刘朋
- 作品数：2 被引量：16H指数：2
- 供职机构：华中师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 索科线虫RAPD反应条件优化被引量：2
- 2006年
- 以中华卵索线虫为材料，研究索科线虫DNA的提取以及对RAPD的影响因素，包括模板DNA、Mg^2＋、dNTP、引物和Taq聚合酶浓度等，探索最佳反应条件，构建了适于索科线虫RAPD分析的稳定的反应体系．25pL反应体系中，含模板DNA20～40ng，10×PCR缓冲液2．5μL，MgCl2 2．0mmol／L，dNTP150 μmol／L，引物0．3μmol／L，Taq聚合酶1U．实验证明，在对索科线虫进行RAPD分析时，采用优化的反应条件，规范实验操作，使用同厂家同批次的试剂，宴验结果就会具有很好的重复性和稳定性．
- 徐芬王国秀查玉平刘朋曹文博
- 关键词：索科线虫RAPD
- 五种索科线虫RAPD亲缘关系分析被引量：15
- 2005年
- 采用RAPD技术构建了索科线虫4属5种的指纹图谱.从47个引物中筛选出12个稳定性好、多态性高的引物,共扩增出161条谱带,其中150条谱带具遗传多态性,占93.17%.所获片段长度大小为200～3 200 bp,单个引物扩增的条带数在11～16之间,平均为13.42条.采用RAPDistance软件及MEGA程序,计算Nei氏相似系数和遗传距离,建立UPGMA和NJ聚类图,两个聚类图拓扑结构相同,将5种索科线虫分为两大分支:同属于蚊幼寄生罗索属线虫的食蚊罗索线虫(Romanomermis culicivorax)与武昌罗索线虫(R. wuchangensis)亲缘关系最近,先聚在一起,再与同翅目(Homoptera)寄生长沙多索线虫(Agamermis changshaensis)聚为一支;鳞翅目(Lepidoptera)寄生中华卵索线虫(Ovomermis sinensis)和同翅目寄生两索属线虫(Amphimermis sp.)亲缘关系较近,两者聚为一支.5种索线虫属内种间的遗传距离较小,食蚊罗索线虫与武昌罗索线虫之间遗传距离仅为0.1789;而属间遗传距离较大,在0.4471～0.5488之间.上述结果表明:RAPD技术可以应用于索科线虫亲缘关系的分析,能够反映出不同线虫间的遗传差距,从而成功地进行属、种的分类及进化问题研究.
- 徐芬王国秀查玉平刘朋曹文博刘绪生
- 关键词：昆虫病原线虫索科RAPD亲缘关系
