李先平
- 作品数:12 被引量:35H指数:4
- 供职机构:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项国家自然科学基金中国中医科学院自主选题项目更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学文化科学更多>>
- 利用GoPubMed对CRISPR相关文献的计量学分析被引量:8
- 2014年
- 为了解CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)相关研究现状,笔者采用GoPubMed数据库的在线分析软件,对CRISPR相关文献进行计量分析.共检索到文献758篇.CRISPR相关研究文献呈逐年上升趋势,其中美国在CRISPR的文献数量和影响力均居首位,中国以北京地区发表文献最多(30篇).PLoS One刊登相关文献47篇,占发表总量的6.20%,居首位.CRISPR研究主题词涉及基因、基因组学、免疫等.高产作者为Horvath,共发表CRISPR相关文章11篇.利用GoPubMed可较好反映CRISPR研究的现状和发展趋势.中国CRISPR研究文献在整体质量和数量上均有待进一步提高.
- 边富宁李文革李先平卢金星
- 关键词:文献计量分析GOPUBMEDCRISPR
- 亚MIC剂量的甲硝唑和万古霉素对中国株A^-B^+艰难梭菌毒力转录和表达的影响(英文)被引量:2
- 2014年
- 目的艰难梭菌是医院获得性感染性腹泻的主要原因。有些抗生素能够诱导和促进艰难梭菌相关性腹泻(CDAD)。本研究探讨治疗CDAD的一线药物甲硝唑和万古霉素的亚最小抑菌浓度(MIC)剂量对中国艰难梭菌A-B+高分离株BJ08生长、毒力基因转录和毒素分泌的影响。方法 BJ08菌株分别生长在含有1/4MIC的甲硝唑或万古霉素以及无抗生素的BHI液体培养基中。每4h通过检测其OD值以确定其生长曲线;通过实时荧光定量PCR检测其毒力基因的表达;通过ELISA检测上清和细胞内B毒素的表达。结果实验发现BJ08在1/4MIC剂量的甲硝唑和万古霉素存在的情况为,到达指数生长期的时间延迟;毒力基因及其毒素的表达增高且提前;但甲硝唑和万古霉素对其影响的程度不同。结论实验证明中国株A-B+在亚MIC剂量抗生素存在的情况下,其生长延迟,毒力基因和毒素表达提前且升高。本实验为临床规范治疗CDAD与合理用药提供一定的参考价值。
- 李先平高洪元李文革王晶卢金星
- 关键词:艰难梭菌甲硝唑万古霉素
- 艰难梭菌引起抗感染免疫的主要致病因子及其基因功能的研究进展被引量:4
- 2013年
- 艰难梭菌是医院感染性腹泻中最常见的病原菌之一,在过去10年中,由于ribotyping 027型等高毒菌株的出现,全球艰难梭菌感染相关性疾病发病率显著上升,已经成为欧美许多国家法定传染病必报的监测病原。致病艰难梭菌的毒力因子主要包括A毒素和B毒素,刺激机体发生免疫应答。除外A、B毒素,少数艰难梭菌还产生二元毒素。本文对近年来艰难梭菌引起机体抗感染免疫的相关致病因子及其基因功能的最新研究进展进行了回顾和总结,并重点探讨了主要致病因子A毒素和B毒素结构功能及基因表达调控特征,包括构建A、B毒素分子模型,致病基因编码区多态性特征,以及负向调控因子tcdC的变异及影响,对未来疫苗靶位点的筛选以及艰难梭菌致病机制中信号转导研究具有指导意义。
- 曹波李先平程颖
- 关键词:艰难梭菌抗感染免疫
- 中国艰难梭菌高分离株和欧洲流行高毒株tcdA、tcdB基因转录及其毒素的表达(英文)
- 2014年
- 目的研究和比较中国艰难梭菌A-B+高分离株BJ08和欧洲流行A+B+高毒株(BI/NAP1/027)UK1的tcdA、tcdB转录和毒素表达。方法每隔3h提取艰难梭菌和培养上清,用实时荧光定量PCR的方法测定各个时间段BJ08和UK1菌株tcdA、tcdB基因的表达;用ELISA的方法检测BJ08和UK1菌株各个时间段的细胞和培养上清液中A毒素、B毒素的含量。结果 BJ08的生长速率显著大于UK1;BJ08不表达A毒素,但是检测到tcdA基因的转录,tcdA基因表达量显著低于UK1;tcdB的表达以及B毒素在两种菌株的培养上清液中和声波处理的细胞内的差异都不大。结论中国艰难梭菌A-B+高分离株BJ08和欧洲流行A+B+高毒株UK1的B毒素的转录和表达没有明显差异,BJ08菌株在中国有爆发流行的可能。
- 李先平李文革王晶卢金星
- 关键词:艰难梭菌
- 水苏糖对艰难梭菌在小鼠肠道内定植与菌群的影响被引量:4
- 2020年
- 目的利用艰难梭菌感染(CDI)小鼠模型,评价水苏糖是否具有抑制小鼠肠道内艰难梭菌定植的作用,并分析其对肠道菌群结构的影响。方法将C57BL/6雌鼠随机分为3组,其中不做任何处理的设定为空白对照组,水苏糖干预组和磷酸盐缓冲液(PBS)模型组在建立CDI小鼠模型后分别连续10 d每日给予水苏糖和PBS灌胃处理。利用荧光定量聚合酶链式反应(PCR)检测感染后第10 d各组小鼠粪便中艰难梭菌的含量,并利用16S rRNA基因测序分析各组小鼠肠道菌群结构的变化。结果水苏糖干预导致CDI小鼠粪便中艰难梭菌含量显著降低。水苏糖干预组小鼠粪便的菌群丰富度显著高于PBS模型组,但没有恢复到空白对照组的水平。在门水平上,水苏糖干预可导致CDI小鼠粪便的拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)的相对丰富度显著增高,变形菌门(Proteobacteria)的相对丰富度显著降低。在种水平上,水苏糖干预导致CDI小鼠粪便中格氏副拟杆菌(Parabacteroides goldsteinii)、汉森氏布氏菌(Blautia hansenii)、多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)的相对丰度显著增高;Parasutterella excrementihominis、狄氏副拟杆菌(Parabacteroides distasonis)的相对丰度显著降低。结论水苏糖干预可有效降低CDI小鼠肠道内艰难梭菌定植量,增加CDI小鼠肠道微生物丰富度,特异性地改变多形拟杆菌和格氏副拟杆菌等菌种的相对丰度。
- 康颖李先平宋利琼肖玉春黄元铭任志鸿
- 关键词:艰难梭菌感染水苏糖荧光定量聚合酶链式反应
- 耐万古霉素肠球菌小鼠感染模型的优化被引量:1
- 2018年
- 目的优化小鼠经口感染耐万古霉素肠球菌(VRE)肠道定植模型,明确不同抗生素预处理方式和感染剂量对VRE在肠道定植的影响。方法 C57/6J小鼠随机分为3组,分别为混合抗生素、氨苄西林、万古霉素预处理组。混合抗生素预处理组:感染前第7天给予小鼠混合抗生素(卡那霉素、庆大霉素、粘菌素、甲硝唑、万古霉素)水溶液;感染前第2天,将混合抗生素水溶液换为万古霉素水溶液,感染前1 d,腹腔注射克林霉素。氨苄西林与克林霉素预处理组:感染前第7天给予氨苄西林水溶液,感染前1 d,腹腔注射克林霉素。万古霉素预处理组:感染前第7天给予万古霉素水溶液。第0天,3组小鼠同时进行VRE灌胃处理。感染后第3天,氨苄西林、万古霉素水溶液改换为正常饮用水,直至实验结束。在感染后2周内对收取的小鼠粪便活菌计数,观察VRE定植量的变化。结果感染后第1天,VRE在3种抗生素预处理的小鼠肠道中均能成功定植。在感染后1~9 d,3种模型的粪便VRE含量在105~108 cfu/mg。感染后第9天,3组小鼠粪便中VRE定植量出现下降趋势,第15天(实验结束)粪便VRE含量降至103~105 cfu/mg。另外,感染后第10天氨苄西林处理组中有2只小鼠死亡。对万古霉素预处理模型给予的2个不同感染剂量,在整个急性感染期两组VRE定植量差异无统计学意义。结论万古霉素预处理的VRE肠道定植模型的稳定性和简洁性优于混合抗生素或氨苄西林预处理的模型。在万古霉素预处理模型中,VRE可在肠道定植至少15 d,且感染剂量在105~107 cfu/只间不影响VRE的肠道定植模型的建立。
- 朱思逸李先平宋利琼肖玉春黄元铭储琼芳任志鸿
- 关键词:耐万古霉素肠球菌抗生素小鼠模型定植
- TaqMan实时荧光定量PCR检测艰难梭菌被引量:3
- 2018年
- 目的建立特异敏感的实时荧光定量PCR方法,用于艰难梭菌的快速检测;评价基于纯培养艰难梭菌和粪便中艰难梭菌的2种标准曲线;并应用该荧光定量PCR法对急性艰难梭菌感染(CDI)的小鼠进行粪便含菌量检测评价。方法针对艰难梭菌基因组中16S r RNA序列设计特异性引物和探针,建立一套快速检测艰难梭菌含量的实时荧光定量PCR方法,验证方法的特异性、灵敏性;绘制艰难梭菌纯菌浓度梯度稀释标准曲线和粪便中同浓度梯度艰难梭菌的标准曲线,比较两者的差异;用艰难梭菌高毒株NAP1/027感染用抗生素处理的C57BL/6小鼠,建立CDI小鼠模型,同时应用该荧光定量PCR和活菌培养法定量检测小鼠粪便中的艰难梭菌含量变化。结果建立的Taq Man实时荧光定量PCR具有较高的灵敏性和特异性,生成标准曲线的相关系数为0.999 8,斜率为-3.400 4;用纯培养艰难梭菌和粪便中艰难梭菌分别制备标准曲线,结果表明2种标准曲线定量检测结果差异无统计学意义。建立CDI小鼠模型,应用该荧光PCR能有效、准确的检测出粪便中艰难梭菌的含量,可替代费时费力的活菌培养计数法。结论用纯培养艰难梭菌来制备标准曲线不影响对含菌粪便标本的准确定量检测,荧光定量PCR能准确快捷地检测CDI小鼠粪便中的艰难梭菌含量,比活菌计数更快速和方便,可用于艰难梭菌感染小鼠模型中小鼠肠道内艰难梭菌定植的定量检测。
- 储琼芳李先平华玉婷宋丽琼肖玉春黄元铭朱思逸任志鸿
- 关键词:实时荧光定量PCR艰难梭菌感染小鼠模型
- 亚MIC剂量的抗生素对艰难梭菌tcdC、tcdE、tcdR转录的影响
- 2014年
- 目的亚最小抑菌浓度(MIC)剂量的某些抗生素能够诱导和促进艰难梭菌毒力编码基因及其毒素的表达,但具体机制不明。本文从艰难梭菌的毒力调控基因(tcdC、tcdE、tcdR)着手来试图解释亚MIC剂量的抗生素对艰难梭菌毒力编码基因和毒素的影响。方法中国株艰难梭菌BJ08分别生长在含有1/2 MIC剂量的克雷霉素或头孢噻肟或无抗生素的脑心浸液肉汤(BHI)液体培养基中。每4h,取一定量的艰难梭菌,通过实时荧光定量PCR检测其毒力调控基因(tcdC、tcdE、tcdR)mRNA的表达。结果 BJ08在1/2 MIC剂量的克雷霉素存在的情况下,对毒力调控基因mRNA表达的影响不大;但是在1/2 MIC剂量的头孢噻肟存在的情况下,tcdCmRNA的表达在培养早期和中期低于对照组,tcdE和tcdR的表达比起对照组都增高且提前,但两者增加幅度不同,高峰期也不同。结论在某些亚MIC剂量的抗生素存在的情况下,艰难梭菌毒力编码基因和毒素表达的变化可能是通过调节调控基因而实现的。
- 李先平高洪元李文革边富宁卢金星
- 关键词:艰难梭菌头孢噻肟TCDC
- 甲型H1N1流感病毒感染对小鼠肺损伤及肠道菌群的影响被引量:6
- 2021年
- 目的观察甲型H1N1流感病毒感染小鼠的一般状态、病毒载量、肺肠组织病理及肠道菌群的动态变化。方法用流感病毒A/PR/8(H1N1)滴鼻感染C57BL/6J小鼠,留取感染后第3、7天肺和结肠组织以及感染第0、3、7天粪便,记算肺指数,测量结肠长度、重量,采用实时荧光定量PCR法检测肺组织病毒载量,HE染色观察肺、结肠病理,16S rRNA法检测粪便菌群。结果感染组较空白组小鼠体重减轻,活动减少,第3天肺组织病毒载量显著升高,肺指数升高,肺病理出现损伤,结肠长度缩短,结肠病理未见明显损伤;第7天肺病毒载量有所下降,肺指数显著升高,肺组织病理损伤严重,结肠长度进一步缩短,结肠病理未见显著炎症。感染后第3天粪便菌群乳酸菌丰度下降,第7天乳酸菌属丰度显著下降,志贺菌、肠球菌属显著升高。结论甲型流感病毒感染导致小鼠进食量减少、体重降低、肺组织病毒载量升高、肺组织病理损伤,同时引起结肠长度缩短,肠道菌群失调。
- 刘国星黄元铭程淼刘畅王明哲宋利琼李先平于会勇翟志光翟志光肖玉春任志鸿任志鸿
- 关键词:甲型H1N1流感病毒肺损伤肠道菌群
- 中美艰难梭菌A-B+株毒力编码区域转录及B毒素表达的研究被引量:4
- 2014年
- 目的研究中国艰难梭菌A-B+型分离株BJ08和美国艰难梭菌A-B+型暴发流行株US1的毒力编码区域PaLoc各基因转录及B毒素的表达,为预防和控制中国可能暴发的艰难梭菌感染提供理论支持。方法每隔3 h提取BJ08与US1艰难梭菌和培养上清,用荧光定量聚合酶链反应(PCR)法测定各时间段两菌株毒力编码区域PaLoc各基因(tcdA、tcdB、tcdC、tcdR、tcdE)的表达;用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测BJ08和US1各时间段的细胞和培养液上清中B毒素的含量。结果 US1的生长速率稍快于BJ08,衰退速率显著快于BJ08(P<0.05);它们都不表达A毒素,但是都检测到tcdA基因的转录,而且tcdA转录没有明显差异。BJ08的tcdB、tcdC和tcdE基因的转录要比US1早3 h。B毒素在两种菌株的胞内和胞外合成或分泌没有明显差异。结论中国艰难梭菌A-B+型高分离株BJ08与美国艰难梭菌A-B+型暴发流行株US1相比,有相似的毒力表达或更强的基因调控能力,要警惕中国艰难梭菌BJ08暴发流行的可能。
- 李先平李文革王晶卢金星
- 关键词:艰难梭菌抗生素相关腹泻假膜性肠炎