杜晓芬
- 作品数：12 被引量：34H指数：4
- 供职机构：山西省农业科学院更多>>
- 发文基金：山西省青年科技研究基金国家现代农业产业技术体系建设项目山西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 谷子突变体信息平台的构建被引量：1
- 2017年
- 为了实现基于网络的谷子突变体库的科学数据共享服务,利用ASP技术,结合Access数据库服务,构建谷子突变体信息数据共享中英文服务平台。通过该信息平台,可以为谷子遗传育种提供丰富的中间材料,为谷子新种质创制提供参考。
- 杨慧卿王军杜晓芬王智兰袁峰张林义彭书忠
- 关键词：谷子突变体信息平台中英文
- 谷子分蘖相关QTL定位及紧密连锁标记开发被引量：6
- 2018年
- 分蘖是与农作物产量相关的重要农艺性状之一,分蘖对于谷子产量的提高具有重要意义,但是目前谷子分蘖遗传分子机制还不清楚。利用简化基因组测序技术(RAD-seq),以2个F2群体(命名为Cross AJ和Cross HC)为研究对象,分别对2个F2群体的543个和131个单株及其亲本进行RAD-seq,利用MSTmap和Win QTLCart 2. 5软件进行遗传图谱构建和QTL分析,结果共鉴定出8个控制分蘖相关的QTL。其中,利用Cross AJ共鉴定了6个QTL,分别为qAJTN1、qAJTN5、qAJTN7-1、qAJTN7-2、qAJTN7-3和qAJTN9,可解释表型变异0. 7%～9. 8%;利用Cross HC群体共鉴定了2个QTL,分别为qHCTN5和qHCTN7,可解释表型变异1. 4%～8. 3%。在这8个QTL中,qAJTN1、qAJTN5、qAJTN7-2、qAJTN9和qHCTN5为该研究新鉴定的位点,其余3个QTL(qAJTN7-1、qAJTN7-3和qHCTN7)与前人研究结果相一致。另外,通过将亲本的测序结果与参考基因组进行比对,搜索插入缺失位点InDel(Insertion-deletion),新开发了谷子分蘖相关QTL(qAJTN7-3和qHCTN7)紧密相关的InDel标记。结果为谷子分蘖机制的研究奠定一定基础,所开发的分子标记对于分蘖型谷子的分子标记辅助育种具有重要意义。
- 杜晓芬王军李云飞王智兰袁国保杜国华韩芳彭建祥张文娜蔡伟袁峰崔巨多郭二虎邹洪锋张林义彭书忠
- 关键词：谷子分蘖QTL定位
- 谷子高光效栽培模式研究被引量：2
- 2017年
- 谷子是山西省重要的杂粮作物,其较低的光合效率是限制谷子产量和推广面积的重要因素之一,提高谷子的光能利用率对于提高谷子产量具有关键的作用。本文通过分析长农35在不同行距、行向下对谷子成穗数和产量的影响,得出了谷子南偏西23.5°宽窄行种植的优势行向和行距,为生产实践提供理论依据。
- 袁峰王军杨慧卿王智兰杜晓芬张林义彭书忠
- 关键词：谷子高光效宽窄行
- 基于PCR技术的谷子分子标记遗传图谱构建被引量：5
- 2014年
- 【目的】构建一张基于PCR技术的谷子分子标记遗传图谱。【方法】以谷子高146A和K103杂交自交F2分离群体为作图群体,以分布于谷子9条染色体上的81个SSR标记为主要参考标记,采用来自谷子、水稻、珍珠粟和高羊茅的SSR、STS、SNP、SV和ACGM标记共1 733个,在亲本间筛选多态性标记,并进一步在F2群体间进行验证,利用MAPMAKER VERSION 3.0软件进行连锁分析,采用MapDraw V2软件绘制遗传连锁图谱。【结果】构建了一张包含192个不同类型分子标记的谷子遗传图谱,新定位标记33个,其中32个来自谷子,另1个来自珍珠粟。遗传图谱包含9个连锁群,覆盖基因组全长2 082.5 cM,连锁群长度介于119.5—475.2 cM,平均长度231.39 cM,标记间平均距离10.85 cM,每个连锁群上的标记数介于10—37个。部分连锁群上标记存在偏分离现象,在定位的192个标记中,共有36个标记发生偏分离,占图谱总标记的18.75%,其中,在LG2、LG6和LG7上分别聚集分布了10、15和7个偏分离标记,出现了偏分离热点区域,而在LG1、LG4、LG5和LG8上仅有零星分布,LG3和LG9上则没有偏分离标记。对来自不同作物的分子标记在谷子上的可转移性分析发现,来自谷子的1 235个PCR标记中有205个标记在双亲及其F2群体间有多态性,多态率为16.60%,而来自珍珠粟、高羊茅和水稻的498个PCR标记,在该群体上仅发现1个多态性标记。【结论】利用不同物种中的分子标记构建了一张覆盖基因组长度为2 082.5cM的谷子遗传连锁图谱,其分子标记主要来自于谷子。
- 王智兰王军袁峰杜晓芬杨慧卿郭二虎
- 关键词：谷子分子标记多态性
- 谷子条纹叶突变体wsl2的鉴定及候选基因分析被引量：7
- 2020年
- 谷子叶色突变体是探究叶绿体发育机制和C4光能利用率的理想材料之一。为了研究谷子叶色突变的分子机制,从谷子主推品种长农35号的甲基磺酸乙酯(EMS)诱变库中筛选鉴定到一个苗期条纹叶突变体wsl2,通过表型鉴定、遗传背景检测和遗传分析,同时利用MutMap方法快速精细定位突变基因,并根据突变位点开发共分离分子标记等方面对该突变体进行研究。结果表明,wsl2在苗期表现为条纹叶表型,但从拔节期开始恢复为正常叶片表型;wsl2与野生型遗传背景相同且wsl2受一个隐性核基因控制;MutMap精细定位的关联区间内包含9个非同义突变基因,其中,Seita.9G561800是一个编码与叶绿体相关的PsbP蛋白基因,含有6个外显子和5个内含子,在第1外显子77 bp处发生G/T碱基突变,导致一个精氨酸(R)突变成亮氨酸(L)。根据突变碱基设计了dCAPS标记MRI498-1(Cac8Ⅰ)和共分离标记MRI501-3,进一步验证了wsl2突变体的候选基因突变位点。研究鉴定了一个新的条纹叶突变体wsl2,对PsbP基因光合作用反应机制的进一步研究奠定了理论基础,丰富了谷子叶色突变体资源,同时验证了MutMap方法克隆谷子突变基因的有效性。
- 王秋兰王智兰韩芳杜晓芬连世超韩康妮周雪李慧娟张林义王军郭二虎
- 关键词：谷子
- 一种谷子温敏叶色SiWSL1基因及其应用
- 本发明公开了一种谷子温敏叶色SiWSL1基因及其应用。本发明提供了蛋白质，是如下(A1)或(A2)或(A3)：(A1)由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质；(A2)在序列2所示的蛋白质的N端和/或C端连接标签得到...
- 王军王智兰杜晓芬韩康妮连世超李禹欣张林义
- 谷子花药颜色基因Siac1的精细定位被引量：1
- 2019年
- 为从分子水平上揭示谷子花药颜色性状的遗传基础,以‘E1005’为母本,‘品资39号’为父本构建F2分离群体,利用集团分离分析法(BSA)结合隐性群体分析法(RCA),对谷子花药颜色基因Siac1进行精细定位。遗传分析表明,F2植株黄色花药与白色花药分离比例符合3:1的孟德尔分离规律,表明白色花药性状由一对隐性核基因控制。利用SSR和SV标记将Siac1初定位于第VI染色体上标记GSA07025和GSA07037之间约282 kb的区间内。进一步利用根据亲本重测序结果新开发的InDel标记,最终将Siac1精细定位于标记MRI579和MRI583之间约94.7 kb区段内。生物信息学分析表明,该区间共有10个开放阅读框,初步推测Seita.6G227100、Seita.6G227200、Seita.6G227300和Seita.6G227900为花药颜色性状的候选基因。本研究为克隆Siac1基因、解析花药颜色发育机制奠定了一定基础。
- 韩康妮杜晓芬王智兰连世超王军王军
- 关键词：谷子分子标记
- 一种谷子SiARGOS基因的克隆、表达分析及功能标记的开发方法
- 本发明公开了一种谷子SiARGOS基因的克隆、表达分析及功能标记的开发方法，克隆了谷子SiARGOS基因编码区及其启动子序列，序列分析发现SiARGOS基因开放阅读框342bp，编码114个氨基酸，其蛋白具有农作物ARG...
- 王军王智兰杜晓芬杨慧卿王玉文郭二虎袁峰田岗李会霞刘鑫张林义彭书忠
- 文献传递
- 一种与谷子米色连锁的SNP标记、引物及应用
- 本发明公开了一种与谷子米色连锁的SNP标记，包括HC‑06‑436标记和HC‑06‑250标记，所述HC‑06‑436标记位于谷子第六染色体第34024436bp位，所述HC‑06‑250标记位于谷子第六染色体第3403...
- 王军杨慧卿杜国华王智兰杜晓芬邹洪锋郭二虎彭建祥雍建朋韩芳蔡伟夏秋菊李云飞袁峰倪雪梅张林义彭书忠
- 谷子SiARGOS1的克隆、表达分析和功能标记开发被引量：1
- 2017年
- 【目的】从谷子中分离受激素诱导表达、参与器官大小控制的拟南芥ARGOS(Auxin-regulated gene involved in organ size)基因家族的同源基因,进行生物信息学分析,明确其在不同组织器官及其受植物激素诱导的表达模式,分析基因编码区及其启动子序列差异,开发功能标记,为谷子产量性状相关基因的改良提供依据。【方法】通过对已有ARGOS蛋白保守结构域进行BLAST,明确谷子ARGOS家族成员数目并进行蛋白序列分析,采用同源克隆方法获得谷子ARGOS家族成员之一——SiARGOS1编码区及其启动子序列,用生物信息学方法分析SiARGOS1启动子的顺式作用元件,通过实时荧光定量PCR分析该基因在谷子各器官中以及不同植物激素条件下的诱导表达模式,利用基因编码区及启动子序列的SNP和插入缺失序列开发分子标记,同时利用85份谷子品种的穗重(panicle weight,PW)、穗粒重(grain weight,GW)和千粒重(thousand-grain weight,TGW)等产量性状数据进行基因型间的差异显著性分析,挖掘用于检测该基因与谷子产量性状相关优异等位变异的功能标记。【结果】获得6个谷子ARGOS家族成员,均具有典型的保守OSR(organ size related)结构域,包含2个跨膜螺旋结构和1个高度保守富含亮氨酸区域,克隆了与拟南芥AtARGOS同源的家族成员之一——SiARGOS1编码区及其启动子序列,该基因位于谷子第8染色体上,开放阅读框为342 bp,无内含子,编码113个氨基酸,启动子区域为2 109 bp,含有与生长素、乙烯、茉莉酸和赤霉素等多种植物激素调控有关的元件。表达分析发现,SiARGOS1在谷子根、茎、叶和穗等器官中均有表达,在根中表达量最高,其次为茎和叶,穗中表达量最低。SiARGOS1对生长素吲哚乙酸(indole-3-acetic acid,IAA)不敏感,但受乙烯利(ethephon,ETH)上调表达。不同基因型谷子SiARGOS1序列分析发现,SiARGOS1编码区151 bp(起始密码子83 bp)处存在1个SNP(C/G),�
- 王智兰杜晓芬王军杨慧卿王兴春郭二虎王玉文袁峰田岗刘鑫王秋兰李会霞张林义彭书忠
- 关键词：谷子SI启动子
