龚达平
- 作品数：51 被引量：152H指数：7
- 供职机构：中国农业科学院烟草研究所更多>>
- 发文基金：中国烟草总公司科技项目国家高技术研究发展计划中国烟草总公司科技重大专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程自动化与计算机技术更多>>
- 烟草重要基因篇:1.烟草抗病相关基因被引量：6
- 2014年
- 烟草是重要的经济作物之一,也是研究植物与病害互作的主要模式生物.烟草病害种类泛多,对烟草危害较为严重的病害有黑胫病、赤星病、青枯病、烟草普通花叶病、黄瓜花叶病、马铃薯Y病毒等.化学药剂防治会引起环境污染、农药残留、烟叶安全性等问题,而培育烟草抗病新品种是解决这些问题的根本途径.烟草抗病相关基因或分子标记的获得可高效靶向加快培育烟草抗病新品种的步伐.
- 龚达平
- 关键词：烟草普通花叶病抗病相关基因病害种类化学药剂防治黄瓜花叶病
- 绒毛状烟草基因组中SSR位点的信息分析被引量：3
- 2011年
- 通过SSRFINDER软件搜索绒毛状烟草基因组DNA,设置条件是重复单元长度2~5 bp,重复次数10～60,共找到6 441个SSR位点,涉及5 227个Scaffold,SSR序列总长为303 963 bp,约占全基因组的0.12‰,即绒毛状烟草基因组中平均每400 kb会出现一个SSR位点。在所有SSR位点中,二、三碱基重复基元分别占总数的45.2%和49.6%,重复单元的重复次数10～20之间的SSR位点占总数的74.6%。
- 王卫锋晁江涛龚达平王鲁李凤霞陈雅琼孙玉合
- 关键词：简单重复序列基元
- 普通烟草茄尼基焦磷酸合酶基因NtSPS的克隆和表达分析被引量：2
- 2016年
- 为揭示烟草茄尼基焦磷酸合酶(Nicotiana tabacum solanesyl diphosphate synthase,NtSPS)在烟草茄尼醇生物合成中的作用,分离了烟草品种红花大金元茄尼醇生物合成关键基因NtSPS1和NtSPS2,并对其进行了序列比对、进化分析和亚细胞定位分析,研究了其在烟草植株不同器官的表达水平以及烟草植株不同器官的茄尼醇、叶绿素含量与NtSPS表达水平的相关性。结果表明,NtSPS1和NtSPS2开放读码框(ORF)大小分别为1209、1206 bp,分别编码402、401个氨基酸;NtSPS1和NtSPS2均存在2个保守的DDxxD结构域,这与NtSPS功能发挥相关;NtSPS1、NtSPS2与番茄SPS同源性较高,这与烟草、番茄均为茄科作物有关;NtSPS1、NtSPS2均定位于叶绿体中;烟草植株不同器官NtSPS1和NtSPS2表达水平排序为:叶>茎>根,这与茄尼醇、叶绿素在烟草植株中的分布规律一致。本研究可为NtSPS调控烟草茄尼醇生物合成机制的深入研究奠定基础。
- 闫宁赵韬智向德虎龚达平张洪博杜咏梅刘新民张忠锋刘艳华
- 关键词：烟草茄尼醇叶绿素
- 金属蛋白酶WS1A在调控植物叶绿体代谢中的应用
- 本发明公开了金属蛋白酶WS1A在调控植物叶绿体代谢中的应用。本发明WS1A蛋白质是如下a)或b)或c)或d)的蛋白质：a)氨基酸序列是序列5所示的蛋白质；b)在序列5所示的蛋白质的N端和/或C端连接标签得到的融合蛋白质；...
- 吴新儒刘贯山代常波龚达平屈旭
- 烟草腺毛分泌特性相关基因Nt‑te分子标记定位及获得方法与应用
- 本发明公开了烟草腺毛分泌特性相关基因Nt‑te分子标记定位及获得方法与应用。本发明利用腺毛分泌型烤烟K326与白肋烟突变体腺毛非分泌型TI1406构建K326×TI1406F<Sub>2</Sub>杂交群体、F<Sub>...
- 陈明丽龚达平郝俊杰孙榕解敏敏
- 烟草叶片全长cDNA文库构建及EST序列分析被引量：5
- 2012年
- 【目的】构建烟草叶片全长cDNA文库并测序,发掘与烟叶发育、代谢和抗逆相关的基因,为进一步研究功能基因奠定基础。【方法】以烟草苗期叶片为试验材料,利用改进的Cap-trapper法构建烟草叶片全长cDNA文库。利用测序技术获得大量的EST序列,采用生物信息分析手段,对所测EST进行拼接和功能注释。【结果】构建了烟草叶片的全长cDNA文库,该文库滴度为1.2×106pfu.mL-1,平均插入片段在1.4 kb左右。利用该文库测序了5 280个克隆,获得5 233条高质量表达序列标签(EST),序列拼接出3 922个单一基因;同源比对分析表明,89.7%的基因与已知功能基因具有较高的同源性,这些基因涉及细胞生长、信号转导、翻译合成、抗逆反应和能量代谢等功能;并详细鉴定了部分与烟碱合成和抗病相关的基因。【结论】通过Cap-trapper法成功构建了高质量的烟草幼苗叶片全长cDNA文库;大规模EST测序分析挖掘到大量与烟草幼苗叶片发育、抗逆、抗病、烟碱代谢相关的侯选基因。
- 龚达平解敏敏孙玉合
- 关键词：烟草全长CDNA文库表达序列标签功能注释
- 烟草细胞色素P450的基因组学分析被引量：19
- 2013年
- 细胞色素P450是一类含血红素的单加氧酶超基因家族,在植物多种代谢途径中起着重要作用。为了解烟草中的P450的种类和数量,文章将植物代表性P450蛋白质序列与烟草基因组序列比对,在烟草基因组中鉴定了44个P450家族共263个成员。将这些烟草P450基因与烟草表达序列标签(EST)比对,发现173个成员有EST证据。通过与拟南芥中已知的P450蛋白序列比较,分析了部分烟草P450蛋白序列的特征和二级结构。根据烟草基因芯片数据和部分基因的RT-PCR结果,发现73个烟草P450基因能够在不同的生长发育时期表达,其中部分基因具有组织特异性。这些研究结果为烟草P450基因功能的深入分析奠定了基础。
- 解敏敏龚达平李凤霞刘贯山孙玉合
- 关键词：烟草细胞色素P450基因芯片
- 一种根结线虫分子鉴定引物集及其制备方法与应用
- 本发明提供了一种根结线虫分子鉴定引物集，通过如下方法获得：利用预测的南方根结线虫蛋白序列分别与南方根结线虫基因组和北方根结线虫基因组比对，设置比对序列的相似度即percent参数为75，得到单拷贝基因；将单拷贝基因蛋白序...
- 龚达平解敏敏孙玉合晁江涛
- 文献传递
- 与白肋烟控制基因共分离的分子标记及其应用
- 本发明公开了与白肋烟控制基因共分离的分子标记及其应用。本发明从EMS诱变的普通烟草中鉴定了一个叶绿素代谢缺陷的白茎突变体，研究表明该突变体的两个隐性控制基因与白肋烟的白茎基因等位，随后对两个基因进行了图位克隆，并在此基础...
- 吴新儒刘贯山张兴伟龚达平薄韶云
- 文献传递
- 一种鉴定或辅助鉴定待测烟草黑胫病抗性的方法
- 本发明公开了一种鉴定或辅助鉴定待测烟草黑胫病抗性的方法。该方法包括如下步骤：检测待测烟草的基因型为基因型I还是基因型II，基因型I的烟草具有或疑似具有黑胫病抗性，基因型II的烟草不具有或疑似不具有黑胫病抗性。基因型I的烟...
- 龚达平陈明丽向小华高军平郝俊杰蒲文宣徐秀红解敏敏
- 文献传递
