陈清清
- 作品数：3 被引量：4H指数：1
- 供职机构：北京林业大学更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家林业公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 杨树抗逆转录因子基因内SSR标记的开发被引量：3
- 2011年
- 利用直接测序法开发小叶杨抗逆转录因子基因内一套新的核基因组SSR标记。通过对3个抗逆转录因子共21个成员在36个小叶杨基因型个体中的序列比较分析后共检测到31个SSR多态性位点,SSR出现的频率为1/1916bp。在小叶杨自然群体中,SSR多态性位点的碱基重复呈现出2～5碱基形式,基元重复次数变异范围为3～20次,其中以二碱基重复的位点较多,占总数的51.6%。在此基础上,依据SSR位点两侧的保守序列,设计31对SSR位点PCR扩增引物对。利用设计的引物检测所开发的SSR位点在杨属内22个基因型个体中PCR扩增的有效性及SSR位点的保守性。PCR扩增结果显示,93.5%的SSR位点能够在杨属内至少4个派内有效扩增,每对引物组合可检测到SSR多样性位点数3～12个,平均6个。基于抗逆转录因子基因内开发的SSR标记位点为分子标记辅助小叶杨抗逆性状育种提供工具。
- 王保垒王博文陈清清李百炼张德强
- 关键词：杨树抗逆性状转录因子
- 小叶杨耐高温、低温基因的克隆与表达
- 以抗逆小叶杨优良无性系为材料，对其进行高温(42℃，6h)和低温(4℃，6h)处理，然后利用杨树全基因组表达谱芯片对其差异表达的基因进行了检测。通过对小叶杨低温表达谱分析，检测到有1085个基因响应低温胁迫，其表达倍数大...
- 陈清清
- 关键词：小叶杨基因芯片耐高温性能单核苷酸多态性克隆表达
- 杨树热激转录因子HsfA1d的克隆、表达及单核苷酸多态性分析被引量：1
- 2011年
- 利用RT-PCR方法,首次由小叶杨受热激胁迫后构建的cDNA文库中扩增获得一热激转录因子HsfA1d cDNA克隆,测序结果表明克隆的PsHsfA1d cDNA片段总长为2036bp,基因内部含有完整的开放阅读框架,大小为1449bp,可编码长度为482个氨基酸残基的蛋白质,所推导的蛋白质氨基酸序列在HSF DBD结构功能域与拟南芥AtHsfA1d和水稻OsHsfA1蛋白的相似性分别为86.3%和87.4%。组织特异性Realtime-PCR结果显示,PsHsfA1d主要在杨树叶片和根部组织中高丰度表达。非生物胁迫、激素及糖诱导表达表明,PsHsfA1d不仅受高温、干旱与盐诱导表达,还受到激素中GA_3与ABA,及葡萄糖与蔗糖信号的上调表达。组合利用MEGA4.0和DnaSP4.50.7软件对小叶杨36株基因型个体的PsHsfA1d序列进行比对和分析,共检测到207个单核苷酸多态性(SNP)位点,SNP频率为1/16bp,多样性指数π为0.00772。在编码区域,共检测到69个SNP位点,其中37个为同义突变,31个为错义突变,1个为无义突变;非同义突变与同义突变的比率0.132<1,推测在小叶杨物种演化过程中,纯化选择是该基因内同义SNP位点主要的进化驱动力。
- 赵杏郭琦陈清清李百炼张德强
- 关键词：小叶杨热胁迫
