陈漪
- 作品数:6 被引量:10H指数:2
- 供职机构:上海交通大学医学院附属瑞金医院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金山东省科技发展计划项目更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 甲状腺转录因子-1真核表达载体的构建和表达
- 2008年
- 甲状腺转录因子-1(thyriod transcription factor1。TTF1),也称为甲状腺特异增强子结合蛋白/NKX2.1,(T/EBP/NKX2.1)。1995年。Ikeda等克隆得到人的TTF1基因,基因全长约3.3Kb,含2个外显子,位于染色体14q13。该基因编码38KDa的核蛋白。表达于胚胎期和发育成熟的甲状腺、肺上皮细胞中。TTF-1在细胞中具有DNA结合和转录激活功能,调控着多种甲状腺特异基因和肺部特异基因的转录。在甲状腺、肺部支气管和中枢神经系统的发育成熟过程中起着非常重要的作用。本研究旨在构建TTF1真核表达载体并观察其在体外表达情况,从而为进一步利用TTF1体外翻译蛋白研究它与DNA反应元件及其它转录因子的相互作用奠定了基础。
- 程烽盛燕潘春明陈漪宋怀东
- 关键词:甲状腺转录因子-1真核表达载体增强子结合蛋白肺上皮细胞DNA结合特异基因
- TSH受体基因SNP与Graves病、桥本甲状腺炎和结节性甲状腺肿之间的相关性研究被引量:6
- 2004年
- 目的 探讨TSH受体基因单核苷酸多态性 (SNP)与甲状腺疾病〔包括Graves病 (GD) ,结节性甲状腺肿 ,桥本甲状腺炎 (HT)〕有无相关性。方法 以 60例有甲状腺疾病家族史患者 (其中 3 0例GD、10例HT、2 0例结节性甲状腺肿患者 ) ,48例散发Graves病患者及 96名健康对照者作为研究对象 ,采用外周血白细胞抽提DNA ,设计引物 ,PCR扩增 ,对扩增产物纯化后测序。结果患者中共发现 8个多态位点 ,其中第8外显子上的多态位点 (E8A + 40C)在SNP库中未见报道 ,为首次发现 ;将这些多态位点基因型变化与正常组比较 ,无明显统计学差异。结论 本研究提示汉族人TSH受体基因与这几种甲状腺疾病无相关性 ;该基因的多态位点在不同的人种间存在明显差异。
- 梁军赵家军高聆钟霞张丽章国卫盛燕阮铮陈漪宋怀东陈家伦
- 关键词:TSH受体结节性甲状腺肿GRAVES病桥本甲状腺炎人种
- 重叠延伸PCR法构建UGRP1基因启动子的点突变表达载体被引量:1
- 2007年
- 背景与目的:构建UGRP1基因启动子的定点突变表达载体。材料与方法:以插入UGRP1基因正常启动子的质粒pGL3-UGRP1(-112G)为模板,用重叠延伸PCR定点诱变技术,对-112位点的碱基进行定点突变,并构建定点突变表达载体。结果:DNA测序表明,UGRP1基因启动子-112处的碱基已由G突变为A,成功实现定点诱变。结论:重叠延伸PCR定点诱变技术高效、简便。pGL3-UGRP(-112A)的成功构建,为进一步研究-112G/A多态性对该基因转录活性的影响奠定了基础。
- 程烽盛燕施静艺陈漪徐潮刘智梁军潘春明朱忠勇宋怀东
- 关键词:启动子重叠延伸PCR定点诱变
- 基于高通量测序数据构建斑马鱼隐性遗传突变筛选系统
- 2016年
- 目的:针对斑马鱼高通量测序数据,通过一系列质量控制和突变过滤,构建一套有效隐性遗传突变筛选系统。方法:A)经过与斑马鱼参考基因组比对,利用GATK获得初始的VCF格式突变信息。B)使用perl语言编写本地脚本,对突变信息进行过滤,注释等。C)通过绘制纯合突变点分布图,找出突变富集区域。整合以上步骤,构建出一套针对斑马鱼高通量测序数据的遗传性突变筛选系统。结果:对获得的突变位点进行了一系列的质量控制,定位到具体染色体上的特定区域,并且对获得的突变进行了功能上的注释。结论:本过滤筛选系统能有效控制检测的假阳性率,对斑马鱼致病性的隐性突变位点筛查提供有力参考。
- 张自冠施静艺陈漪孔杰陈赛娟黄金艳
- 甲状腺转录因子-1融合表达载体的构建及体外活性鉴定
- 2007年
- 目的:构建人甲状腺转录因子-1(TTF1)编码基因的真核表达载体pcDNA3.1/myc-His(-)C-TTF1,并观察其蛋白质体外转录翻译情况。方法:据已知的TTF1基因序列,应用巢式PCR技术,从人肺腺癌细胞株SPC-A1中扩增出TTF1基因,通过TA连接将其克隆入pGEM-T-easy载体,经测序鉴定后,双酶切插入真核表达质粒pcDNA3.1/myc-His(-)C中;重组质粒经XhoⅠ和BamHⅠ双酶切鉴定后,进行蛋白质体外翻译观察TTF1体外表达情况,用电泳迁移率变动分析(EMSA)验证获得的体外翻译蛋白TTF1是否具有与下游靶基因UGRP1启动子结合的能力。结果:成功构建了含TTF1编码基因的真核表达载体pcDNA3.1/myc-His(-)C-TTF1,并能在体外表达TTF1蛋白。结论:能方便地获得TTF1体外翻译蛋白,为进一步研究TTF1蛋白与相应的DNA反应元件及其他转录因子的相互作用奠定了基础。
- 程烽盛燕潘春明陈漪施静艺刘智白雪涛宋怀东
- 关键词:甲状腺转录因子-1真核表达
- 一先天性秃发家系HR和CDSN基因突变的筛查被引量:3
- 2005年
- 目的:对山东省一5代30人的先天性秃发家系进行HR、CDSN基因的突变筛查,以期寻找致病基因。方法:收集家系成员的临床资料及血液样本,抽提外周血基因组DNA,进行PCR扩增,采用虾碱性磷酸酶及核酸外切酶对扩增产物进行纯化,然后用ABIPRISM3700自动测序仪进行测序,最后用Autoassembler软件与基因组序列对比,查找有无突变。结果:未发现突变,但找到12个多态位点,其中11个是首次发现。结论:HR、CDSN基因可能与本先天性秃发家系无关。
- 刘晨帆宋亚丽宋怀东陈漪盛燕潘春明张莉
- 关键词:先天性秃发突变基因突变家系成员HR基因组DNA