武成艳
- 作品数：9 被引量：8H指数：2
- 供职机构：包头师范学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学理学医药卫生更多>>
- Based on the Feature Extraction of CTD and Secondary Structure to Predict Chloroplast Protein Locations
- The chloroplast is a type of plant specific subcellular organelle,which is the site of photosynthesis and part...
- 武成艳李前忠
- 文献传递
- 基于拓扑二级结构和阅读框识别不同细胞器基因组的非编码RNA
- 随着功能基因组学的飞速发展，对非编码转录产物功能的研究引起越来越多人的关注。人类基因组中超过98％的序列为非蛋白质编码DNA，这些非编码DNA序列大部分会转录成RNA，并且直接以RNA的形式发挥功能，参与基因的转录调控、...
- 武成艳
- 关键词：开放阅读框
- 亥姆霍兹线圈磁场测量实验数据处理方法改进被引量：1
- 2019年
- 亥姆赫兹线圈磁场测量实验是电磁学实验教学中的重要内容,是研究霍尔效应法测量磁场的重要手段。该文利用Origin9.1软件的误差分析、绘图、拟合等功能处理“亥姆霍兹线圈磁场测量”实验数据,最终得到载流圆线圈轴线上磁场的分布,加深对毕奥—萨伐尔定律的理解,为实验提供一种高精确度的数据处理方法。
- 武成艳
- 关键词：亥姆霍兹线圈ORIGIN数据处理
- 不同细胞器基因组转录的ncRNA的序列特征分析和识别被引量：1
- 2015年
- 统计分析了不同细胞器基因组转录的非编码RNAs(non-coding RNAs,ncRNAs)的kmer频数、约化后的碱基组分、结构-序列模式中三联体偏好.并以上述三种特征提取方法分别构成特征向量表示ncRNA序列,利用支持向量机,对四类细胞器基因组转录的ncRNAs的序列进行识别.分析两种不同的碱基约化方式发现,嘌呤/嘧啶约化(MN约化)更能反应不同细胞器基因组转录的ncRNAs的序列信息;考虑结构和碱基种类的结构-序列模式(stru-seq mode)中的三联体短片段(k=3),揭示出ncRNA与编码蛋白质的mRNA或蛋白质相互作用可能存在局域结构三联体偏好.在Jackknife检验下,预测总精度最高达到83.10%.采用不同参数的预测结果表明,结构-序列模式(stru-seq mode)中的短片段(k=3)结构有助于不同细胞器基因组转录的ncRNAs区别.
- 武成艳李前忠陈颖丽
- 关键词：非编码RNA
- 乳腺癌中hsa-miR-17-92基因簇及其旁系同源体的共调控作用
- 2016年
- hsa-miR-17-92基因簇高度保守,可以作为抑癌基因抑制乳腺癌细胞的增殖.包括2个旁系同源体:miR-106a-363和miR-106b-25基因簇,其序列高度相似,可能通过调控共同靶基因而具有相似的功能.探讨3个基因簇转录的15条microRNA的序列特征,以及共调控靶基因在人类乳腺正常和癌细胞系中的表达;并进一步就显著差异表达基因进行GO和Pathway(KEGG)分析.结果表明,超过75%(178/236)的共调控靶基因表达具有显著差异性,这些基因可能与生物体的细胞代谢、转录后调控、生物合成等多种生物学过程有关,参与细胞周期,癌症等信号通路.分析发现乳腺特异基因PTPN4在乳腺癌中的低表达影响蛋白磷酸化水平和细胞周期,SMAD4、CCND1和E2F1作为与细胞周期相关基因在细胞的G1期起重要作用,它们的低表达阻止细胞从G1期进入S期,从而抑制癌细胞的生长,起到抑癌作用.特别是,一方面基因簇调控CCND1和E2F1使其低表达,另一方面它们作为转录因子结合到基因簇的启动子区诱导基因簇表达,从而形成负反馈调控循环调控下游基因表达.
- 武成艳李前忠靳文曹艳妮
- 关键词：靶基因反馈网络
- 氮离子注入对蒙古黄芪多倍体诱导的影响被引量：2
- 2011年
- 利用二倍体蒙古黄芪种子为材料,以低能氮离子束为诱变源,将化学诱导与物理诱变相结合,探索出一套高效的多倍体诱导新方法。研究结果表明:氮离子注入种子后表现出明显的生物学效应;氮离子注入与秋水仙素联合诱导黄芪多倍体的效果很明显。氮离子注入剂量为2.6×1016 N+/cm2,秋水仙素浓度为100 mg.L-1,培养5 d诱导率最高为44.4%;氮离子注入剂量为5.2×1016 N+/cm2,秋水仙素浓度为150 mg.L-1,培养10 d的诱导率最高为46.2%;二者均高于对照组秋水仙素浓度为100 mg.L-1培养15 d的最高诱导率13.9%。利用细胞染色体计数鉴定多倍体为四倍体。
- 张利珍李前忠杨林源武成艳
- 关键词：蒙古黄芪氮离子注入秋水仙素多倍体诱导
- Noncoding RNA Identification based on Topology Secondary Structure and Reading Frame in Organelle Genome Level
- Non-coding RNA (ncRNA) genes make transcripts as same as the encoding genes,and ncRNAs directly function as RN...
- 武成艳赵建军李前忠
- N^+注入对蒙古黄芪多倍体生化指标的影响被引量：1
- 2011年
- 为了研究N+注入对蒙古黄芪多倍体生化指标的影响,采用培养基中添加秋水仙素的方法诱导多倍体,测定不同剂量N+注入的情况下,不同诱导时间内分化出的不定芽及二倍体和四倍体植株叶片的生化指标变化情况。结果表明:未注入组丙二醛(malonaldehyde,MDA)的含量,以及过氧化物酶(peroxidase,POD)、过氧化氢酶(catalase,CAT)和超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)的活性,随诱导时间的延长而增高,蛋白质含量随诱导时间的延长而降低,蛋白质含量与MDA含量呈负相关;注入组的生化指标在诱导时间内都有一定的波动,但总体趋势与未注入组一致;四倍体与二倍体相比较,四倍体的MDA含量及POD、CAT和SOD的活性都高于二倍体,而蛋白质含量却低于二倍体。说明离子束注入能使种子产生大量自由基,自由基的增加可导致MDA的产生,从而破坏蛋白质的合成,同时,N+注入又可诱发新的修复机制;四倍体植株受伤害程度更大,但四倍体植株的自我保护能力高于二倍体植株,即四倍体植株的抗逆性较二倍体增强。
- 张利珍李前忠杨林源武成艳
- 关键词：蒙古黄芪秋水仙素生化指标
- 人类乳腺癌异常甲基化基因分析被引量：3
- 2016年
- 运用Illumina HumanMethylation27BeadChip数据,利用sam函数中Delta值与FDR值的关系,选取最佳Delta值,识别人类乳腺肿瘤组织和正常乳腺组织中显著差异甲基化基因.分析这些差异甲基化基因在人类各条染色体的分布,进一步通过这些差异甲基化基因对肿瘤样本和正常样本进行双向非监督聚类分析.接着,利用limma包计算乳腺肿瘤组织样本和正常乳腺组织样本中差异表达基因,对既发生差异甲基化又同时发生差异表达的基因,进行GO生物分子功能富集分析.结果发现低甲基化的基因皆与蛋白质及核苷酸结合功能相关,高甲基化基因则主要富集到与运输载体活性相关的分子功能上.这些研究结果,有助于我们从基因功能角度进一步理解乳腺癌发生的原因,对乳腺癌的预后和临床诊断起到帮助作用.
- 靳文李前忠苏文霞武成艳
- 关键词：乳腺癌DNA甲基化差异表达基因
