王小红
- 作品数:1 被引量:14H指数:1
- 供职机构:北京大学第一医院更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 常见皮肤癣菌18S~28S rDNA ITS序列同源性分析被引量:14
- 2006年
- 目的分析常见皮肤癣菌内转录间隔区(ITS,包括5.8S rDNA)序列,探讨快速、准确鉴定菌种的方法;建立种系发生进化树,了解其亲缘关系。方法用形态学方法对16株皮肤癣菌做初步鉴定,PCR扩增各菌ITS区,扩增产物纯化、DNA测序,做序列比对、分析,建立系统发生树。结果检测了16株菌,包括未见文献报道的猪小孢子菌的ITS全序列,其中11株菌与形态学结果一致,1株菌鉴定为金孢子菌,4株菌通过这两种方法均不能确定。在基于ITS序列构建的N-J系统树中,将皮肤癣菌分成3组,这与依形态学所分的3属不同。结论ITS区序列分析法具有高度的准确性、敏感性,检测范围广泛、快速,可应用于菌种鉴定。但也有局限性,应与形态学鉴定相互补充。ITS区序列为今后更加合理地分类和命名皮肤癣菌提供了参考依据。
- 王强冀朝辉李厚敏张丽娟刘伟万哲王小红王端礼李若瑜
- 关键词:皮肤癣菌系统发生树