顾孝诚 作品数:31 被引量:114 H指数:7 供职机构: 北京大学生命科学学院蛋白质工程及植物基因工程国家重点实验室 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 国家自然科学基金 北京市科委基金 更多>> 相关领域: 生物学 自动化与计算机技术 医药卫生 农业科学 更多>>
生物信息资源的应用与二次开发 被引量:13 1999年 概述了利用计算机及分子生物学信息资源进行文献检索、序列分析、蛋白质分子结构模建、药物设计等工作的方法。 黄弋 罗静初 罗静初关键词:信息资源 分子生物学 基因组数据库简介 被引量:2 2003年 本文以北京大学生物信息中心安装的3个国际著名基因组数据库GDB、GenoList和Ensembl为基础,介绍目前常用的基因组数据库,包括这些数据数据库的内容、数据格式、使用方法,以及用于构建上述数据库的数据库管理系统。 方刚 陈蕴佳 高歌 刘翟 何坤 吴昕 顾孝诚 罗静初关键词:微生物基因组 人类基因组 数据库系统 生物信息 斑头雁(Auser Indicus)氧合血红蛋白的结晶和X射线的初步分析 被引量:6 1990年 本文报道了以聚乙二醇溶液为沉淀剂培养斑头雁氧合血红蛋白晶体.经X射线旋进照相法分析确定,晶体属四方晶系,空间群为P4_22_12,晶胞参数a=b=81.5(?),c=106.4(?),α=β=γ=90V=706735.4(?)~3.每个不对称单位内包含半个四聚体分子. 华子千 朱红 卫新成 卢光莹 顾孝诚关键词:氧合血红蛋白 X线 水稻矮缩病毒基因组数据库的构建 被引量:17 2001年 二级数据库的构建是生物信息学新的重要领域。目前部分生物的基因组序列测定完成后 ,正在进行广泛而深入的结构和功能研究 ,使二级数据库的重要性显得日益突出。水稻矮缩病毒是一种在日本、中国和东南亚感染水稻的病原微生物 ,给农业生产造成很大损失。根据国际和国内对水稻矮缩病毒基因组的研究 ,利用已有的基因序列和结构、功能等方面的数据 ,以计算机网络为载体 ,参考国际通用数据库的格式 ,尝试建立一个简洁的、友好的通用性好而且专用性强的二级数据库 :水稻矮缩病毒基因组数据库。希望能够为研究普通水稻矮缩病毒的粒子结构、基因表达调控、致病机理和防治方法提供一个良好的工具 ,为从事水稻矮缩病理论和应用研究的工作者提供方便和帮助 。 王建民 罗静初 李毅 曲红 吴光耀 顾孝诚关键词:生物信息学 水稻矮缩病毒 基因组 抗菌多肽LC1的圆二色性和二级结构预测以及初步晶体学研究 被引量:1 1994年 由远紫外圆二色谱算得枯草杆菌A014(Bacillusspp.)所分泌的新型抗菌多肽LCI在水溶液中的各种构象含量为:α螺旋4.7—6.0%,β折叠67.2-72.8%,无规卷曲和转角21.1-28.1%。对多种方法的二级结构预测结果进行综合分析表明,LCI可能含有3个β转角,4个β折叠片段,仅含少量或不合α螺旋.晶体最大线度可达0.2×0.2×0.4mm,属于三方晶系。其六方H晶胞为a=b=51.21空间群为R32。 卢光莹 温晓刚 颜岩 李松林 华子千 顾孝诚 刘进元 陈章良关键词:抗菌多肽 圆二色 晶体学 BDCGrid:基于Globus的生物信息高性能计算网格系统 2011年 随着分子生物信息数据量高速增长,生物信息学面临着大规模、高通量、密集型计算的巨大挑战。为有效利用计算机资源,缩短高通量生物信息计算程序执行时间,我们基于Globus Toolkit网格中间件,实现了一个支持高通量生物数据计算的网格系统(Biological Data Computing Grid,简称BDCGrid)。BDCGrid计算网格系统模型可以有效整合中小型生物信息学实验室计算机资源,大大缩短高通量生物信息计算程序执行时间,为相关研究人员利用现有计算机资源处理大规模、高通量生物信息计算任务提供一种新的途径。 刘小川 赵树起 孔雷 刘小桥 王珺 李哲 顾孝诚 高歌关键词:生物信息学 网格计算 斑头雁(Anser indicus)高铁血红蛋白的晶体生长和初步的X-射线衍射研究 被引量:1 1989年 本文报导了斑头雁(Auser indicus)高铁血红蛋白的晶体生长和初步的晶体学研究.晶体的衍射分辨率为2.5A或更好,四方晶系.空间群为P4:2_12,晶胞参数为:a=b=80.8A,e=107.3A,V=700523A^3.每个晶胞中含4个四聚体分子,每个不对称单位中含半个四聚体分子. 卢光莹 毛春虹 卫新成 华子千 顾孝诚关键词:血红蛋白 晶体 X-射线 α-淀粉酶抑制剂AAI的核磁共振氢谱谱峰归属及结构分析 被引量:10 2000年 α -淀粉酶抑制剂AAI(α -AmylaseInhibitor)是从墨西哥苋属植物Amaranthushypochondriacus种子中提取的由32个氨基酸残基组成的多肽。它能强烈地抑制几种昆虫幼虫的α -淀粉酶活性 ,而不抑制人及哺乳类动物的α -淀粉酶活性。使用核磁共振方法收集了AAI的二维氢谱谱图 ,完成了全部主链和绝大部分侧链质子共振峰的序列归属 ,并利用X -PLOR软件计算出AAI的三维结构。AAI由三股反平行 β-折叠片与三对二硫键组成抑制剂胱氨酸结模体(inhibitorcystine -knotmotif)结构,与来自虎纹捕鸟蛛的神经毒素HWTX -I和凝集素SHL -I及其它来源的多种小分子活性多肽的结构类似 ,但它们的生物活力各不相同 ,表明该模体适用于结构功能关系的比较研究和作为蛋白质工程活力改造的结构骨架 (scaffold)。AAI对昆虫α -淀粉酶具有专一活性 ,可用于通过转基因技术来赋予植物抗虫活性。 邓鹏翅 吕善运 罗静初 Sandor Pongor 刘修才 曲红 梁宋平 韩汝珊 顾孝诚关键词:Α-淀粉酶抑制剂 核磁共振 作物 抗虫 一种预测达菲类药物用药安全性的方法 本发明提供了一种预测达菲类药物用药安全性的方法:通过测定受试者唾液酸酶蛋白家族Neu2蛋白基因Arg41Gln单核苷酸多态性位点的基因型,预测受试者对达菲类药物副作用的敏感性:对于该SNP位点的基因型为A/A的个体,达菲... 魏丽萍 李川昀 叶志强 贺权源 于泉 张武学 孙颖 罗静初 顾孝诚 郑晓峰文献传递 多粘菌素-B的溶液构象研究 被引量:2 1997年 利用核磁共振技术对多粘菌素-B在溶液中的构象进行测定。多粘菌素-B的全部质子信号及3JHNα均得到归属和确认。大部分存在于环肽及侧链的分子间NOE得到归属。 袁越 刘修才 顾孝诚关键词:核磁共振