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与棉花显性无腺体基因Gl2e紧密连锁的SSR标记及其应用: 本发明公开了与棉花显性无腺体基因Gl2e紧密连锁的SSR标记及其应用。所述SSR标记为BS4、BS5和BS6；所述SSR标记BS4的引物对BS4由序列表序列1和序列2所示的单链...; 宋国立陆才瑞程海亮黄娟邹长松张友平王巧连余道乾姜鹏飞杨文翠; 文献传递

与亚洲棉光籽突变体DPL972中光籽基因紧密连锁的SSR分子标记的开发与应用（英文）: 2016年; 对棉纤维相关性状基因的克隆及遗传分析可为阐明纤维形成机制奠定良好基础。以野生型材料DPL971及其光籽突变体DPL972为亲本构建F2群体,其中光籽与毛籽性状分离比符合3∶1,表明突变体DPL972中的光籽基因为显性单基因(将其命名为Ga Fzl)。结合棉花基因组数据,合成1567对SSR(Simple sequence repeat)引物,覆盖了A组13条染色体,标记多态性分析和群体连锁分析发现在染色体A08上存在15对与光籽基因Ga Fzl连锁的标记,其中最近的标记为SSR82,遗传距离为6.6 c M。本实验完成了Ga Fzl基因的染色体初步定位,开发了15个与其连锁的SSR标记,为下一步图位克隆奠定了基础。; 冯晓旭邹长松陆才瑞程海亮张友平Mkulama A P Mtawa王巧连宋国立; 关键词：GA SSR 连锁图

棉花纤维伸长相关基因GhCML17-1的克隆与结构分析: 钙调蛋白（Camlmodulin,CaM）,又称钙调素,是植物细胞中胞内Ca最重要的多功能感受体蛋白,属于EF手形家族钙结合蛋白。植物Ca激活CaM并进一步结合CaM靶蛋白后,产生结构上的变化从而行使相应的植物功能。本研...; 刘媛媛左东云程海亮张友平吕丽敏刘珂王巧连宋国立; 关键词：棉花纤维伸长

陆地棉纤维发育起始相关基因GhGTP1的克隆与结构分析: 棉花纤维是由棉花胚珠外表皮细胞分化发育而成的,但是目前对棉花纤维细胞分化起始的调控机理并不清楚。本研究通过RNA-seq分析了陆地棉徐州142的转录水平,发现了1个Rab GTPases在纤维发育起始时期高效表达,可能参...; 左东云程海亮张友平吕丽敏刘珂王巧连宋国立; 关键词：陆地棉信号传递

基于10个棉花腺体相关材料转录组的EST-SSR标记开发被引量：5: 2015年; 棉花是重要的经济作物,但有毒棉酚的存在,使棉子得不到充分的利用,所以低酚棉育种是棉花育种的重要内容之一。色素腺体是棉酚的储存器官,开发功能型分子标记,加密棉花遗传图谱对色素腺体和其他重要性状相关基因的研究具有重要作用。本试验以10个有腺体和无腺体材料转录组信息为基础开发EST-SSR标记,在12895条1 kb以上的Unigene中共搜索到1546个SSR位点,发生频率和平均距离分别是11.99%和15.99 kb。得到的EST-SSR中,二碱基和三碱基重复是主要的重复类型,分别占30.85%和48.97%,AT/TA和GAA/CTT分别是二碱基和三碱基的优势重复类型。对长度≥20 bp的SSR共设计合成了56对引物,在这10个材料中进行检测,能扩增出清晰条带的有38对,占67.86%,其中呈多态性的有9对,占23.68%,并对其所在的Unigene功能和表达量进行了初步分析。本研究进一步证明了棉花EST-SSR标记开发的可行性,并且为棉花高密度遗传图谱和腺体相关基因的研究奠定了基础。; 程海亮陆才瑞邹长松余道乾姜鹏飞杨文翠张友平王巧连宋国立; 关键词：棉花色素腺体

棉花纤维伸长期基因GhEXPA1d的克隆及表达分析: 棉花是最重要的经济作物之一,棉纤维是已知纤维素纯度最高的天然资源之一,在世界纺织工业中具有重要的经济地位。同时,棉花也是研究单细胞伸长机制的一种模式作物,棉纤维是由胚珠外珠被的单个表皮细胞发育而来,发育过程大致分为4个时...; 吕丽敏左冬云张友平程海亮王巧连宋国立; 关键词：棉花

亚洲棉纤维发育时期的转录组分析: 棉花纤维是纺织工业中主要的天然纺织原料,棉花纤维和短绒的起始发育研究一直是棉花研究中的热点。本研究对亚洲棉DPL971及其光籽突变体DPL972开花后1、3和5 d的胚珠进行转录组测序并进行差异表达基因(Differen...; 冯晓旭程海亮左东云张友平王巧连吕丽敏刘珂李文倩刘媛媛宋国立; 关键词：棉花转录组测序差异表达基因

棉花功能基因组研究进展被引量：3: 2017年; 棉花是重要的经济作物。近年来棉花功能基因组研究发展迅速,高通量测序技术应用于棉花研究,二倍体和四倍体棉花基因组测序陆续完成,棉花全基因组重测序及关联分析相继涌现,大量的棉花功能基因被分离鉴定。本文回顾了棉花功能基因组研究的历程,重点介绍了棉花基因组测序和棉花栽培品种全基因组关联分析相关研究成果,并总结了棉花纤维和腺体发育中的关键功能基因及棉花抗旱、抗盐碱等功能基因研究进展,为全面了解棉花重要农艺性状形成的遗传基础和棉花遗传改良提供理论参考。; 左东云叶武威程海亮王德龙张友平王俊娟王巧连陈修贵陆许可宋国立; 关键词：棉花基因组测序纤维发育腺体抗逆

棉花无腺体近等基因系差异表达基因分析被引量：4: 2015年; 为了揭示棉花腺体发育的分子机制,本研究利用RNA-Seq对棉花无腺体性状近等基因系Z12/Z12YW的幼嫩叶片进行转录组测序,寻找差异表达基因。转录组测序结果表明,与有腺体棉Z12相比,无腺体棉Z12YW中共有306个基因表达发生变化,其中282个基因下调,24个基因上调。差异表达基因GO(Gene ontology)功能注释显示,细胞组分、胞外基质组分的功能变化以及细胞杀伤生物学过程在腺体形成过程中发挥重要作用;COG(Cluster of orthologous groups)功能和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路显著性富集发现,棉酚等萜烯物质的合成主要受甲羟戊酸途径上游基因的表达调控。此外,本研究共筛选到13个差异表达转录因子,可能在腺体发育和棉酚合成过程中发挥关键作用。; 姜鹏飞陆才瑞邹长松程海亮杨文翠冯晓旭张友平王巧连宋国立; 关键词：腺体近等基因系转录组

棉花MYC基因家族鉴定及在色素腺体发育中的表达分析: MYC转录因子在拟南芥中参与植株的发育调控、逆境响应和次生代谢物的合成等。棉花中MYC转录因子也被证实有相似的功能,其中,已经报道了2个MYC转录因子与棉花色素腺体发育相关。本研究对棉花MYC转录因子进行全基因组鉴定,分...; 程海亮左东云张友平冯晓旭吕丽敏王巧连宋国立; 关键词：棉花色素腺体 MYC 基因表达

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张友平