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崔玉军
作品数:
26
被引量:107
H指数:7
供职机构:
军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室
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发文基金:
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合作作者
杨瑞馥
深圳华大基因研究院
李艳君
军事医学科学院微生物流行病研究...
周冬生
军事医学科学院微生物流行病研究...
许磊
中国科学院动物研究所
刘起勇
中国疾病预防控制中心传染病预防...
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作者
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2012
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2011
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2008
2篇
2005
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中国鼠疫自然疫源地分型研究 Ⅷ.鼠疫自然疫源地分型生物学研究基础理念
被引量:4
2013年
鼠疫是典型的自然疫源性人畜共患病。鼠疫自然疫源地的划分是认识和防制鼠疫的基础性工作。鼠疫生物地理群落(鼠疫自然疫源地)由生态地理景观型、宿主、媒介、鼠疫菌基因组型四要素组成,并在长期进化过程中存在复杂的相互关系。人类活动是影响鼠疫自然疫源地的重要因素。本文基于先前发表的系列论文,整合对鼠疫自然疫源地各要素的研究成果,集中论述鼠疫自然疫源地划分和认识中的若干重要理念,为鼠疫和其他人畜共患病的防疫和监控提供理论创新。
方喜业
刘起勇
许磊
周冬生
崔玉军
董兴齐
张荣祖
谷少华
叶财德
杨瑞馥
关键词:
鼠疫自然疫源地
中国鼠疫自然疫源地分型研究Ⅲ.鼠疫耶尔森菌DFR/MLVA主要基因组型生物学特征
被引量:8
2012年
鼠疫菌基因组型与鼠疫生态地理景观型及其主要宿主、媒介密切相关,自然组合形成鼠疫生物群落,互相依赖,互相制约,相互适应,同步进化,维持鼠疫自然疫源性和生物群落的延续。鼠疫菌差异区段/多位点串联重复序列(DFR/MLVA)基因组型反映了鼠疫自然疫源地生物学特征。其型别对认识鼠疫菌自然疫源地生物学具有重要意义。通过对鼠疫菌基因组型的鉴定,可实现对鼠疫菌的追踪溯源,追溯出所代表的鼠疫主要宿主、主要媒介及其生态地理景观型的生物学特征。因此,鉴定鼠疫菌基因组型、主要基因组型对中国鼠疫预防控制、应急反恐、生物安全、监测预报及软件技术平台体系建设具有实践和理论指导意义。
方喜业
周冬生
崔玉军
李艳君
刘起勇
许磊
杨瑞馥
关键词:
鼠疫耶尔森菌
基于Illumina高通量测序技术的微生物进化分析策略
崔玉军
聚集性出血性大肠杆菌:2011年德国疫情大暴发之元凶
被引量:7
2011年
2011年5月,肠出血性大肠杆菌疫情在德国北部开始暴发,很快席卷整个德国和欧洲部分国家,并蔓延至美国和加拿大。到6月初为止,感染人数已超过2600例,其中1/3以上患者发展为溶血性尿毒综合症(haemolytic uraemic syndrome,HUS),26例死亡。该场疫情已经发展为有记录以来世界规模第3的大肠杆菌大流行。
崔玉军
覃俊杰
宋亚军
赵向娜
杨瑞馥
关键词:
肠出血性大肠杆菌
疫情
聚集性
开源基因组学:对抗新发和突发传染病的新策略
被引量:3
2012年
一、基因组学的发展及其在新发传染病中的应用随着20世纪70年代Sanger双脱氧链终止核酸测序方法的发明,DNA自动测序技术进入到生命科学领域,并成为不可或缺的技术之一,为生命科学的发展做出了突出贡献。进入21世纪以来,
杨瑞馥
崔玉军
栗东芳
关键词:
基因组学
突发传染病
新发传染病
测序方法
测序技术
基因组流行病学及其在细菌性传染病研究中的应用
传染病暴发时,病原菌的传播扩散与其基因组的变异在同一个时间框架内发生并相互作用;因此,可根据病原分离株的基因组变异及其系统发育关系重建结果,推测病原菌在不同宿主之间的传播和扩散过程。将基因组学和流行病学的理论、技术结合起...
崔玉军
杨瑞馥
关键词:
基因组
病原
测序
开源基因组学:对抗新发和突发传染病的新策略
下一代高通量测序技术的发展为低成本地获得大量基因组信息奠定了基础。面对新发和突发传染病的威胁,我们发展了一种对抗新发和突发传染病的开源基因组学新策略,即通过因特网实现新发或突发疫情病原基因组信息和分析结果的实时共享,以高...
杨瑞馥
崔玉军
栗东芳
细菌基因组同源重组:量化与鉴定
被引量:2
2016年
同源重组(Homologous recombination)是塑造细菌群体多样性的重要原因之一。遗传物质通过同源重组在细菌不同种系间进行水平转移,打乱了克隆繁殖形成的竖向系统发育结构,从而为系统发育重建和种群结构判定带来困难。本文讨论了同源重组对系统发育分析和进化研究的影响,从实际应用的角度对量化重组程度和鉴定重组事件的常用软件及方法进行了综述,归纳了各软件工具和模型方法的优缺点,旨在对细菌重组分析和种群进化研究有所借鉴。
杨献伟
杨瑞馥
崔玉军
关键词:
同源重组
克隆
基因组
系统发育
种群结构
大肠埃希菌的群体基因组学研究
被引量:1
2016年
将群体遗传学的理论与方法应用于特定种群多个分离株的全基因组序列中,进行数据挖掘和分析的学科称为群体基因组学(population genomics)。近年来,测序技术的迅猛发展使得低成本、快速获得大量个体全基因组序列成为可能,这推动了群体基因组学在进化领域的广泛应用。本文以经典模式生物大肠埃希菌为例,回顾了大肠埃希菌A、B1、B2、D和E五个基因型之间进化关系的确立历程;总结了基因组突变率、选择信号以及适应性进化模式的分析实例;并对群体基因组学在应对O157:H7和O104:H4菌株所致疫情暴发中的应用进行了综述。这些研究结果说明,尽管发展时间较短,群体基因组学在解析细菌种群结构、探索进化规律以及疾病暴发应对等领域已经发挥了重要作用;加强该学科研究对大肠埃希菌以及其他病原细菌的进化与防控研究工作均有积极意义。
武雅蓉
杨瑞馥
崔玉军
关键词:
大肠杆菌
基因组
种群结构
美军化生防御战场管理现状
2005年
化生防御领域战场管理已经成为美军战场指挥管理的重要组成部分,在应对化生恐怖袭击行动的指挥决策中也起到重要作用。本文介绍了美军化生防御领域战场管理的理念、内容和相关的科研项目,并简要分析了其演变和发展趋势。
崔玉军
马静
田青
关键词:
化生防御
战场管理
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