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P2X7基因多态性与结核病易感性的关联性研究——Meta分析被引量：4: 2010年; 目前，许多病例对照研究对P2X7基因多态性与结核易感性的关联性进行了探讨，但由于入选病例有限，造成了这些研究结果的不可信。本文应用主题词和关键词“gene”、“P2X7”、“tuberculosis”和“结核”，检索了1998年1月至2009年8月MEDLINE、PUBMED、OVID及CBMdisc数据库发表的有关文献，并辅以文献追溯的方法，手工检索相关的参考文献，试图通过Meta分析，探讨人群P2X7基因2个多态性位点与结核易感性的关系。结果显示，与1513A和-762T等位基因相比，P2胛基因上1513C和一762C多态性等位基因的合并OR值分别为1．43（95％CI为1．21—1．69；P〈0．0001）和0．88（95％CI为0．65—1．20；P=0．43）。研究结果提示，人群P2胛基因1513多态性位点与结核易感性相关，而一762多态性位点与结核易感性不相关。; 顾艺肖婧孙琳焦伟伟冯卫星吴喜蓉申阿东; 关键词：META分析 P2X7 多态性结核

干扰素γ释放试验和结核菌素皮肤试验诊断筛查儿童结核病和潜伏结核感染研究Meta分析被引量：10: 2012年; 目的探讨干扰素γ释放试验和结核菌素皮肤试验(PPD)在儿童结核病和潜伏结核感染诊断中的价值。方法检索1990年1月至2011年2月在PUBMED、MEDLINE、OVID、CNKI等数据库发表的有关文献,并追查相关文献的参考文献,对文献按照诊断试验的纳入标准进行筛选。采用敏感度和特异度作为诊断价值的评价指标。采用Meta-Disc1.4软件进行Meta分析。结果 QuantiFERON-TB GoldIn-Tube在确诊结核病和(或)临床诊断结核病患儿中的汇总敏感度为67%,在对照儿童中汇总特异度为91%;T-SPOT.TB在确诊结核病和(或)临床诊断结核病患儿中的汇总敏感度为57%,在对照儿童中汇总特异度为88%;PPD试验在确诊结核病和(或)临床诊断结核病患儿中的汇总敏感度为70%,在对照儿童中汇总特异度为43%。结论 PPD试验因受卡介苗接种的影响,特异度较低;而干扰素γ释放试验因不受卡介苗接种的影响而具有很高的特异度。干扰素γ释放试验可以有效筛查儿童潜伏结核感染,特别是在有卡介苗接种史及活动性密切接触史儿童中。; 孙琳尹青琴苗青肖婧焦伟伟吴喜蓉冯卫星申晨申丹刘芳申阿东; 关键词：META 干扰素Γ 结核儿童

区分儿童潜伏结核感染者和活动性结核病患者的蛋白特征谱: 本发明公开了区分儿童潜伏结核感染者和活动性结核病患者的蛋白特征谱。本发明所提供的特征谱中差异表达的蛋白质为TSSK4、LOX、RASGRF2、XRCC4、PAMR1、ZMYM5、ATP11A、SF3B1、NKD2、OCR...; 申阿东李洁琼孙琳徐放綦辉肖婧申晨焦伟伟郭雅洁王咏红佟月娟; 文献传递

重组活化因子1基因突变所致不同临床表型严重联合免疫缺陷病3例分析被引量：6: 2014年; 目的总结分析重组活化因子(RAG)1基因突变所致严重联合免疫缺陷病(SCID)的不同临床及免疫特点。方法 2012年9月至2013年4月首都医科大学附属北京儿童医院收治的3例SCID患儿,经RAG1基因突变分析获得明确诊断,经HLA配型方法除外母体T淋巴细胞经胎盘输注,经细胞遗传学方法判断淋巴细胞增殖功能。结果病例1表型为经典SCID,病例2表型为Omenn综合征,病例3为伴反复自身免疫性溶血性贫血的非典型SCID。RAG1基因突变分析结果,病例1复合杂合位点1:1870 C>T,Arg624Cys;位点2:2005 G>A,Glu669Lys。位点1为已报道突变,位点2为新发现的错义突变。病例2复合杂合位点1:994 C>T,Arg332X;位点2:1439 G>A,Ser480Asn。均为新发现突变。病例3纯合2095 C>T,R699W,为已报道突变。前两例患儿均于自动出院后不久夭折,后者仍处于反复住院治疗自身免疫性溶血性贫血过程中。结论 RAG1突变所致SCID临床表现有差异,经典SCID和Omenn综合征预后严重,需移植治疗。; 贺建新王荃朱光华赵宇红肖婧刘秀云徐保平申昆玲江载芳; 关键词：严重联合免疫缺陷病自身免疫性溶血性贫血

Ag85B表位多肽对体外单核细胞增殖影响的研究: 2012年; 目的通过观察Ag85B不同表位多肽对人外周血单个核细胞(PBMC)增殖的影响,筛选出增殖活性较强的Ag85B表位多肽,为制备结核新疫苗提供理论基础。方法采用的实验方法为人工预测Ag85B的表位,并合成多肽。将不同表位多肽体外刺激人外周血单个核细胞,利用CCK-8法测定单核细胞同一时相的吸光值,计算各自的增殖指数,并与BCG、Ag85B抗原等作对比。结果①Ag85B表位多肽组的OD450值及增殖指数均高于阴性对照组,且高于传统抗原BCG;②5条多肽中,28aa多肽的OD450值及增殖指数最高,且显著高于BCG(POD450=0.001<0.01,P增殖指数=0.013<0.05),但低于PHA;③28aa多肽的OD450值及增殖指数明显低于Ag85B,差异有统计学意义(POD450=P增殖指数=0.000<0.01)。结论预测的Ag85B表位多肽抗原具有一定的免疫原性,其中28aa多肽可作为优势表位多肽,但是否可用于表位多肽疫苗候选抗原还需进一步研究。; 申丹肖婧孙琳焦伟伟苗青申晨徐放吴喜蓉申阿东; 关键词：AG85B 人外周血单个核细胞增殖

单核苷多态性rs1800796位点在检测ATDH易感性中的应用: 本发明公开了单核苷多态性rs1800796位点在检测ATDH易感性中的应用。本发明首先保护用于检测rs1800796 SNP位点的核苷酸的物质在制备产品中的应用。本发明还保护一种产品，含有用于检测rs1800796 SN...; 申阿东申晨綦辉汤海京李颖佳孙琳焦伟伟杨旭李勤静田志刚李洁琼肖婧徐放王咏红郭雅洁; 文献传递

CRISPR-Cas9系统在细菌学领域内的应用研究进展: 2017年; 1987年，Ishino等在大肠杆菌中首次发现了一段独特的被非重复序列所间隔的“串联重复序列”。2002年，Jansen等将此特点的序列命名为成簇规律间隔短回文重复序列（clustered regularlyinterspaced short palindromic repeats，CRISPRs）.2012年，Jinek等首次体外证实CRISPR相关蛋白9（CRISPR-associated protein 9，Cas9）能够切割DNA，使得CRISPR-Cas9基因编辑技术取得了突破性进展。; 肖婧张宗德; 关键词：串联重复序列细菌学 PROTEIN 大肠杆菌相关蛋白

结核分枝杆菌PPE家族蛋白CD4^+ T细胞泛宿主表位的计算机预测及其γ干扰素释放实验研究: 2016年; 目的利用计算机预测结核分枝杆菌PPE家族蛋白MHC-II类分子限制性CD4+T细胞泛宿主表位,并利用γ干扰素释放实验进行体外验证。方法利用网上数据库提取PPE家族全部蛋白序列。使用生物信息学软件包括Signal P4.1,Secretome P 2.0,DAS和Net MHCII2.2等分析工具预测、筛选出MHC-II类分子限制性CD4+T细胞泛宿主表位。最后利用γ干扰素释放实验进行合成肽段的体外实验验证其刺激激活CD4+T细胞的能力。结果发现了34个泛宿主表位多肽,其中21个来自于PPE8蛋白,其余来自于PPE12、PPE21和PPE62蛋白。γ干扰素释放实验并未发现预测出的泛宿主表位多肽可刺激大量的CD4+T淋巴细胞产生IFN-γ的分泌,但来自于PPE8蛋白的两个泛宿主表位多肽可刺激少量的CD4+T淋巴细胞产生反应。结论这些计算机预测出来的泛宿主表位多肽,尤其是来自PPE8蛋白的泛宿主表位多肽,可能是下一步亚单位疫苗或诊断性标志物的重要候选抗原。但仍需进一步扩大样本量进行验证。; 肖婧焦伟伟孙琳申晨李洁琼綦辉徐放郭雅洁申阿东; 关键词：结核分枝杆菌 Γ干扰素

结核分枝杆菌特异性效应T细胞斑点数鉴别儿童活动性结核病与潜伏结核感染的价值被引量：11: 2013年; 目的通过γ干扰素释放试验探讨结核分枝杆菌特异性效应T细胞斑点数(简称T细胞斑点数)鉴别儿童活动性结核病(TB)与潜伏结核感染(LTBI)的价值。方法纳入T细胞斑点试验(T.SPOT.TB)阳性且未经过抗结核治疗的93例活动性TB(重症TB27例,非重症TB66例)和47例LTBI儿童,根据T.SPOT.TB结果对T细胞斑点数进行比较分析。结果活动性TB组T细胞斑点数中位数84(6～710)显著高于LTBI组17(6～316),P=0.000;非重症TB患儿的T细胞斑点数中位数为99(6～710),显著高于重症TB的44(6～268),P=0.011,也显著高于LTBI组17(6～316),P=0.000;重症TB儿童T细胞斑点数中位数高于LTBI组儿童(44vs17),但差异无统计学意义(P=0.084),T细胞斑点数分布在活动性TB、重症TB、非重症TB和LTBI之间均有较大范围重叠。受试者工作特征曲线分析显示以T细胞斑点数43.5作为区分活动性TB与LTBI的最佳界值,其敏感度与特异度分别为69.9%和70.2%。结论 T细胞斑点数在活动性TB尤其是非重症TB患儿显著高于LTBI儿童;T细胞斑点数的数量可反映体内的结核分枝杆菌负荷,但不能用于区分儿童活动性TB与LTBI。; 田建岭刘晓灵孙琳焦伟伟肖婧尹青琴吴喜蓉郭雅洁韩锐李勤静申阿东; 关键词：活动性结核病潜伏结核感染 Γ干扰素释放试验

汉族儿童细胞色素P450单核苷酸多态性及其代谢表型分布的研究被引量：2: 2010年; 目的了解中国汉族人群细胞色素P450(CYP450)重要单核苷酸多态性(SNPs)及其代谢表型的分布情况,丰富相应位点中国汉族人群的遗传学数据库。方法选择首都医科大学附属北京儿童医院300例中国汉族分析人群的DNA样本,应用实时PCR基因分型法结合测序,对CYP450 6个亚型的8个SNPs位点:CYP2C9 1075A>C、CYP2C19 636G>A、CYP2C19 681G>A/C、CYP2D6 100C>T、CYP2E1-1053C>T、CYP2E1 7632T>A、CYP3A4 878 T>C和CYP3A56986A>G的基因型进行检测,计算基因型和等位基因频率;同时初步获得CYP450 6个亚型代谢表型的分布特点。结果①中国汉族分析人群CYP2C19 681G>A/C、CYP2D6 100C>T和CYP3A5 6986A>G位点野生型杂合子的基因型频率较高,分别为46.3%、47.0%和43.7%,其突变等位基因的频率也较高,分别为58.8%、34.5%和63.5%;CYP2C9 1075A>C、CYP2C19 636G>A、CYP2E1-1053C>T、CYP2E1 7632T>A和CYP3A4 878T>C位点野生型纯合子的基因型频率较高,分别为100%、89.3%、61.3%、58.3%和98.0%。②中国汉族分析人群CYP450代谢表型的分布情况为CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6、CYP2E1、CYP3A4和CYP3A5的快代谢型和超快代谢型比例分别为100%,83.3%,64.7%,95.0%,100%和58.3%;CYP2C19、CYP2D6和CYP3A5中间代谢型和慢代谢型比例分别为11.4%、35.3%和41.7%。结论CYP2D6 100C>T、CYP2C19 681G>A/C和CYP3A5 6986A>G位点在中国汉族人群中的突变频率较高,且其中间代谢型和慢代谢型比例较高,可为后续优化SNPs入选位点和指导临床个体化用药提供依据。; 肖婧顾艺孙琳苗青焦伟伟冯卫星吴喜蓉郭雅洁申阿东; 关键词：细胞色素P450 单核苷酸多态性代谢表型实时聚合酶链反应中国汉族人群

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肖婧

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