被引量：34H指数：4
- 供职机构：四川大学化学工程学院更多>>
- 发文基金：贵州省科学技术基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学生物学医药卫生文化科学更多>>
- 基于伪氨基酸及支持向量机的分泌蛋白预测
- 分泌蛋白在细胞信号传导方面发挥着重要作用,故分泌蛋白的识别对于疾病诊断与治疗以及药物研发具有重要意义。相对于大量的经典分泌蛋白,只有少量蛋白质是通过非经典分泌途径分泌到细胞外的。因此,我们很难用计算方法来预测这些非经典分...
- 余乐正郭延芝李梦龙熊文佳
- 关键词：分泌蛋白支持向量机
- 文献传递
- 不同类型的革兰氏阴性菌分泌系统蛋白分类研究被引量：1
- 2015年
- 革兰氏阴性菌细胞中至少存在八种分泌系统,而每种分泌系统分别由一系列具有特定结构与功能的蛋白质组成。因此,对不同类型的细菌分泌系统蛋白进行深入研究,不仅有助于理解对应的蛋白质分泌机制,对于疾病的诊断与治疗及新药研发也具有重要意义。以氨基酸组成和位置特异性得分矩阵为替代模型,本文构建了一个基于支持向量机构的多元分类器以快速区分不同类型的革兰氏阴性菌分泌系统蛋白。实验结果表明,本方法对I、II及V型分泌系统蛋白具有较好的预测性能。
- 余乐正陈曼赵柳青罗杰斯柳凤娟
- 关键词：革兰氏阴性菌支持向量机
- 一种快速准确区分Ⅲ型、Ⅳ型分泌效应蛋白的计算方法被引量：1
- 2020年
- 通过Ⅲ型、Ⅳ型、Ⅵ型分泌系统,革兰氏阴性菌可将效应蛋白直接注入宿主体内,并导致宿主感染各种疾病.由于Ⅲ型、Ⅳ型分泌效应蛋白均属非经典分泌蛋白,且它们可能具有相似的序列模体或进化保守性,故两者之间难于区分.基于支持向量机和伪位置特异性得分矩阵,本文提出了一种可快速准确识别革兰氏阴性菌Ⅲ型、Ⅳ型效应蛋白的计算方法.测试集实验结果表明,本方法对Ⅲ型、Ⅳ型效应蛋白具有较好的分类效果,可作为辅助工具用于分泌效应蛋白的进一步研究.
- 柳凤娟杨庆陈倩余乐正余乐正
- 关键词：革兰氏阴性菌支持向量机
- 双道原子荧光光度计测定水样中锑含量被引量：1
- 2016年
- 利用双道原子荧光光度计AFS-2202E检测水样中锑含量,并探讨影响检测效果的各种因素。研究结果表明,锑含量不高于80μg/L时线性关系较好,相关系数可达0.9999,检出限为0.034μg/L,加标回收率为95.2%~99.2%。实验中还发现,设置稳定可靠的仪器条件、采用清洁的试验器具以及试剂现配现用是获得稳定最优检测效果的必要条件。此外,在实验中还应注重维护反应装置,以获得稳定一致的检测结果。
- 柳凤娟余乐正
- 关键词：原子荧光光度计水样
- 革兰阴性菌分泌系统及其分泌产物研究进展被引量：9
- 2017年
- 蛋白质分泌在细菌生命活动中发挥着重要作用。通过各种各样的分泌系统,革兰阴性菌可分泌出大量蛋白质,以协调细菌与周围环境及其他细菌间的相互作用。由于细菌毒力的发挥离不开这些蛋白质,故它们在疾病发病机理及抗菌药物开发等研究中扮演着重要角色。论文围绕不同类型的革兰阴性菌分泌系统及其分泌产物的结构、功能等进行综述,旨在为革兰阴性菌致病机理研究和相关病害防控提供参考。
- 余乐正柳凤娟鄢南南程旭李益洲郭延芝
- 关键词：革兰阴性菌分泌系统分泌蛋白
- 利用蛋白质序列信息预测蛋白质相互作用
- ＜正＞蛋白质相互作用（protein-protein interaction,PPI）几乎参与了所有的生命活动过程,它是细胞进行一切代谢活动的基础。利用蛋白质相互作用信息预测蛋白质的功能及相关特性是蛋白质相互作用研究的一...
- 郭延芝余乐正李梦龙
- 文献传递
- 基于SVM的革兰氏阴性菌分泌系统蛋白识别方法被引量：2
- 2016年
- 本文提出了一种基于SVM快速识别革兰氏阴性菌分泌系统蛋白的方法.该方法以氨基酸组成和位置特异性得分矩阵为最优特征集,充分考虑了蛋白质的序列信息及进化信息.实验结果表明,本文提出的方法对革兰氏阴性菌分泌系统蛋白具有较好的预测性能,可作为细菌分泌系统研究的有益补充.
- 余乐正赵柳青陈曼罗杰斯柳凤娟
- 关键词：革兰氏阴性细菌SVM
- 高校分析化学课程教学改革初探被引量：7
- 2014年
- 分析化学是本科化学专业的一门重要基础课程。本文针对分析化学教学过程中存在的各种问题,结合分析化学课程的特点及社会对人才的需求,从教学内容和教学方法两方面对分析化学教学改革进行了探索,并取得了较好的教学效果。
- 余乐正柳凤娟张进
- 关键词：分析化学课程教学
- 基于蛋白质序列信息的信号肽上有害非同义单核苷酸多态性的预测
- 信号肽通常位于前体蛋白的N端,在细胞表面受体蛋白的定位,分泌蛋白的迁移和细胞与细胞间的交流等各种各样的生物学过程中发挥着重要作用。信号肽上单个氨基酸的突变可能引起其功能的丧失,进而导致一些相关疾病的发生。因此,正确识别有...
- 秦文丽李益洲李娟余乐正郭延芝李梦龙
- 关键词：信号肽
- 基于三元分类的分泌蛋白预测
- 2009年
- 近年来，分泌蛋白常被作为疾病诊断及药物研发等方面的靶标蛋白，故分泌蛋白的识别及其功能的预测对于相关工作的研究具有重要意义。单纯地用实验方法来检测分泌蛋白，不仅需要大量的时间，也会花费大量的资金。因此，构建一种快捷可靠的计算方法来预测分泌蛋白就变得十分迫切。相对于大量的非经典分泌蛋白和非分泌蛋白，只有少量的蛋白质是通过非经典分泌方式分泌到细胞外的。
- 余乐正郭延芝张政李梦龙
- 关键词：分泌蛋白疾病
