胡自民 作品数:25 被引量:44 H指数:4 供职机构: 中国科学院海洋研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 中国科学院知识创新工程重要方向项目 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 环境科学与工程 医药卫生 更多>>
海萝抗氧化酶系与失水响应因子表达模式分析 2019年 潮间带红藻海萝(Gloiopeltis furcata)对失水胁迫具有很强的耐受能力。为探索海萝周期性失水过程中的响应机制,本研究在24 h内设计了两次连续的失水-复水循环处理,测定了海萝抗氧化酶活力的变化情况。同时,利用转录组测序技术,结合荧光定量PCR方法(qRT-RCR),对海萝失水响应基因的转录表达进行了验证。结果表明:海萝转录组共组装到32681条基因。与对照组相比,处理组共表达了7161条差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。KEGG分析显示,DEGs分布在代谢、环境信息加工、有机体系统、遗传信息加工、细胞进程等方面。海萝抗氧化酶活力测定发现,抗氧化能力对海萝响应失水胁迫十分重要。过氧化氢酶(CAT)、硫氧还蛋白还原酶(TrxR)、超氧化物歧化酶(SOD)参与抗氧化过程,其中CAT酶活力对海萝抵抗失水胁迫尤为重要。此外,qRT-PCR结果显示,海萝中渗透调节物质红藻糖苷合成的相关基因(GfUGPase、GfGK、GfGPDH)只对初次失水处理有正响应。而热激蛋白70基因(GfHSP70)、碳酸酐酶基因(GfCA)、MYB蛋白编码基因(GfMYB)以及谷胱甘肽S转移酶基因(GfGST)在两次失水过程中其转录水平均有上调表达,它们也参与了海萝失水响应机制。 刘顺 胡自民 张全胜 张全胜关键词:失水 抗氧化酶 红藻糖苷 转录 龙须菜选育品系和野生型及相关种鉴定的方法 本发明涉及对中国沿海经济海藻龙须菜选育品系及野生型和相关种进行鉴定的方法,即龙须菜rDNA ITS区ITS1和5.8S整个序列的确定,及RAPD与ISSR种内和种间特异指纹图谱的建立。ITS区DNA序列获得的步骤为:1)... 段德麟 李文红 胡自民文献传递 中国近海重要生态建群红藻真江蓠的群体遗传多样性 被引量:6 2016年 真江蓠(Gracilaria vermiculophylla)是中国近海潮间带生态系统结构组成和功能维持的重要支撑物种,但有关其群体遗传结构和多样性分布模式的研究目前仍较缺乏。本研究利用线粒体cox1序列对我国近海19个真江蓠地理群体进行了系统发育和群体遗传分析。461个长度为641 bp的cox1序列片段共含有21个多态位点,产生15个单倍型。基于cox1序列的系统进化分析、单倍型分析和主成分分析显示,19个真江蓠群体分化为南北两个类群,其中浙江嵊泗以北的13个群体形成北方类群,福建厦门以南的6个群体形成南方类群。遗传距离和分子方差分析显示真江蓠南北各类群内的遗传分化较小,南北类群间的遗传分化达到亚种水平。南北类群间的差异是我国近海真江蓠群体遗传变异的主要来源。 刘若愚 孙忠民 姚建亭 胡自民 段德麟关键词:GRACILARIA 系统发育 核酸分析技术在红藻分子系统学研究中的应用 被引量:4 2005年 在红藻的分子系统学研究中,核酸分子数据的获得和应用日益显得重要,因为核酸序列是进化的重要单元,通常以点突变来体现种间/种内的差异,因此能反映物种进化过程的频率。目前,在红藻分子系统学研究中,核酸标记技术有:限制性片段长度多态性(RFLP)、随即扩增多态性DNA(RAPD)、扩增片段长度多态性(AFLP)和简单重复序列间扩增(ISSR);相关核酸分析技术涉及到的序列有:内转录间隔区(ITS)、18S和26S rRNA,核糖体大、小亚基(LSU和SSU),Rubisco基因及大、小亚基。其在红藻品种鉴定、种群遗传、分类和系统进化的研究中起重要的作用。 曾晓起 胡自民 段德麟关键词:红藻 分子标记 核酸分析 分子系统学 经济海藻紫菜种质资源鉴定的方法及部分DNA序列 本发明涉及紫菜种质资源的鉴定,即经济海藻紫菜种质资源鉴定的方法及鉴定中所用的中国沿海紫菜栽培种DNA序列;步骤为:1)总DNA提取;2)以上步骤提取的DNA为模板,对总DNA进行PCR扩增反应;3)PCR产物纯化;4)纯... 段德麟 胡自民 赫英俊文献传递 一种鉴定不同养殖海区的经济海藻裙带菜配子体的方法 本发明涉及来自中国不同养殖海区的经济海藻裙带菜(Undariapinnatifida)配子体Rubisco基因及两侧大小亚基(rbcL和rbcS)部分DNA序列的获得及利用该序列对不同来源的裙带菜配子体进行鉴定的方法。本... 段德麟 王迪 胡自民文献传递 中国近海外来囊藻(Colpomenia peregrina)种群遗传多样性研究 被引量:3 2020年 外来囊藻(Colpomeniaperegrina)是一种在潮间带分布广泛的褐藻,它能附着在牡蛎壳上进行跨海区扩散,因而是研究生物多样性变动和生物地理格局形成的良好模型。外来囊藻在中国沿海虽有分布,但关于其种群遗传多样性和分化研究的报道尚为空白。本研究采集了中国近海13个外来囊藻种群样本。通过扩增301条线粒体cox3序列,发现了26个单倍型;通过重建单倍型网络图和基于最大似然法与贝叶斯法重建系统进化树,发现外来囊藻种内遗传多样性较高, 13个种群划分为3个遗传世系,其中浙江南麂列岛的7个种群组成遗传世系A,辽宁和山东的样本则分化为遗传世系B和C。中国近海外来囊藻的这种种群遗传结构可能源于更新世末次盛冰期黄渤海、东海边缘海的环境变化和海平面的大幅下降。遗传世系A具有的较高单倍型多样性,其原因可能是南麂列岛独特的地理位置和潮间带环境的共同作用。 宋小含 孙忠民 胡自民 段德麟一种鉴定不同养殖海区的经济海藻裙带菜配子体的方法 本发明涉及来自中国不同养殖海区的经济海藻裙带菜(Undariapinnatifida)配子体Rubisco基因及两侧大小亚基(rbcL和rbcS)部分DNA序列的获得及利用该序列对不同来源的裙带菜配子体进行鉴定的方法。本... 段德麟 王迪 胡自民文献传递 角叉菜属分子分类、系统发育及居群遗传多样性研究 本论文利用核糖体18S rRNA、internal transcribed spacer(ITS)、线粒体cox2-3间区序列及inter simple sequence repeat(ISSR}标记方法对红藻角叉菜属的... 胡自民关键词:角叉菜 系统发育 居群遗传多样性 文献传递 海洋植物谱系地理模式与遗传连通性研究进展 2021年 海洋植物谱系地理学虽然在国内受到的关注比较有限,但近年来的研究进展对了解环境变动如何影响物种的多样性结构、生态适应和进化潜力等亦提供了重要信息。本文首先对刊发海洋植物谱系地理研究最具代表性的两本国际期刊《Molecular Ecology》和《Journal of Biogeography》进行搜索和筛选,从研究团队的地域分布和研究对象的阶元等角度纵览全球范围内近20年间海洋植物谱系地理学研究的现状和特征。其后,本文从洋流如何驱动海洋植物谱系地理结构和多样性、入侵物种的种群遗传变异特征和路径重建、冰期避难所如何影响现今海洋植物遗传结构和地理变动、克隆繁殖和谱系多样化等四个方面概述了这一领域的主要成果进展。最后,本文还从岛屿地理模型、共生物种的谱系协同进化和高通量数据应用等三个方面对海洋植物谱系地理学的发展趋势进行了展望。 胡自民 杜玉群 梁延硕 钟凯乐 张杰关键词:海草