杜芳
- 作品数：22 被引量：58H指数：4
- 供职机构：北京林业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金北京市科技新星计划国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学文化科学自动化与计算机技术更多>>
- 叶绿体基因编辑技术:进展与展望
- 2024年
- 叶绿体是植物进行光合作用,参与多个代谢途径和免疫反应的重要场所。叶绿体基因组非常小,只有100多个基因,但对植物生长发育具有重要意义。本文首先总结了叶绿体的起源、结构与功能及叶绿体基因组研究的最新进展。其次,梳理了同源重组、碱基编辑两种叶绿体基因编辑技术,重点介绍了碱基编辑技术中的胞嘧啶碱基编辑器和腺嘌呤碱基编辑器,认为相较于传统的同源重组技术,碱基编辑技术可以针对特定靶位点进行定向修饰,单次选择就能获得同质转化植株,且可以不用保留外源DNA片段,实现了非转基因的基因编辑。最后展望了叶绿体基因编辑技术的广阔发展前景,以期促进精准高效的叶绿体基因编辑工具开发,为研究叶绿体基因功能以及加速对叶绿体的合理利用开辟新思路。
- 原明星尹康权李俄仁措尚海忠杜芳
- 关键词：叶绿体叶绿体基因组同源重组
- 一种应用8重PCR进行胡杨群体遗传分析和亲子鉴定的方法
- 本发明公开了一种应用8重PCR进行胡杨群体遗传分析和亲子鉴定的方法。在本发明的方法中，使用一组引物进行多重PCR反应，同时对8个位点进行扩增，所述引物由序列为SEQ ID NO：1-SEQ ID NO：8的引物组成。本发...
- 杜芳徐放冯思思
- 文献传递
- FPX在制备促进植物生根产品中的用途
- 本发明公开了FPX在制备促进植物生根产品中的用途。本发明提供了FPX在制备促进植物生根产品中的用途。本发明还提供了一种促进植物生根产品，包括上述的FPX和培养基。所述植物为苜蓿。本发明FPX在低浓度时能促进根的生长，尤其...
- 尹康权李思扬赵雯萱杜芳
- 植物微卫星分子标记中无效等位基因检测方法的比较与应用被引量：1
- 2014年
- 微卫星分子标记因其开发便捷、突变率高、成本较低等优势一直被广泛应用于群体遗传学、保护生物学和分子生态学研究中。近年来二代测序技术、多重PCR方法以及毛细管电泳等新技术的发展和完善,极大地提高了微卫星分子标记的开发和使用效率并降低了使用成本。但是在开展微卫星实验过程中普遍存在的无效等位基因(或称为哑等位基因,null alleles)会对研究结果造成偏差,是微卫星分子标记应用中的最大缺陷之一。然而,长期以来无效等位基因的检测问题并未受到研究者的足够重视。本文通过对国内外相关文献查阅,在对无效等位基因有一个较为深入和全面认识的基础上,对目前无效等位基因的主要检测方法进行全面的介绍和深入的比较。最后,结合研究实例总结出植物微卫星分子标记研究中无效等位基因检测的有效办法。
- 侯盟杜芳
- 关键词：微卫星
- 鸡爪槭种下分类群的DNA条形码筛选被引量：9
- 2015年
- 槭属鸡爪槭（Acer palmatum Thunb.）是北温带广泛分布的一类园艺观赏树种,由于频繁的种内杂交渐渗导致其种下分类群的形态性状特征趋同,致使传统的形态学分类难以准确鉴定,新兴的DNA条形码技术为快速、准确的鉴定鸡爪槭种下分类群提供了新的思路。本研究采用5个叶绿体DNA片段（rpl16、psbA-trnH、trnL-trnF、rbcL、matK）和核基因组ITS片段,运用PWG-distance和Tree-Building两种方法对鸡爪槭的8个分类群共32个个体进行DNA条形码分析。结果显示,单个叶绿体基因组片段（分辨率为0%~25%）或核rDNA ITS片段（12.5%）的分辨率较低,不同组合的叶绿体DNA片段（0%~62.5%）、叶绿体片段与核rDNA ITS片段（12.5%~50%）的分辨率则相对较高。其中,rpl16＋psbA-trnH＋trnL-trnF片段组合的分辨率最高（62.5%）,较为符合DNA条形码快速、准确鉴定的要求,因此建议将其作为鸡爪槭种下分类群鉴定的DNA条形码。
- 高健孟婉姮杜芳李俊清
- 关键词：鸡爪槭DNA条形码
- 通过遗传多样性探讨极小种群野生植物的致濒机理及保护策略:以裸子植物为例被引量：17
- 2020年
- 遗传多样性是生物多样性的重要组成部分,然而由于资源的过度开发利用和生境的破碎化影响了物种的遗传多样性,甚至威胁到物种的生存适应性和生物多样性。极小种群野生植物是亟待保护的国家重点保护濒危植物,遗传多样性研究对揭示极小种群致濒机理及保护策略具有重要意义。生境破碎化会造成物种遗传多样性降低、种群间分化增加、基因流减少等,使种群濒危。但在某些物种中,繁殖特征、进化历史等生物和生态因素的不同也可能造成近期生境破碎化后遗传效应的延迟。裸子植物进化历史悠久,包含许多孑遗物种,由于生活史周期长,遭受生境破碎化后可能短期内显示不出遗传效应的改变,但长期很难恢复。本文以裸子植物为例综述了濒危植物的遗传多样性研究的案例,探讨了濒危裸子植物应对环境恶化的维持机制、致濒因素和保护方案,旨在说明通过遗传多样性研究充分认识极小种群致濒机理对高效保护极小种群野生植物的重要性。
- 苏金源燕语李冲李丹杜芳
- 关键词：裸子植物
- 胡杨SSR标记12重PCR反应体系优化研究
- 胡杨(Populus euphratica Oliv)是第三纪的孓遗植物,常生长在沙漠中,它耐寒、耐旱、耐盐碱、抗风沙,有很强的生命力,是重要的抗盐碱和干旱的树种之一。筛选和开发有效的SSR引物可为更深入的研究群体的遗传...
- 徐放赵舒邬荣领杜芳
- 遗传多样性保护:国家公园自然生态系统原真性和完整性基础被引量：2
- 2023年
- 遗传多样性探究物种内个体间DNA水平的变异,是生物多样性的重要组成部分。遗传多样性直接影响着物种的适应和生态系统的功能,因此2010年和2020年缔结的联合国生物多样性公约均将保护遗传多样性列为生物多样性保护工作的目标之一,并呼吁在2030年联合国生物多样性公约行动方案中将遗传多样性的监测与保护列为工作重点。然而,遗传多样性保护属于种群遗传学的范畴,理论性较高,导致关于遗传多样性保护的研究多停留在学术层面,在保护实施过程中具体应用较少。一般来说资源的过度开发和生境破碎化等干扰方式会造成物种遗传多样性降低、种群间分化增加、基因流减少等遗传后果,使种群濒危进而影响到生态系统的原真性和完整性,但是在复杂生态系统中物种的繁殖特征、进化历史及生态因子也发生着作用。系统的回顾、梳理了1996年迄今我国重点保护野生树木的遗传多样性研究及保护案例(238篇论文,150种重点保护野生树木),指出了我国目前遗传多样性研究与物种保护割裂的现状。目前正处于我国国家公园建设的关键阶段,结合国际研究前沿,提出遗传多样性保护是国家公园自然生态系统原真性和完整性的基础。在国家公园建设中应该开展基于DNA序列的遗传多样性监测并重视有效种群大小等重要遗传多样性指标在具体物种保护过程中的应用。
- 杜芳
- 关键词：种群遗传学物种保护国家公园
- 一种优化的胡杨高效多重(12重)SSR体系(英文)被引量：1
- 2014年
- 微卫星多重PCR方法是一种非常经济并且高通量的基因分型技术。本研究在耐干旱、盐碱的胡杨(Populus euphratica)中开发出一套荧光标记的12重微卫星工作体系。该体系包含12条表达序列标签微卫星(EST-SSR)引物,其中3条设计于NCBI,另外9条设计于二代的转录组序列。利用该多重微卫星体系可在单一的PCR反应体系中成功扩增出12条表达序列标签的微卫星短序列片段,并在胡杨的3个自然居群96个个体中对该体系进行了验证,结果显示该体系具有很高的稳定性及多样性。同时,在杨属的5个派7个种中对其通用性进行了检验,显示这些引物具有很高的通用性,成功扩增率为79%。本研究中提供的12重多重PCR结合本实验已经公开发表的2个8重体系对揭示胡杨及其他杨树的进化历史具有重要的作用。最后,本研究认为引物的选择,扩增效率,哑等位基因的检测是多重体系开发过程中最为关键的步骤。
- 徐放赵舒邬荣领杜芳
- 关键词：多重PCR基因分型
- 一种基于候选基因研究树木生态适应的方法——以川滇高山栎为例被引量：2
- 2018年
- 应用二代测序技术,结合对川滇高山栎的生态适应研究,介绍一种基于候选基因的研究方法,其优点:对受选择基因进行研究,可以得到最为直接的证据来描述物种的生态适应模式;利用标签序列,混合所有个体样本进行二代测序,极大地节约了建立测序文库的成本,降低了研究费用,可使研究者利用多个候选基因对大量样本开展实验和研究,更好地阐明物种生态适应的机制.
- 王玉垚张悦方剑火杜芳
- 关键词：生态适应候选基因川滇高山栎
